中科院解析染色質高級結構 揭開生命奧秘的「黑箱子」

2020-12-05 人民網

原標題:揭開生命奧秘的「黑箱子」

  你真的了解自己的身體嗎?你知道一個細胞中的DNA加起來有2米長嗎?這麼長的DNA怎樣被「塞」進僅有幾微米大小的細胞核呢?

  其實,這也是科學家想要搞清楚的問題。

  4月25日,美國《科學》雜誌報導了中科院生物物理所一項關於30納米染色質高級結構解析的研究成果。這篇研究論文發表後,一個塵封30多年的謎題隨之解開。

  和而不同,誰搞的鬼?

  每個細胞都是從單個受精卵細胞發育分化而來,具有相同的遺傳信息。然而,人體卻有著200多種不同的細胞,它們的形態和生理功能千差萬別。

  更有意思的是,西班牙和美國科學家於2009年分析了一對同卵雙胞胎的全基因組,發現其中一個人的基因正常,另一個人卻患有一種與遺傳有關的疾病——紅斑狼瘡。

  原來,雖然DNA被人們稱為遺傳信息的載體,但DNA在生命體內並不是獨立存在的,任何遺傳信息的傳遞和調控等生命活動都是在DNA與其纏繞的蛋白質所形成的染色質這個「生命信息載體」上進行的。

  生命體正是通過調控染色質結構,特別是30納米染色質高級結構的變化,選擇性地「打開」或者「關閉」基因,最終決定每個細胞的不同「命運」。這種現象就是近年來在生物學領域大熱的表觀遺傳調控。

  不過,染色質的高級結構變化卻像一個「黑箱子」,科學界對此一直沒有搞清楚。因此,在很多文獻中,研究者只好把一些不能解釋的現象模糊地歸咎為「該因子以某種方式改變了染色質的高級結構」。

  「長期以來,30納米染色質結構一直是染色質和表觀遺傳學領域的『老大難』問題。」生物物理所研究員李國紅說,結構都未被解析,表觀遺傳信息對其結構乃至更高級染色質結構的影響就更無從談起了。

  可李國紅也很清楚,只有啃下這塊「硬骨頭」,人類在認識自己的道路上才能走得更遠。

  點亮生命密碼

  但這一切談何容易。結構生物學中常用的X射線晶體、核磁共振等方法,面對30納米染色質纖維這樣一個超大分子複合體都顯得無能為力。由於缺乏系統性的、合適的研究手段和體系,近30年來,30納米染色質纖維高級結構研究一直是現代分子生物學領域面臨的最大挑戰之一。

  然而,生物物理所研究員朱平的加入,為這項研究帶來了新希望。朱平的專長是冷凍電鏡三維結構研究,他與長期從事30納米染色質及表觀遺傳調控研究的李國紅髮揮各自優勢,搭建了一套染色質體外重建和結構分析平臺。

  「冷凍電鏡的原理其實二三十年前就有了,但直到最近幾年才有了比較大的發展,它是研究這類超大分子複合體結構最合適的手段。」朱平介紹說,生物物理所於2010年建成了世界一流的冷凍電鏡研究平臺,科學家也就有了破解30納米染色質結構的「金剛鑽」。

  這一研究的另一大難題是樣品的製備。在人體內,任何環境細微的變化都會引起30納米染色質的很大變化,在體外環境下就更難得到高度均一的樣品。為此,李國紅設計了一種體外自組裝方法,精確控制實驗環境,使其儘可能與體內環境接近,最終成功製備出合格的樣品。

  終於,中國研究團隊在國際上率先解析了30納米染色質的高清晰三維結構:30納米染色質纖維以4個核小體為結構單元,各單元之間通過相互扭曲摺疊形成一個左手雙螺旋的高級結構。

  「在現代生物學教科書中,30納米染色質纖維一直被描述為由6個核小體組成的中空螺線管。」中科院前沿科學與教育局局長許瑞明說,因此這項成果是一項可以寫進教科書的成果。

  迷人的雙螺旋

  歷史總是充滿了巧合。1953年4月25日,沃森和克裡克在英國《自然》雜誌上發表了一篇劃時代的論文,向世界宣告DNA雙螺旋結構的存在,成為20世紀最偉大的科學發現之一。

  無獨有偶,此次中國科學家發現的染色質高級結構也是一種雙螺旋。朱平認為,雙螺旋結構「十分穩定,它在生命的傳承與調控中可能起到了非常重要的作用」。

  而這次成果的產出也是兩個團隊、兩個實驗室通力合作的結果。生物物理所所長徐濤認為,這次重大成果的取得得益於幾個因素的不斷完善。「30納米染色質高級結構是研究所確立的3個重大突破之一,而圍繞國際一流的科學問題,我們組建了國際一流的研究團隊,建設國際一流的科技條件平臺,也一直在探索國際一流的體制機制。」

  中科院戰略性先導科技專項也給了科學家自由探索的空間。在今年3月17日啟動的「生物超大分子複合體的結構、功能與調控」先導專項以及科技部、國家自然科學基金委等的支持下,李國紅和朱平等對30納米染色質高級結構這一重大科學難題展開聯合攻關,最終在國際上率先打通30納米染色質結構解析的通道。

