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讓基因編輯脫靶無處躲藏
全新檢測基因編輯工具脫靶技術問世—— 讓基因編輯脫靶無處躲藏提起基因編輯,除了科技倫理外,讓科學家們心存疑慮的還有潛在技術風險——基因編輯脫靶。這會導致在基因靶點以外的地方產生錯誤切割,危害健康。不過,近日有好消息傳來:中國科學院神經所楊輝實驗室團隊與合作者開發了一套新型脫靶檢測技術,能夠準確、靈敏地檢測到基因編輯方法是否會產生脫靶效應,有望開發出精度更高、安全性更大的新一代基因編輯工具,建立行業新標準。何謂脫靶?
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基因編輯如何擺脫「脫靶」困擾
基因編輯雖好 脫靶是個問題 相對於以往研究基因功能的工具,以CRISPR/Cas9為代表的基因編輯技術效率和準確性都較高,但也會帶來一個可能「致命」的問題——脫靶效應。 「基因編輯可以『指哪打哪』。一般只要20個核苷酸序列就能對一個基因進行定位並定點敲除。
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科學家建立「GOTI」新型脫靶檢測技術
此研究顯著提高了基因編輯技術脫靶檢測的敏感性,並且可以在不藉助於任何脫靶位點預測技術的情況下發現之前的脫靶檢測手段無法發現的完全隨機的脫靶位點,為基因編輯工具的安全性評估帶來了新工具,有望成為新的行業檢測標準。
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「GOTI」技術讓基因編輯脫靶無處隱藏
該研究建立了一種被命名為GOTI(Genome-wide Off-target analysis by Two-cell embryo Injection)的新型脫靶檢測技術,並使用該技術發現: 近年來興起的單鹼基編輯技術有可能導致大量無法預測的脫靶,因而存在嚴重的安全風險。
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給基因編輯做「體檢」:讓脫靶無處隱藏
然而,基因編輯工具「脫靶」風險也一直備受關注。若將其應用於臨床,「脫靶效應」可能會引起包括癌症在內的很多種副作用。中科院神經科學研究所研究員楊輝在接受《中國科學報》採訪時表示,臨床技術對於潛在風險和副作用的容忍度極低,因此一種能突破之前限制的脫靶檢測技術,將成為CRISPR/Cas9及其衍生工具能否最終走上臨床的關鍵。
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基因編輯如何擺脫「脫靶」困擾—新聞—科學網
金雙俠強調,由於可以結合的潛在脫靶位點基因片段較短,所以在理論上脫靶概率還是比較高的,脫靶位點也比較多。 脫靶檢測最簡單有效的方法之一是全基因組測序法。通過軟體預測潛在的脫靶位點,然後將基因組測出來進行比對。
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Nature Methods:兩種新型 CRISPR 脫靶效應的分析方法
其中一種方法可以鑑定細胞類型特異性 SNP 相關的脫靶突變,另一種則可以檢測潛在脫靶切割位點。第一項研究中,來自麻省綜合醫院(MGH)和哈弗大學的研究人員開發了一種通過測序體外檢測切割效應的方法,稱作 CIRCLE-seq,該方法是一種高度靈敏的體外篩查法,比現有識別 CRISPR/Cas9 全基因組脫靶突變的細胞學或生化方法更有效。
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給基因編輯做「體檢」:讓脫靶無處隱藏—新聞—科學網
然而,基因編輯工具「脫靶」風險也一直備受關注。若將其應用於臨床,「脫靶效應」可能會引起包括癌症在內的很多種副作用。 中科院神經科學研究所研究員楊輝在接受《中國科學報》採訪時表示,臨床技術對於潛在風險和副作用的容忍度極低,因此一種能突破之前限制的脫靶檢測技術,將成為CRISPR/Cas9及其衍生工具能否最終走上臨床的關鍵。
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中國科學家建立新型檢測技術,基因編輯脫靶將無處隱藏
2019年3月1日,《科學》發表了一篇名為《胞嘧啶單鹼基編輯會導致大量單核苷酸突變的脫靶》的研究論文,該研究建立了一種被命名為GOTI(Genome-wide Off-target analysis by Two-cell embryo Injection)的新型脫靶檢測技術。
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「管住」脫氨酶,基因編輯不脫靶
GOTI技術的延伸2019年3月,該團隊曾在《科學》發布用於檢測基因編輯技術脫靶率的GOTI技術。論文共同通訊作者、中國農業科學院深圳基因組研究所研究員左二偉告訴《中國科學報》,這項最新成果即為基於GOTI技術探索解決單鹼基編輯器脫靶效應的方法。
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硬糖少女射箭,四人脫靶,趙粵高手,劉些寧深藏不露
脫靶二號王藝瑾,王藝瑾也是完全沒有接觸過射箭,拿著弓箭手足無措,一臉擔憂,最終還是脫靶了。「看著是靶心,怎麼射出去就不一樣了呢」,這個感受也是很真實了。陳卓璇還不錯啊,是沒有經驗的,箭都拿不起來,第一次脫靶了,但是還有能射中的時候,還是6環,不錯了。有興趣可以好好學學,說不定有一點這個天賦呢。
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全新檢測基因編輯工具脫靶技術問世 讓基因編輯脫靶無處躲藏
提起基因編輯,除了科技倫理外,讓科學家們心存疑慮的還有潛在技術風險——基因編輯脫靶。這會導致在基因靶點以外的地方產生錯誤切割,危害健康。不過,近日有好消息傳來:中國科學院神經所楊輝實驗室團隊與合作者開發了一套新型脫靶檢測技術,能夠準確、靈敏地檢測到基因編輯方法是否會產生脫靶效應,有望開發出精度更高、安全性更大的新一代基因編輯工具,建立行業新標準何謂脫靶?
