《科學》雜誌說,科學家們在2006年完成了"數學史上的一個重要章節",這個 "有關三維空間抽象形狀"的問題終於被解決.龐加萊猜想屬於數學中的拓撲學分支,1904年由法國數學家龐加萊提出,即如果一個封閉空間中所有的封閉曲線都可以收縮成一點,那麼這個空間一定是三維圓球.百餘年來,數學家們為證明這一猜想付出了艱辛的努力.
被稱為數學隱士的俄羅斯數學家佩雷爾曼在證明龐加萊猜想過程中發揮了最為重要的作用,後來三個獨立的小組又進一步填補了佩雷爾曼證明中缺失的關鍵細節,百年難題終獲破解.《科學》雜誌稱,科學家們已經達成共識,認為這一猜想已經被證明.
《科學》雜誌評選出的其他９項進展分別為：
——從化石中提取ＤＮＡ（脫氧核糖核酸）：利用ＤＮＡ解碼和分析技術，研究人員從尼安德特人化石和猛獁化石中獲取了寶貴的遺傳信息。
——冰原在收縮：研究人員在２００６年記錄下了這一"令人不安"的趨勢，南極洲和格陵蘭島的冰原都在以前所未有的速度消失，流入海洋中。
——魚邁出的第一步：考古學家發現一種特殊的魚化石，這種魚能用胸鰭站立並"行走"，這可能是後來動物在陸地上用以行走的肢進化的開始。這種魚是有肢脊椎動物已知的最近親，為人類研究生命如何離開海洋登上陸地打開了一扇窗。
——隱身術的科學：雖然看上去一點也不像哈裡·波特的魔法鬥篷，但科學家今年製造的隱身裝置卻是第一個將物體在視覺上屏蔽起來的雛形裝置。它能引導入射的微波，使其既不反射、也沒有影子。
——黃斑變性患者的希望：研究"老年性黃斑變性"這種眼部疾病的專家們發現，一種名為ｒａｎｉｂｉｍｕｚａｂ的藥能顯著改善某些患者的視力，他們還找出了幾個使得人們易患該病的基因。
——生物多樣性是如何發生的：從沙灘小鼠到果蠅、蝴蝶，各種各樣的動物們幫助科學家發現了促成新物種進化的遺傳變化。
——顯微學的新前沿：２００６年，生物學家們藉助新的顯微技術，成功觀察到小於２００納米的細節，這為他們了解細胞和蛋白質的精細結構提供了更清晰的視野。
——製造記憶：２００６年的幾項發現讓神經學家更進一步地理解大腦是如何錄入新記憶的。科學家們認為，大腦負責加強神經元之間連接的"長時程增強"過程現在看來很可能是大腦記憶的基礎。
——新一類的小ＲＮＡ（核糖核酸）：科學家們發現了一類新的小ＲＮＡ分子，它們能夠關閉基因的表達，這類新分子被命名為"Ｐｉｗｉ－幹擾ＲＮＡ"。
另外，《科學》雜誌將韓國科學家黃禹錫的論文造假騙局列為"年度崩潰事件"。幹細胞研究人員黃禹錫及其合作者曾在《科學》雜誌發表兩篇有關幹細胞研究突破的重要論文，但他們製造的騙局在２００６年被徹底揭穿。《科學》雜誌說，本年度還查處了其他幾起科學研究領域涉及不端行為的事件。
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