  「如果沒有近些年國家對科研的強力支持,沒有生物物理所的科研環境,沒有兩個團隊毫無保留的合作,我們可能很難作出這樣的成果。」朱平盼望著他與李國紅結成的「雙螺旋」組合,還可以向更廣、更深的領域進發,破譯更多的生命密碼。

相關焦點

  • 中國科學家解析30納米染色質高級結構 可解釋基因選擇性表達原理
    30年來,染色體(DNA和包裹在外的蛋白質)的高級微觀結構一直是困擾科學界的難題,對科學家來說,染色體就像一個黑箱,你看得到它的作用結果,卻看不到它的運轉方式。4月25日,中科院生物物理所一項關於30納米染色質高級結構解析的研究成果在《科學》雜誌上發表,首次揭開了這一謎題,初窺基因表達和細胞分化的「開關」,握住了細胞生長「方向盤」。
  • 生物物理所30nM染色質高級結構解析取得重要突破
    4月25日(DNA雙螺旋結構發現61周年紀念日),Science以長幅研究論文(Research Article)形式報導了來自中國科學院生物物理研究所一項關於30nm染色質高級結構解析的重大成果。
  • 科學網—30納米染色質高級結構成功解析
    近30年來,由於缺乏系統、合適的研究手段,作為染色質包裝過程中承上啟下的關鍵部分,30納米染色質高級結構研究一直是現代分子生物學領域面臨的最大挑戰之一。 科學家已經發現,染色質包裝分4步完成,對應了染色質的四級結構:第一級結構是核小體;第二級結構是核小體螺旋化形成30納米染色質纖維;第三級結構是30納米染色質再摺疊成更為複雜的染色質高級結構,即超螺旋體;第四級結構是超螺旋體進一步摺疊形成在光學顯微鏡下可以看到的染色體。
  • 中國科學家率先揭開生命信息載體結構奧秘
    以上關於DNA的凝縮模型是目前科學界關於DNA、染色質和染色體組成的基本認識,也是現代生命科學教科書的經典內容。由於缺乏一個系統性的、合適的研究手段和體系,目前對於30nm染色質纖維這一超大分子複合體的組裝和調控機理的研究還十分有限,對於它的精細結構組成也具有很大爭議。近30多年來,30nm染色質纖維高級結構研究一直是現代分子生物學領域面臨的最大挑戰之一。
  • 中國科學家率先解析生命信息載體結構奧秘
    ,揭開了遺傳信息如何傳遞這個「生命之謎」。中科院生物物理所長期從事冷凍電鏡三維結構研究的朱平研究員和長期從事30nm染色質及表觀遺傳調控研究的李國紅研究員通過多年的緊密合作和不懈努力,發揮各自專長和優勢,成功建立了一套染色質體外重建和結構分析平臺,利用一種冷凍電鏡單顆粒三維重構技術在國際上率先解析了30nm染色質的高清晰三維結構,在破解「生命信息」的載體 -- 30nm染色質的高級結構研究中取得了重要突破。
  • 科學家揭示人類胚胎染色質三維結構動態變化
    新華社濟南12月5日電(記者蕭海川)探求人類基因奧秘,始終是生命科學的前沿領域。國內兩支尖端科研團隊近來攜手攻關,共同揭示了人類早期胚胎中的染色質三維結構的動態變化,有助於更深一步了解生命發育過程。相關科研成果已通過長文形式發表在新近出版的《自然》雜誌上。
  • 30-nm染色質纖維結構及其動態調控的分子機制
    現任中國科學院大學生物化學與分子生物學教研室副主任,中國科學院生物物理所生物大分子國家重點實驗室副主任,J Biol Chem,Genome Biol和「中國科學--生命科學」雜誌編委。李國紅研究員主要針對染色質高級結構及其表觀遺傳調控機理開展深入研究,並取得了一系列研究成果並且產生了重要的國際影響,其中30nm染色質結構已入選多本國際著名《生物化學》和《結構生物學》教科書,其中包括《Lehninger Principles of Biochemistry》和《Fundamentals of Biochemistry: Life at the Molecular Level》。
  • 我國科學家揭開「生命信息載體」第二級密碼
    新華社北京4月25日電(記者 吳晶晶)61年前,科學家沃森和克裡克發現了DNA雙螺旋結構,揭開了遺傳信息如何傳遞這個「生命之謎」。中國科學家25日宣布,他們發現了基因組「生命信息載體」的第二種雙螺旋結構,即利用冷凍電鏡單顆粒三維重構技術,在世界上首次解析了30納米染色質的高清晰三維左手雙螺旋高級結構。
  • Protein&Cell|核纖層蛋白對染色質高級結構等調控
    但是,研究者對於隔離與定位A/B區室和染色體領地的調控因子與機制認知較少,同時對影響染色質運動狀態的因素了解有限,染色質高級結構與運動狀態的關聯性尚不清楚。已有對染色質高級結構和運動狀態的研究結果提示,細胞核核膜附近的核纖層區域對染色質的結構和運動狀態維持、相應基因表達調控均有重要作用。
  • 【新華網】我國科學家揭開「生命信息載體」第二級密碼
