科學家發現無可識別基因的最怪病毒—新聞—科學網

2020-12-01 科學網

Yaravirus（暗斑）感染阿米巴蟲。圖片來源：MICROSCOPY CENTER UFMG-BELO HORIZONTE

病毒是地球上最神秘的生物之一。它們是世界上最小的生命形式，由於沒有宿主就無法生存和繁殖，一些科學家質疑它們是否應該被視作生物。

現在，科學家發現了一種沒有可識別基因的病毒，使其成為所有已知病毒中最奇怪的一種。同時，另一個研究小組日前在幾十種動物的組織中發現了數千種新病毒。

巴西米納斯聯邦大學病毒學家Jonatas Abrahao是研究者之一，他表示，這些發現表明關於病毒「我們還有多少需要了解」。

Abrahao是在搜尋巨大病毒時有了這一發現的。細菌大小的巨大病毒於2003年首次在阿米巴蟲中被找到。在當地一個人工湖中，Abrahao和同事不僅發現了新的巨大病毒，還找到了另一種病毒，這種病毒體積小，不同於大多數感染阿米巴蟲的病毒，研究者將其命名為Yaravirus。

 Yaravirus的大小並不是唯一奇怪的地方。研究小組在bioRxiv預印本伺服器上報告說，當研究人員對其基因組進行測序時，發現沒有一個基因與之前科學家遇到的相匹配。

在廢水和呼吸系統中搜尋病毒的美國紐約大學的Elodie Ghedin對這種病毒並不感到驚訝。她說，汙水數據中超過95%的病毒「與資料庫中的參考基因組不匹配」。「我們似乎一直在發現新病毒。」

Abrahao說，一些Yaravirus的基因看起來像是巨型病毒的基因，但目前還不清楚這兩者間的關係。他和同事仍在研究這種新型病毒生活方式的其他方面。

當Abrahao追蹤病毒時，美國國立癌症研究所病毒學家Christopher Buck和研究生Michael Tisza正在撒下一張更廣闊的網。他們廣泛地在動物組織中尋找能使自身遺傳物質呈環形的病毒。所謂的環狀病毒包括乳頭瘤病毒，其中一種是可引起宮頸癌的人乳頭瘤病毒。

為找到這些病毒，研究人員從人類和其他動物的數十個組織樣本中分離出病毒顆粒，並對它們進行環狀基因組篩選。通過尋找一種能編碼病毒外殼的基因，研究人員確認了DNA屬於病毒。這些基因序列往往無法識別，但Tisza編寫了一個電腦程式，預測哪些基因最有可能編碼這些外殼的獨特褶皺。

研究小組總共發現了約2500種環狀DNA病毒，其中大約600種是新發現的。研究小組在eLife上報告說，目前還不清楚這些微生物對人類健康有什麼影響。但Buck 說，這些數據應該可以讓醫生和科學家能夠建立這種聯繫。Abrahao說，這種方法「是了解成百上千個病毒基因組分布的重要工具」。

這項新研究的意義不僅在於找出哪些病毒會導致疾病。一些人體內的病毒可能有助於人們保持健康，而另一些病毒則有助於循環利用必要的營養，保持生態系統的平穩運行。「沒有它們，我們無法生存。」未參與任何一項研究的加拿大溫哥華不列顛哥倫比亞大學環境病毒學家Curtis Suttle說：「發現和鑑定病毒有巨大的好處。」

相關論文信息：https://doi.org/10.1101/2020.01.28.923185

 https://doi.org/10.7554/eLife.51971

 

 

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