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血液和組織的微生物組分析可用於癌症診斷
血液和組織的微生物組分析可用於癌症診斷 作者：小柯機器人 發布時間：2020/3/22 21:14:03 美國加州大學聖地牙哥分校Rob Knight團隊在研究中取得進展。
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Nature:檢測血液中微生物DNA,癌症早診斷
如今，在美國加州大學聖地牙哥醫學院攻讀博士的Poore師從微生物組創新中心Rob Knight教授。他們聯合一個跨學科的合作小組共同開發了一種癌症診斷新方法，通過機器學習方法識別血液中存在的微生物DNA（細菌和病毒）特徵，就可以診斷是否患癌以及患有哪種癌症。
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前沿熱點：微生物組如何預測癌症發生和轉歸？
微生物組的失衡可能是許多健康問題（如癌症、糖尿病等）的「兇手」，而這意味著它或許能夠成為某些健康問題的晴雨表。今天，我們特別關注人體微生物組在預測癌症方面的進展，並介紹一家利用血液中的微生物特徵預測癌症的企業，希望本文能夠為相關的產業人士和各位讀者帶來一些啟發與幫助。
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新方向:血液中的微生物DNA就可預測癌症
癌症微生物組的系統表徵為開發利用非人類、微生物衍生的分子來診斷人類重大疾病的技術提供了機會。而最近的一些研究表明微生物在一些癌症中扮演著關鍵的作用。 為此，來自加州大學聖地牙哥分校的Rob Knight帶領他的研究小組重新審視了癌症基因組圖譜（The Cancer Genome Atlas，TCGA）中未治療過的33種腫瘤樣品（總計18116個）的全基因組和全轉錄組測序數據，以尋找其中微生物的線索，研究人員在大多數癌症患者的血液和組織樣品中發現了獨特的微生物信號。
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前沿最熱點:人工智慧+微生物組,真能預測死亡和癌症?
癌症的微生物信號：微生物可定植在各種組織中，這些微生物的 DNA 和 RNA 信號能在各類組織中發現，包括血液中（此處為了簡化僅展示 DNA）。 Rob Knight 團隊在以前研究的基礎上展示出微生物 DNA 和 RNA 能在腫瘤中檢測得到並可作為癌症標誌物。AI 模型可以利用來源於組織和血液樣本的核酸信號來區分癌症類型，以及區分健康個體和罹患某種癌症的個體。
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《細胞》:液體活檢再獲突破 全新生物標誌物可早期診斷多種癌症
頂尖學術期刊《細胞》近日在線發表了一項有關液體活檢的新研究，為癌症早期診斷帶來了潛在的全新方法。「一小管血液中就含有數十億EVP，這意味著，癌症患者有大量的癌症相關EVP可供臨床醫生用來診斷。」這項研究的共同通訊作者David Lyden教授介紹。癌症是全世界範圍內最主要的死亡原因之一，每年都奪走了無數人的生命。很多研究癌症的科學家希望能夠在癌症患者的早期階段就做出準確的診斷，幫助患者贏得治療時間。同時，這樣的檢查方法還要簡單方便，避免讓患者感到痛苦。
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研究：針對肝癌AFP陰性診斷和早期診斷血液非編碼RNA標誌物
最新研究表明，血液中exRNA有望成為液體活檢中生物標誌物新的組成部分。但是，目前exRNA作為生物標誌物的研究主要集中在小RNA如miRNA上。與小RNA測序數據相比，長RNA測序數據能提供更多的信息，包括更多的RNA種類、差異剪接、基因融合等信息。因此，整合血漿中的細胞外長RNA測序數據有望發現新的生物標誌物，進而應用到液體活檢中。
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研究人員檢測血液樣本中的生物標誌物來發現和診斷人體內的癌症
由於在早期發現癌症更容易成功地進行治療，因此癌症研究的主要目標是開發新的方法，以便在腫瘤開始擴散之前及早發現它們。一種正在研究的方法是液體活檢。這些測試旨在通過檢測血液樣本中的生物標誌物(腫瘤滲入血液的物質)來發現和診斷人體內的癌症。
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GRAIL與Cirina合併創建早期癌症診斷與篩查全球公司
Cirina是一家同樣專注於早期癌症診斷的公司，由來自香港中文大學（CUHK）盧煜明教授(Dennis Lo)及其同事趙慧君教授（Rossa Chiu）、陳君賜教授（Allen Chan），以及主要投資者德誠資本（Decheng Capital）共同創建。該公司的總部位於香港，研究團隊則分布於香港和加州南舊金山。
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用於人和寵物癌症早期診斷！首爾Viosys最新概念技術
領先的化合物半導體解決方案提供商首爾Viosys宣布，通過韓國蔚山大學科學家進行的臨床測試，該公司已開發出一種先進的概念技術，該技術利用紫外線LED Violeds用於寵物癌症早期診斷。根據首爾Viosys的研究小組稱，與人類一樣，寵物患癌症的機率很高，但在癌症的早期診斷上卻相當困難。因此，首爾Viosys正在開發一種不僅可以應用於寵物，也可以用於人類癌症診斷的技術。
