英國劍橋大學Shankar Balasubramanian小組的一項最新研究繪製出乳腺癌G-四鏈體DNA結構區域圖譜。
相關論文於2020年8月3日發表於《自然—遺傳學》。
研究人員繪製了22個乳腺癌患者來源腫瘤異種移植(PDTX)模型中差異性富集的G-四鏈體(G4)DNA結構形成區域(G4Rs)。
G4Rs與高表達的高度擴增基因啟動子以及體細胞單核苷酸變異體相關。
G4R圖譜的差異揭示了不同PDTX中的七個轉錄因子程序。G4R的豐度和位置將PDTX分為至少三種G4亞型。
大多數PDTX(22個中的14個)中的G4R被發現與一種以上的乳腺癌亞型相關,研究人員也將其稱為整合簇(IC)。
這表明PDTX模型中多種乳腺癌狀態經常共存,其中大多數表現出侵襲性的三陰性IC10基因活性。
高水平G4R PDTX模型的短期培養對靶向G4 DNA的小分子更敏感。
因此,G4圖譜揭示了PDTX活檢中其他與IC相關的腫瘤內異質性,改善了乳腺癌分層,並可能建立新的治療策略。
據悉,由於腫瘤間和腫瘤內異質性,對抗癌療法的反應和耐藥性會有所不同。
來源:小柯生命
相關論文:
https://www.nature.com/articles/s41588-020-0672-8