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分子細胞中心等研發出系統性鑑定siRNA脫靶位點新方法
該研究運用自主研發的SpyCLIP技術,對野生型和切割活性缺失的miRNA/siRNA效應器蛋白AGO2平行進行SpyCLIP建庫測序,在全基因組層面準確、高效地鑑定出siRNA、miRNA的切割活性以及非切割活性作用位點,為降低siRNA藥物的潛在脫靶風險,改進siRNA的設計規則提供了強有力的手段。
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去年流感疫苗「脫靶」了嗎?我家孩子還有必要接種嗎?
一些家長對流感的危害認識不夠,沒有真正重視流感預防;一些家長則存在僥倖心理,認為流感不會發生在自己孩子身上;還有部分家長覺得流感疫苗的保護效果不佳,再加上聽說流感疫苗可能「脫靶」,擔心白打。那麼這次流感疫苗「脫靶」了嗎?要解答這個問題,首先要了解關於流感疫苗的一些知識。1 流感疫苗是什麼?流感是由流感病毒引起的急性呼吸道感染性疾病。
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...高彩霞課題組發現胞嘧啶鹼基編輯器引發意想不到的全基因組脫靶...
這些鹼基編輯器是將切口酶型Cas9蛋白與胞嘧啶脫氨酶或腺嘌呤脫氨酶融合在一起形成的,並且經發現它們在單向導RNA(sgRNA)的靶位點中促進C>T或A>G轉化(即在靶轉化)。儘管CBE和ABE的在靶轉化(on-target conversion)在許多有機體中發現,但是它們的脫靶效應並未在全基因組水平上進行過系統性評估。
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賀建奎:已知有一個潛在脫靶,還是選擇植入胚胎—新聞—科學網
「我們已經發現有一個潛在脫靶,並且告知夫婦可能的健康影響,他們決定植入胚胎」。
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國際軍事比武大賽中國坦克脫靶原因揭密
國際軍事比武大賽中國坦克脫靶原因揭密
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兩種新技術鑑定鋅指核酸酶切割脫靶位點的頻率
當鋅指核酸酶失效時 兩種新技術鑑定鋅指核酸酶切割脫靶位點的頻率為了系統性地描述這些脫靶切割位點,哈佛大學化學生物學者David Liu和他的同事們利用1000億個DNA片段組成的文庫---一些片段在人類基因組中出現---對兩種ZFN進行測試。大多數情況下,這些核酸酶切割靶位點,但是它們偶爾也切割其他類似序列---包括一種與癌症信號傳導途徑相關聯的基因。
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讓脫靶無處可藏!上海科學家世界首次證實單鹼基編輯存在嚴重脫靶
中科院神經所所長蒲慕明院士說,基因編輯安全性問題非常重要,一旦脫靶,除了會造成基因變異,還會影響非基因的DNA片段發生變化。此次工作顯著提高了基因編輯技術脫靶檢測的敏感性,讓脫靶無處隱藏,其在精度、廣度和準確性上都遠超之前的基因編輯脫靶檢測技術。在世界上首次證實了以BE3為代表的單鹼基編輯存在之前技術無法檢測的脫靶風險,讓世人重新審視了這一新興技術的風險。
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我科學家發現新一代無脫靶基因編輯工具
原標題:我科學家發現新一代無脫靶基因編輯工具 已往對基因編輯工具的脫靶檢測都瞄準在DNA水平,楊輝團隊將檢測範圍擴展到RNA水平,通過精巧的實驗設計,證明RNA脫靶主要是由於融合在Cas9上的脫氨酶導致。他們通過對混合細胞和單細胞水平的RNA突變位點進行分析,發現RNA突變位點和目的靶向序列沒有相關性,是由脫氨酶產生的隨機脫靶位點。