目前，全球範圍內發現的貝類種類約有13萬種。對貝類的分類方法各異，被較為廣泛接受的分類方法是將貝類分為如下7個綱：無板綱、單板綱、多板綱、瓣鰓綱、掘足綱、腹足綱和頭足綱。
（一）無板綱
無板綱是貝類中的原始型，形態與其他貝類不同，全體呈蠕蟲狀，沒有貝殼，腹面中央通常具腹溝。種類很少，全世界總共300多種，全為海產。
1，毛皮貝日
身體延長，呈蠕蟲狀。頭部通過一個收縮部與體軀分開，身體呈圓筒狀。口和排洩腔位於兩端。全身被有角質帶棘的外皮，腹面無腹溝。排洩腔內有2枚發達的羽狀鰓。中腸具盲囊，有肝的作用。腎也具有生殖輸送管的作用。雌雄異體，無交接器。齒舌特殊，有的具1枚大齒，大齒上生有多變的鋸齒。本目生物有閃耀毛皮貝、矮毛皮貝、粗糙毛皮貝等
2、新月貝目
身體兩側對稱，頭和排洩腔區與體軀之間的界限不明顯。口位於腹面近前端，排洩腔位於身體後端部或接近端部。具有腹溝，腹溝中有足：或至少在腹面有一長條形的區域，該區域無角質外皮。具足腺。鰓圍繞在肛門邊緣成褶疊狀，有時缺乏。雌雄同體。齒舌的形狀正常或缺乏齒舌。中腸沒有盲囊。自由生活或營寄生生活。本目生物有龍女簪。
（二）單板綱
以往只發現有這綱的化石種，直到1952年丹麥「海神」號調查船，在太平洋哥斯大黎加西方3570m深海才發現現生種，到目前發現30種。單板綱是一類原始的貝類，神經系統、消化系統、鰓的位置和結構等，都與多板綱相似，但只有1個帽狀貝殼，且有些器官有較明顯的假分節現象，所以單獨列為一綱，如新蝶貝。這類「活化石」的發現，對探討貝類的起源與進化，提供了新的材料。
單板綱又分為罩螺目、帳篷螺目和窄套目。其中最大的為罩螺目，如新碟貝，有單一大而兩側對稱的殼，殼頂向前方和腹方彎曲。頭部退化變小，具有1個廣闊扁平的足，外套溝把足緣和每側的外套膜分離。口位於足的前方。肛門位於體的後端外套溝中，外套溝有5對櫛狀鰓。
（三）多板綱
多板綱是貝類的原始型，完全海產。現生種類有1000餘種，都營底棲生活。它們普遍分布於世界各大洋中，從潮間帶至5 000餘米的大洋深處都有分布，但是生活在深海的
種類較少。它們一般生活於鹽度為29%~35%的水域中，鹽度過低的河口，很少有這類動物分布。多板綱動物按嵌入片的形狀分為鱗側石鑑目和石鱉目。
1.轉側石繁回
貝殼沒有嵌入片，即使有也不具有齒裂。例如，低粒鱗側石鱉（圖1-1-3），體小、長圓形；殼板白色，無嵌入片。尾板比頭板稍大。環帶上有多種棘和簇狀鱗，鰓10對。我國黃1海低潮區到40m深的海底有分布。
2，石肇目
貝殼具有嵌入片，而且具有齒裂。
（1）紫毛石鱉科
身體橢圓形或近圓形。頭板前方的嵌入片有8個齒裂，尾板後方中央有凹陷竇。環帶上除生有針、鱗外，還被有鬃毛狀突起。鰓列通常超過足部長度的一半。齒舌的內側齒具有大的3個齒尖。（2）隱板石鱉科
體呈橢圓形或細長條形。殼板較小，頭板的嵌入片具3或5個齒裂，中間板各側有1個裂或無齒裂，環帶發達。齒舌的內側齒有3個齒尖。
（3）鏈石鱉科
殼板通常有明顯的翼部，具各種雕刻。蓋層發達，常覆被連接層的大部分。在頭板和尾板中的嵌入片齒裂數目有變化：中間板每側的齒裂數很少，1~3個。齒舌的內側齒常有2個尖或3個尖，很少為單尖或鈍圓的。
（4）棘帶石鱉科
本科有日本花棘石鱉等。體長橢圓形，殼板褐色，環帶上黑色和白色的棘相間排列，呈帶狀。頭板上有互相交織的細放射肋和生長紋；中間板具有同心環紋：尾板小。在8枚殼板中以第3板最寬。環帶上著生粗而短的石灰質棘。鰓數目多。見於我國東南沿海
（5）雲斑石鱉科
本科有平瀨錦石鱉等。體呈長圓形，殼板花紋鮮豔，以第2板的長度最大。頭板半圓形，布有放射狀排列的殼眼，嵌入片具有9個垂直的齒裂。中間板峰部三角形，翼部特別顯著，前緣有3~4行殼眼，嵌入片每側各具1個齒裂。尾板大，後緣有殼眼2-3行。環帶表面生有微細的毛。鰓32對。生活於潮間帶，見於我國東南沿海。
（6）甲石鱉科
本科有朝鮮鱗帶石鱉等。體呈橢圓形，殼板高。頭板有16條由粒狀突起聯成的末端分叉的放射脅，嵌入片有14個齒裂。中間板的中央部具有粒狀突起的縱肋，翼部也有明顯的粗肋數條，肋上有較大的粒狀突起。尾板中央區有縱肋，後區有放射脅，嵌入片具12個齒裂。環帶窄，被以鱗片。鰓34對。生活於潮間帶，為我國海濱習見種類之一。
（四）瓣銀綱
解，綱全為水生生活，大部分生活於海中，少部分生活於淡水，極少數寄生。解鰓綱根據貝殼的形態、鉸合齒的數目、閉殼肌的發育程度和鰓的構造不同，可分為5個亞綱。
1，古列齒亞綱
兩殼相等，能夠完全閉合。貝殼表面具有黃綠色殼皮。殼內面多具有珍珠光澤。鉸合齒數量多，沿前、後背緣分布，通常具有內、外韌帶。前、後閉殼肌相等。鰓呈羽狀，足具面。成體沒有足絲。古列齒亞綱的主要種類有胡桃蛤總科（如胡桃蛤科）、吻狀蛤總科（如吻狀給科）及蟶螂總科（如蜓螂科）
2.翼形亞綱
兩殼相等或不等，殼呈卵形、長方形或圓形。殼頂兩側常具翼狀的前、後耳；鉸合齒數多或退化。前閉殼肌較小或完全消失。多數種類具足絲。無水管，鰓為絲鰓型。翼形亞綱可分為蚶目、貽貝目、珍珠貝目和牡蠣目。