基因敲除 NCI-H1299細胞系助力肺癌研究-源井生物

2020-11-28 騰訊網

基因敲除NCI-H1299細胞系

NCI-H1299細胞系,也稱為H1299或CRL-5803,是衍生自淋巴結的人類非小細胞肺癌(NSCLC)穩轉細胞系與其他永生細胞系相似,H1299細胞可以無限分裂。另外,H1299細胞具有TP53基因的純合部分缺失,因此它們不表達會導致其增殖傾向的抑癌p53蛋白。此外,據報導,這些細胞可以分泌肽激素神經調節素B(NMB),但不能分泌胃泌素釋放肽(GRP)。具有這些有趣的特徵,NCI-H1299細胞成為涉及基因敲除,基因敲入和點突變的生物學領域的流行基因敲除細胞系。

肺癌是全世界男性和女性中第二大最普遍,最致命的惡性腫瘤。另一方面,NSCLC約佔肺癌的85%,這是全球癌症死亡的主要原因。由於H1299細胞系來源於淋巴結,因此這些細胞已被廣泛用於肺癌研究。表徵癌細胞中累積的遺傳改變對理解腫瘤生物學和指導藥物設計都具有重要意義。此外,它可能通過基因定製的癌症相關細胞,例如基因敲除的H1299細胞等,使有針對性癌症治療的患者受益。研究表明,NCI-H1299細胞系是一種穩定的細胞系,具有純合子敲除的功能。一些人類基因使用CRISPR-Cas9。因此,NCI-H1299的基因敲除技術通常用於治療肺癌。

應用:

紫杉醇降低了Rsf-1基因敲除NCI-H1299的遷移和增殖能力

紫杉醇是治療肺癌的經典藥物,但很容易引起耐藥性。因此,迫切需要克服耐藥性的新方法。 Rsf-1表達在肺癌中較高,並通過NF-κB途徑提高紫杉醇的耐受性。許多其他基因也與藥物抗性有關,例如影響凋亡和穩轉細胞周期的基因。

Chen及其同事使用CRISPR-Cas9技術敲除了肺癌細胞和異種移植小鼠中的Rsf-1,並通過調節NF-κB途徑的激活及其下遊表達來測試Rsf-1是否影響肺癌對紫杉醇的敏感性。基因。結果表明紫杉醇降低了Rsf-1-基因敲除的NCI-H1299和NCI-H460細胞遷移和增殖的能力,並增加了細胞凋亡。在患有源自Rsf-1基因敲除細胞的異種移植腫瘤的小鼠中,紫杉醇的抗腫瘤作用增強。因此,通過CRISPR-Cas9技術靶向Rsf-1也已成為治療肺癌的方法之一。

敲低PON2基因以研究NCI-H1299細胞系增殖

先前的研究表明,與相應的相鄰非腫瘤組織相比,NSCLC患者的癌組織中對氧合酶2(PON2)(一種具有抗氧化特性的內酯酶/芳基酯酶)的表達明顯增強。此外,增加的PON2表達可能有助於NSCLC細胞對經典的抗NSCLC治療藥物產生抗藥性。然而,研究人員發現,通過siRNA穩定降低PON2的表達可以減少NSCLC細胞(如NCI-H1299細胞)的增殖。

為了進一步闡明PON2在NSCLC穩轉細胞構建增殖中的作用,在NSCLC細胞系NCI-H1299中應用了兩個基因編輯系統TALEN和CRISPR / Cas。結果表明,Cas9表達是由外源性強力黴素以可逆方式誘導的,為研究基因表達的變化如何調控NSCLC細胞株增殖提供了一個平臺。

