肉眼是看不到的，只能藉助先進的科學儀器檢測，然後模擬出原子圖像等。
看下面這幅動圖
其實這是一部只有242幀的電影裡的畫面，名字叫做「男孩和他的寵物原子」。沒錯，你看到的那些點點，都是原子。比如那個寵物，是兩個點，實際上那是一氧化碳分子。
這是怎麼做到的呢？就是用掃描隧道顯微鏡完成的，這種顯微鏡除了開頭說的可以「觀察到原子」之外，還能去移動它們。
想要達到「觀察」的目的，重要原理就是量子力學中的「隧道效應」。當探針和物體表面足夠近時（納米級），導致兩者的波函數有疊加，就能讓電子從原子竄到探針，形成所謂的隧道電流，這時候你將探針進行平移，那麼由於表面結構的存在，接收的隧道電流大小就會變化（或者也可以保持電流大小不變，也即是讓探針的高度時刻變化），很顯然有了這數據，計算機就能模擬出排布圖像。