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這家初創最先用微生物標記物進行癌症早篩
本輪融資將會主要用於該公司開發微生物組研究，進一步推動癌症檢查技術發展。還會用於開展研發工作以及建立符合《臨床實驗室改進法案修正案》(CLIA) 標準的實驗室。他們計劃在未來兩年內可以為臨床醫生提供這種全新的診斷方法。
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血液檢測中這個指標高是癌症的強有力指徵
如果在六個月內記錄第二次升高的血小板計數，被診斷癌症的數字上升為18％的男性和10％的女性。在一般人群中，約1％在任何一年發展為癌症。在分析的隊列中，由GP接受血液檢查的人群中，約有4％的男性和2％的婦女患有癌症。肺和結腸直腸癌更常經血小板增多症被診斷。三分之一的血小板增多症患者和肺或結腸直腸癌患者沒有其他症狀能表明他們患有癌症。
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TAP檢測癌症早期發現--破譯癌症密碼新技術
有專家表示，城鄉居民中癌症分布差異大，城市居民的食管癌、胃癌、肝癌、宮頸癌的死亡率低於農村，肺癌、乳腺癌、胰腺癌、結直腸癌等的死亡率則高於農村，這些可能與環境、生活方式和其他方面因素的影響有關。 不過，市民也大可不必「談癌色變」。
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新血液分析法可對癌症進行有效的早期檢測和定位
2020年亞洲ESMO虛擬大會上發表的研究結果(摘要LBA3)：ELSA-seq分析能夠在早期檢查出多種癌症類型，具有高度特異性，並能夠提供關於起源組織的信息。開展前瞻性、多中心、縱向PREDICT研究的目的是在早期無創性地鑑定多種癌症。癌症的早期檢測具有臨床益處，特別是對於那些沒有有效篩查方法的癌症類型。
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微生物組行業迎來黃金時代，這三大方向值得關注
在未來的五到十年內，微生物組相關產品的世界市場預計將翻一番，從 9.42 億美元增加到 17.3 億美元，目前已有十多種微生物組相關產品正在開發中。但是，值得注意的是，只有少數進入了後期階段。在 8 月 11 日的新聞發布會上，該公司被描述為「第一家將微生物生物標記用於診斷的早期癌症檢測公司」。在那篇文章中，他們還報告說，他們的技術表明，「僅使用血液和組織中的微生物核酸，就可以對不同類型的癌症進行高敏而具體的診斷。」
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腸道微生物組研究進展一覽
直到最近，人類微生物組仍然是診斷和治療疾病的新策略的未充分研究的目標。可能會破壞腸道微生物組的疾病的患病率正在增加，然而目前科學界對於定義「健康腸道」微生物組的定義尚無共識。文章作者Leigh A.作者發現，研究主要集中在膳食纖維的益處上，膳食纖維可作為腸道菌群的燃料，並且還發現，相比之下，蛋白質可促進微生物蛋白質的代謝以及可能存在於腸道中的潛在有害副產物的積累，從而增加了患病風險。 SMHS臨床研究副教授Scott Jackson表示：「這篇文章表明，我們目前使用的測量工具無法有效識別可作為健康和疾病的有力指標的微生物和分子特徵。」
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癌症生物標記物有助開發多種癌症血液檢測技術
2014年11月4日 訊 /生物谷BIOON/ --近日，在利物浦舉辦的國家癌症研究所癌症(NCRI，National Cancer Reasearch Institute)會議上，來自英國癌症研究中心的研究者表示，他們已經在癌症病人的血液中鑑別出了800多種生物標誌物，這或許可以幫助科學家們開發出單一的血液檢測技術來對多種癌症進行早期檢測
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新型表觀基因組平臺或有望實現對早期胰腺癌的準確診斷
近日，一篇刊登在國際雜誌Nature Communications上的研究報告中，來自藍星基因公司(Bluestar Genomics)等機構的科學家們通過研究證實了其所開發的新型平臺在檢測早期胰腺癌方面的強大潛力，這或有望幫助解決目前僅在美國每年都有超過6萬名被診斷為胰腺癌患者未得到及時診斷的需求
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血液檢驗法診斷痴呆症:助力痴呆症的早期診斷及有效防治方法的開發
另外，東麗株式會社報告稱，通過分析血液中的MicroRNA，可以鑑別發病頻度僅次於阿爾茨海默症的神經變性疾病中的路易小體型痴呆。名古屋大學的勝野等正在致力於一項在發病前捕捉到路易小體型痴呆的大規模研究，因此，本項目對有助於路易小體型痴呆早期診斷的生物標誌物的開發也備受期待。並且，東麗株式會社也在報告中稱，血液中MicroRNA分析，有可能對鑑別腦血管性痴呆以及預測從輕度認知障礙向痴呆的發展有所幫助[5]。
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產業大事：美國公司發起超大規模微生物組-腫瘤治療研究
其技術平臺基於大規模臨床試驗數據、先進的基因組學和免疫技術以及機器學習，來理解腸道菌群對病人預後和免疫系統功能的影響，繼而設計開發精準免疫療法和伴隨診斷方案。此次 ARGONAUT 研究預計招募 4000 名不同人種的晚期癌症患者，包括結直腸癌、胰腺癌、三陰性乳腺癌和非小細胞肺癌。