基因敲除切割效率不僅可以讓人具有生成人糖基化譜和建立調控記錄的能力,而且具有多種優勢,是一種特別有吸引力的重組蛋白表達系統。首先,它在穀氨酸上羧基化,在酪氨酸上硫酸化。第二,操作簡單,通過瞬時基因表達可以快速產生重組蛋白。第三,可用於穩定的重組蛋白生產。一些研究人員利用基因敲除切割效率系統產生基因編輯細胞系,對GLUL基因組位點進行靶向測序,產生EPO的穩轉細胞系,並發現重組促紅細胞生成素在人體內穩定表達的機制。

源井生物根據客戶需求,結合靶基因的情況進行基因穩轉敲除方案設計

方案1:小片段基因敲除方案,gRNA設在外顯子2兩端的內含子中,敲除外顯子編碼鹼基數為非3倍數,敲除後可造成移碼。

方案2:移碼基因敲除方案,gRNA設在外顯子上,缺失的鹼基數為非3倍數,敲除後可發生移碼突變。

方案3:大片段基因敲除方案,將整個基因的編碼序列敲除,達到大片段敲除的效果。

Reference:

5 Contributions HeLa Cells Have Made to Science. Cell Science from Technology Networks. Retrieved 2020-03-25.

Yao Ye-bao, Wang Guang-fei, Dong Qing-cai, Cao Cheng. Construction of stable Cdc25C knockout HeLa cell strains using CRISPR/Cas9 gene-editing system, Military Medical Sciences, 2019,42(1):1-5.

Huang Rongfu, Peng Weilin, Lin Jiansheng, Lian Jianfeng, Yang Xiaoyu, Zheng Ming. Construction of stable Cdc25C knockout HeLa cell strains using CRISPR/Cas9 gene-editing system. Military Medical Sciences, 2017,41(5):359-362 .