    61年前,科學家沃森和克裡克發現了DNA雙螺旋結構,揭開了遺傳信息如何傳遞這個「生命之謎」。中國科學家25日宣布,他們發現了基因組「生命信息載體」的第二種雙螺旋結構,即利用冷凍電鏡單顆粒三維重構技術,在世界上首次解析了30納米染色質的高清晰三維左手雙螺旋高級結構。
  • 中國發現「生命信息載體」另一雙螺旋結構
    中國科學院生物物理研究所/供圖中科院生物物理所攝  中新網北京4月25日電(記者孫自法)中國科學院生物物理研究所25日發布信息說,該所科學家在國際上率先解析了30nm(納米)染色質的高清晰三維結構,這是繼DNA雙螺旋結構之後,在破解「生命信息載體」的另一種更高一級的雙螺旋結構研究中取得的重要突破。
  • 研究揭示核纖層蛋白對人源細胞中染色質高級結構及染色質運動狀態...
    染色質的三維結構具有有序性和動態變化性,構成細胞核中各種生物學過程的全新調控層次。通過成像和高通量測序技術,研究者發現染色質高級結構分為染色質環(Loop)、拓撲關聯域(Topologically associating domain,TAD)、A/B區室(A/B compartment)和染色體領地(Chromosome territory,CT)等多個層級。
  • 生命學院陳柱成、李雪明等合作在《自然》發文報導染色質重塑發生...
    生命學院陳柱成、李雪明等合作在《自然》發文報導染色質重塑發生的機理清華新聞網3月14日電 3月13日,清華大學生命學院陳柱成、李雪明課題組聯合中科院物理所李明研究員等人在國際頂級學術期刊《自然》(Nature)上在線發表題為《Snf2介導的染色質重塑中DNA滑移機理的研究》(Mechanism of
  • 揭示核纖層蛋白對人源細胞中染色質高級結構及其運動狀態的調控
    染色質的三維結構具有有序性和動態變化性,構成細胞核中各種生物學過程的全新調控層次。通過成像和高通量測序技術,研究者發現染色質高級結構分為染色質環(Loop)、拓撲關聯域(Topologically associating domain,TAD)、A/B區室(A/B compartment)和染色體領地(Chromosome territory,CT)等多個層級。
  • 中國科學家「看見」 人類胚胎染色質結構動態變化
    我科學家「看見」 人類胚胎染色質結構動態變化科技日報訊 (記者王延斌)首次揭示人類早期胚胎中的染色質三維結構的動態變化,首次解析人類精子和早期胚胎的高級結構,首次繪製人類早期胚胎染色質三維構象圖譜……近日,中國科學院院士、山東大學教授陳子江和中國科學院北京基因組研究所教授劉江領銜的科研團隊取得了上述新突破
  • 清華陳柱成研究組發文闡述「模擬開關」染色質重塑蛋白的結構與...
    清華陳柱成研究組發文闡述「模擬開關」染色質重塑蛋白的結構與調控機理清華新聞網12月8日電 12月6日,清華大學生命學院陳柱成研究組在《自然》(Nature)雜誌發表題為「模擬開關染色質重塑蛋白的結構與調控」(Structure and regulation of the chromatin remodeler ISWI
  • 【果殼網專訪】李國紅與朱平:解析30nm染色質三維結構的中國科學家
    今年4月25日,《科學》雜誌紙質版和在線版同時刊發了一篇論文:科學家終於首次解析出30nm染色質的高清晰三維結構。恰好61年前的同一天,沃森和克裡克發表了現代生物學中裡程碑式的DNA雙螺旋結構。為了更好地了解DNA如何包裝成染色體,科學家們一直致力於與破解裝配過程中的各種結構。
  • 我科學家揭示生命信息載體第二級密碼
    原標題:我科學家揭示生命信息載體第二級密碼   新一期的美國《科學》(Science)雜誌以長幅研究論文形式報導中國科學院生物物理研究所科學家們的一項重大發現。中國科學家發現了基因組「生命信息載體」的第二種雙螺旋結構——染色質的左手雙螺旋結構。
  • 非常規PRC1介導的H2AK119ub1蔓延可能受到染色質高級結構的調控
    責編 | 兮真核細胞內,DNA與組蛋白八聚體纏繞1.7圈形成核小體結構,然後核小體串珠經過逐級壓縮形成高級的染色質結構。表觀遺傳因子通過調節染色質結構的開放與關閉,控制了基因的表達與沉默,從而維持了不同譜系細胞內基因的差異表達。
  • ...合作揭示小鼠體細胞核移植胚胎發育過程中染色質高級結構重編程...
    147bp的DNA纏繞在組蛋白八聚體後形成核小體念珠結構是染色質的一級結構,之後經過不斷地摺疊堆積,最終形成了複雜的染色質三維結構。在哺乳動物中,染色質三維結構對基因的調控起著非常重要的作用。隨著高通量染色體構象捕獲技術(Hi-C)和高通量測序技術的快速發展,近年來,科學家們已經揭示了多種重要生物學事件發生過程中的染色體三維結構信息。