2.蛋白質的結構

2021-01-15 醫學資料優選

一、蛋白質的一級結構


蛋白質的一級結構指在蛋白質分子從N-端至C-端的胺基酸排列順序。


1.主要的化學鍵:肽鍵,有些還包括二硫鍵。 


2.一級結構的重要意義


①胺基酸百分組成、排列順序不同而組成多種多樣的蛋白質,並具有不同的生物學功能;②許多先天性疾病是由於某一重要蛋白一級結構改變而引起;③蛋白質一級結構中胺基酸排列順序是由遺傳密碼所決定,胺基酸排列順序的改變可能是鹼基順序改變所致;④一級結構是蛋白質空間構象和特異生物學功能的基礎,但不是決定蛋白質空間構象的唯一因素。

二、蛋白質二級結構


(一)定義


蛋白質的二級結構即蛋白質分子中某一段肽鏈的局部空間結構,即該段肽鏈主鏈骨架原子的相對空間位置,不涉及胺基酸殘基側鏈的構象 。所謂肽鏈主鏈骨架原子即氨基氮、α-碳原子和羰基氧3個原子。其主要的化學鍵是氫鍵,基本單位為肽單元。

(二)形式


1.a-螺旋 


①外觀:右手螺旋;②螺距:3.6個胺基酸、0.54nm;③R基團位於螺旋外側,可影響a-螺旋的形成。



2.β-摺疊


①肽段摺紙狀、鋸齒狀,相對伸展;②幾個肽段順向平行或反向平行;③R基團的位置:鋸齒的上下方。



α-螺旋和β-摺疊結構比較


(三)肽單元


參與肽鍵的6個原子Ca1、C、O、N、H、Ca2位於同一平面,此同一平面上的6個原子構成了所謂的肽單元。


(四)胺基酸側鏈基團R對二級結構的影響


1.R基團的電荷:酸性或鹼性R基團集中的區域,發生同種電荷的相互排斥。

2.R基團的大小:較大的R側鏈集中,不利於α-螺旋形成(空間位阻效應)。

3.R基團的形狀:脯氨酸,不利於α-螺旋形成。


(五)超二級結構與模體


二個或三個具有二級結構的肽段,在空間上相互接近,形成一個有規則的二級結構組合,被稱為超二級結構。二個或三個具有二級結構的肽段,在空間上相互接近,形成一個特殊的空間構象,稱為模體,模體是具有特殊功能的超二級結構。


三、多肽鏈進一步摺疊成蛋白質三級結構


(一)三級結構的定義與主要化學鍵


整條肽鏈中全部胺基酸殘基的相對空間位置,即肽鏈中所有原子在三維空間的排布位置,為蛋白質的三級結構。主要的化學鍵包括:疏水鍵(最重要)、離子鍵、氫鍵和範德華力等。

(二)結構域


分子量較大的蛋白質常可摺疊成多個結構較為緊密且穩定的區域,並各行其功能,稱為結構域。用限制性蛋白酶水解含多個結構域的蛋白質,常分解出獨立的結構域,而各結構域的構象可以基本不改變,並保持其功能。超二級結構則不具備這種特點。 因此,結構域也可看作是蛋白質的獨立摺疊單位,有較為獨立的三維空間結構。 

四、蛋白質的四級結構


許多功能性蛋白質分子含有2條或2條以上多肽鏈。每一條多肽鏈都有完整的三級結構,稱為蛋白質的亞基。蛋白質分子中各亞基的空間排布及亞基接觸部位的布局和相互作用,稱為蛋白質的四級結構。


亞基之間的結合主要是離子鍵(也稱鹽鍵)和氫鍵。由2個亞基組成的蛋白質四級結構中,若亞基分子結構相同,稱之為同二聚體,若亞基分子結構不同,則稱之為異二聚體。由兩個或兩個以上的亞基組成的蛋白質可稱為寡聚體蛋白質,也稱多聚體蛋白質。寡聚體含亞基較少,多聚體含亞基較多。

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  • 第一章蛋白質的結構與功能
    2、主要的化學鍵:肽鍵,有些蛋白質還包括二硫鍵。3、一級結構是蛋白質空間構象和特異生物學功能的基礎。二、蛋白質的二級結構1、定義:蛋白質分子中某一段肽鏈的局部空間結構,即該段肽鏈主鏈骨架原子的相對空間位置,並不涉及胺基酸殘基側鏈的構象2、主要的化學鍵:  氫鍵
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