癌症微生物組的系統表徵為開發利用非人類、微生物衍生的分子來診斷人類重大疾病的技術提供了機會。而最近的一些研究表明微生物在一些癌症中扮演著關鍵的作用。
為此,來自加州大學聖地牙哥分校的Rob Knight帶領他的研究小組重新審視了癌症基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中未治療過的33種腫瘤樣品(總計18116個)的全基因組和全轉錄組測序數據,以尋找其中微生物的線索,研究人員在大多數癌症患者的血液和組織樣品中發現了獨特的微生物信號。
圖片來源:UC San Diego Health Sciences
儘管使用了非常嚴格的去汙染分析,放棄了高達92.3%的總序列數據,但研究人員發現當應用於Ia-IIc期的癌症患者或者沒有任何基因組改變(經兩個商用級的無細胞腫瘤DNA平臺檢測確認)的癌症患者時,這些TCGA血液特徵仍然具有預測性。
此外,研究人員還發現僅使用血漿來源的、無細胞的微生物核酸就可以區分來自健康的、無癌症的個體(n = 69)和來自多種癌症患者(前列腺癌、肺癌和黑色素瘤,n=100)的樣本。
該研究作者Miller-Montgomery表示:"這種對微生物種群隨癌症變化方式的新認識可能會開闢一條全新的治療途徑。我們現在知道微生物在那裡,但它們在做什麼呢?我們能否操縱或模仿這些微生物來治療癌症?"
研究人員表示這一潛在的基於微生物的腫瘤診斷工具值得進一步探索。(生物谷Bioon.com)
參考資料:
Rob Knight et al. Microbiome analyses of blood and tissues suggest cancer diagnostic approach. Nature. 2020. DOI https://doi.org/10.1038/s41586-020-2095-1
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