註明 | 文章是源井生物原創,轉載請註明。

關 住 供 種 昊 「源井生物」,了解更多基因編輯相關資訊。

相關焦點

  • 基因敲除A549細胞系你不能錯過的文章-源井生物
    在肺組織中發現的A549細胞是鱗狀細胞,負責水和電解質在整個肺泡中的擴散,還可以通過胞磷膽鹼途徑合成含有高度不飽和的脂肪酸和卵磷脂。相比之下與小細胞肺癌(SCLC),該細胞系的侵襲性較小且擴散速度較慢,但事實證明它更為普遍,佔所有肺癌病例的85-88%。 A549細胞已成為II型肺泡上皮細胞的基因敲除細胞模型,這意味著A549 KO細胞系可用於研究肺組織的代謝過程以及藥物向組織的可能傳遞機制。
  • CRISPR-U基因敲除細胞系-源井生物
    CRISPR-U 是源井生物自主研發的應用於基因編輯細胞系的獨家技術(基於CRISPR / Cas9技術),通過優化基因編輯載體和基因編輯流程,CRISPR-U 技術的基因切割效率和重組效率是普通的CRISPR/Cas9技術的10倍以上,輕鬆實現細胞水平的基因敲除(KO)、基因點突變
  • 一次讀懂基因敲除Vero細胞系-源井生物
    Vero細胞起源於1960年代3月27日的正常成年非洲綠猴的腎臟,是微生物學以及分子和細胞生物學研究(包括涉及對基因的編輯等研究)中最常用的哺乳動物基因細胞系之一。作為需要CRISPR / Cas9技術的基因敲除/敲入。
  • 關於基因敲除U251細胞系的應用-源井生物
    U251細胞系是通過外植技術從惡性膠質母細胞腫瘤中衍生而來的,U251細胞系通常用作膠質母細胞瘤研究的實驗模型。 U-251 MG細胞系人類已用於研究Pax6(配對盒蛋白)相關的Dkk3(Dickkopf 3)表達增加的機制,通過CRISPR/Cas9敲除PAX6的U251細胞系是常用的工具分子研究PAX6在減輕膠質母細胞腫瘤進程中的作用。
  • 基因敲除EGFR細胞-源井生物
    表皮生長因子受體(EGFR)的擴增和基因突變被認為與預後呈負相關。在這項研究中,研究人員使用蛋白質組學確定UBXN1是EGFR突變vIII(EGFRvIII)的負下遊調控因子。通過生物信息學分析,研究人員發現UBXN1是可以改善神經膠質瘤患者總體生存時間的因素。研究人員還確定,在存在EGFRvIII的情況下,UBXN1的下調是由H3K27me3的上調介導的。
  • 這是基因敲除KYSE-150細胞系的成功秘籍-源井生物
    KYSE-150細胞是分化差的食道腺癌細胞,是從一名接受放射療法的49歲日本女性患者的頸部食道中分離出來的。當研究人員發現該細胞系時,患者的癌組織已侵入鄰近的組織。 KYSE-150細胞系是具有粘附單層的上皮細胞。
  • Crispr基因敲除細胞系系統分析-源井生物
    然而某些細胞組織即使可以敲除也不能單獨進行研究,因此該細胞在某些組織中必須是無活性的,而在其他組織中必須保持活性。利用這項技術,科學家可以在發育的特定階段中基因敲除細胞系,並研究敲除一個組織中內的基因如何影響其他組織中的相同基因。
  • Crispr基因敲除細胞系系統分析-源井生物
    利用這項技術,科學家可以在發育的特定階段中基因敲除細胞系,並研究敲除一個組織中內的基因如何影響其他組織中的相同基因。CRISPR-Cas9核酸內切酶產生了基因敲除細胞系的條件,揭示了冠心病在秀麗隱杆線蟲神經發育中的作用基因敲除動物的細胞系是研究細胞和發育生物學基本機制的寶貴工具。研究人員通過操縱秀麗隱杆線蟲的體細胞譜系中RNA指導的DNA核酸內切酶CRISPR-Cas9的表達,開發了一種條件敲除策略。
  • 基因敲除構巢麴黴的研究-源井生物
    它一直是研究真核細胞生物學的重要研究對象,也是當下科研界最看重的一方面,這些包括重組,DNA修復,突變,細胞周期控制,微管蛋白,染色質,慢病毒包裝,核動力學,致病性,代謝和實驗進化。 真菌在降解生態系統中的生物量方面起著重要作用,因為它們會降解所有類型的有機物。因此,它們是與工業有關的酶有主要來源,例如澱粉酶,纖維素酶,脂肪酶,果膠酶和蛋白酶。完全測序的真菌基因組的數量正在迅速增加。
  • 分享Hela 敲除細胞的運用-源井生物
    HeLa細胞介紹HeLa細胞與其他細胞系一樣,被稱為科研中的不朽細胞系,只要在適宜的環境中保持和維持,HeLa細胞在實驗室細胞培養板中可以無限次分裂。在基因編輯研究中,HeLa細胞成為CRISPR/Cas9 KO細胞系。
  • Crispr技術基因敲除細菌-源井生物
    特別令人感興趣的是被廣泛研究的革蘭氏陰性細菌大腸桿菌,因為它被認為是研究和工業應用的主要力量。研究人員提出了一種使用CRISPR/Cas9系統與λRed機器相結合的簡單,可靠和有效的方案,用於在大腸桿菌中進行基因敲除。在我們的程序中,至關重要的是使用雙鏈供體DNA和一種固化策略來去除編碼RNA的引導質粒,該質粒允許僅在兩個工作日內引發新的突變。
  • 基因敲除大腸桿菌的代謝通量分析-源井生物
    由於實驗室培養的悠久歷史和簡便的操作,基因敲除細胞系大腸桿菌在現代生物工程和工業微生物學中起著重要的作用。 [82] Stanley Norman Cohen和Herbert Boyer在大腸桿菌中的工作,利用質粒和限制酶產生重組DNA,成為生物技術的基礎。
  • 基因敲除細胞系技術-源井生物
    細胞系是由具有無限分裂能力的轉化細胞群組成。這通常來源於實驗室患者或動物的細胞系的致瘤起因。細胞系在研究中可能是無價的,整個醫學領域都異常的重視。它們通常堅固並且需要相對簡單的條件,從而進行組織培養。通過這種方式,這些類型的細胞最適合用於概念驗證工作的基因敲除細胞系技術(例如生物列印設備和技術的開發和初始實施)。但是,儘管細胞系確實保留了其來源細胞類型的某些正常功能,但通常會大大降低其功能。
  • 基因敲除酵母thg1-源井生物
    Thg1樣蛋白(TLP)基因敲除大腸桿菌和線粒體中發現,並且在生化上不同於其真核Thg1對應物TLP催化截短的tRNA的5&39;-單磷酸化的tRNA催化3&39;反應首先需要一個激活步驟,即在第二個核苷酸基轉移步驟之前生成5&39;-末端。與人類THG1的早期特徵一致,研究人員觀察到了激活和核苷酸轉移這兩個步驟中涉及的核苷酸的獨特結合位點。
  • CRISPR-U基因編輯細胞系
    CRISPR-U基因編輯細胞系原理 CRISPR-U是源井生物自主研發的基因編輯技術(基於CRISPR / Cas9技術),CRISPR-U技術比普通CRISPR/Cas9技術的基因切割效率更高,同時可以大幅度提升同源重組效率,輕鬆實現細胞和動物水平的基因敲除(KO)、基因點突變(PM)和基因敲入
  • 基因編輯RAW264.7細胞系助力炎症及破骨細胞生成相關研究
    RAW264.7細胞系的應用:RAW264.7是單核細胞/巨噬細胞樣細胞系,源自BALB/c 微小核糖核酸的Abelson白血病病毒轉化細胞系。RAW264.7是破骨細胞、炎症研究最常用的體外模型之一。
  • 基因敲除裡氏木黴可改變生物體基因組的遺傳-源井生物
    這些生物產生的降解生物質的酶也可用於食品,飼料,造紙和紡織工業等各個領域。裡氏木黴(Trichoderma reesei)是一種真菌,是纖維素酶和半纖維素酶的知名高效生產商,因此被酶工業廣泛用於生產其自身的內源酶以及生產異質蛋白。兩年來,許多研究表明,CRISPR/Cas9系統是一種強大的基因組編輯方法,基因敲除可促進多種生物體中基因組的遺傳改變。
  • 基因過表達/幹擾細胞系原理知識知多少?-源井生物
    利用CRISPR-U的技術優勢,源井生物已成功在超過100種細胞系上實現基因編輯,詳看下表 ↓基因過表達細胞系通過慢病毒感染法或核轉染法,將過表達載體轉入細胞中,根據預先摸索的最佳藥篩濃度,對細胞進行藥物篩選,直到對照組細胞全部死亡,獲得基因穩定表達的細胞株。
  • 基因編輯iPSCS敲除技術原理與潛在的治療應用-源井生物
    B2M基因敲除和HLA純合iPSC群體可以解決此問題,但是前一種方法可能誘導NK細胞活性並且不能呈遞抗原,而為後一種方法招募稀少的體則是一個挑戰。研究人員展示了兩種用於製備免疫相容性供體iPSC的基因組編輯策略。首先,研究人員通過對HLA雜合iPSC進行等位基因特異編輯,生成了HLA偽純合iPSC。
  • 基因編輯RAW264.7細胞系—助力炎症以及破骨細胞生成相關研究
    RAW264.7細胞在體外可以對刺激產生反應,並隨後產生具有破骨細胞完全分化的特徵的多核細胞,被廣泛用於研究骨骼疾病如風溼性關節炎、骨質疏鬆症、骨質溶解、牙周炎等。 RAW264.7細胞系的應用: RAW264.7是單核細胞/巨噬細胞樣細胞系,源自BALB/c 微小核糖核酸的Abelson白血病病毒轉化細胞系。