浮遊藻類在水體中經濟動物直接或間接的餌料基礎，是水域的初級生產者，也是水中溶解氧的主要來源。通常根據藻類被魚類消化、利用的程度以及對養殖動物造成的危害分為：有益藻類和有害藻類。
水網藻、水綿、青泥苔、微囊藻及其湖靛歸為有害藻類。
1.水網藻
水網藻是大群體型的綠藻，因藻體連接成網狀，故又稱為水網藻，網片狀或狀囊形，長度可達數10釐米，自由懸浮於水面，用茶粕清塘的魚池常大量發生，因茶粕非但不能殺死水網藻，反因池水變肥而助長水網藻的大量繁殖。
水網藻對水產動物的危害同青泥苔，但危害程度比青泥苔更嚴重。
水網藻肉眼可見，繁殖能力很強，生長的溫度範圍較廣，生長時，一方面大量消耗水中養料，池水極度貧瘠，浮遊生物不能大量繁殖，影響淡水養殖動物的生長；另一方面因其附著在蝦、蟹等養殖動物的鰓、頰、額等處，使其活動困難，攝食減少，嚴重時窒息死亡。
另外，水網藻浮張的羅網，還可造成大批淡水養殖動物被纏住遊不出而死亡，魚苗誤入網中常因呼吸和攝食困難而死亡。
防除方法：
1水網藻發生，可用硫酸銅溶液0.7～1.0克/立方米水體潑灑。
2施用市售滅藻類藥物。
2.水綿
水綿也是藻類，可作某些魚類的餌料，還可以入藥，有清熱解毒的功效；但水綿大面積發生容易出現較多有害問題。水綿旺盛時漂浮於水中形成團團亂絲，影響水溫升高和溶氧增加，且大量消耗養分使池水變瘦，影響魚生長。
水綿為多細胞絲狀結構個體，葉綠體呈帶狀，有真正的細胞核，含有葉綠素可進行光合作用。
藻體是由1列圓柱狀細胞連成的不分枝的絲狀體。由於藻體表面有較多的果膠質，所以用手觸摸時頗覺粘滑。
在顯微鏡下，可見每個細胞中有1至多條帶狀葉綠體，呈雙螺旋筒狀繞生於緊貼細胞壁內方的細胞質中，在葉綠體上有1列蛋白核。細胞中央有1個大液泡。1個細胞核位於液泡中央的一團細胞質中。
核周圍的細胞質和四周緊貼細胞壁的細胞質之間，有多條呈放射狀的胞質絲相連。轉板藻、雙星藻和絲藻常與水綿糾纏在一起生活，其中雙星藻是水綿的近緣種。
水綿在相對清潔的富營養化水體中非常普遍，在水中呈片或團狀，摸起來手感黏滑。春季，水綿在水下生活，當陽光充足、天氣溫暖時，它們就可以進行光合作用產生大量氧氣泡，出現在纏結的細絲間。
防除方法：
1水綿發生後，可用硫酸銅溶液0.7～1.0克/立方米水體潑灑，最好2小時後換入1/3的新水以防缺氧。
2按每畝1米深的魚池用撲草淨150～200克，拌溼土撒於水綿上。
3施用市售滅藻類藥物。
3.微囊藻
微囊藻有銅綠微囊藻和水花微囊藻種類，多生長在有機質豐富的水體中，營浮遊生活，pH值以8～9.5為宜。
高溫季節水溫在28～32℃時繁殖快，生長旺盛，常常形成水華，肉眼可見，使水體呈灰綠色，其浮膜似銅綠色油漆，有臭味。
當養殖池塘中微囊藻形成水華時，夜間大量消耗水中的溶解氧，並產生過量二氧化碳，很容易造成池塘缺氧泛池。同時，微囊藻死亡後分解產生的羥氨和硫化氫對水生動物有毒，可使魚、貝類等死亡。
防除方法：
1高溫季節魚池要常換新水。
2銅綠微囊藻和水花微囊藻兩種藻發生初期，每畝1米深的魚池可放養羅非魚500～1000尾。
3用硫酸銅溶液0.7～1.0克/立方米水體潑灑。
4 施用市售滅藻類藥物。
4.湖靛
湖靛又叫銅鏽水，它是藍藻類大量繁殖而形成的，也可稱之為微囊藻。
一般在早上9-10點前浮於水面進行光合作用，能佔去整個魚池水面，並有無數氣泡溢出水面，發出臭味。其後，隨著陽光增強，不斷下沉到中層，水面上則漂浮著一片黃而微綠色的死亡群體。
湖靛是一些藍藻在水溫較高和鹼性較大的水中大量繁殖，使水面呈一層翠綠色的水華或薄層。在魚池水中含氮量高、有機質多，水溫為28～30℃、pH值為8～9.5時，藍藻類就會大量繁殖，尤其是藍藻中的微囊藻大量繁殖即形成湖靛。
湖靛---這種微囊藻外面有層膠質膜包著，就連草魚、青魚、鰱魚、鱅魚等魚吃了湖靛也都不能消化，因此影響魚的生長。
湖靛死亡後又產生一些有毒物質，毒物積累多了，不僅能毒死魚類，據說牛羊飲了這種水也能被中毒。此外，當藍藻大量繁殖產生湖靛微囊藻時，也會導致魚的中樞神經和末梢神經系統失靈，興奮性增加，急劇活動，痙攣，身體失去平衡。
防除方法：
1微囊藻繁殖季節，經常加注清水，不使水中有機質含量過高，同時注意水的pH值的調節，可控制微囊藻的繁殖。
2每立方米水體用0.7～1克硫酸銅全池撥灑，能有效地殺死微囊藻。施藥後應開啟增氧機或加注清水，以免魚浮頭。
3在清晨藻群體上浮水面時，撒生石灰粉，連續2～3 次，基本可把它殺死。
4生物控制：試驗證明20克以上的羅非魚能夠吞食並消化微囊藻（其他幼小魚類均不能消化微囊藻），起到抑制微囊藻繁殖和淨化水質的作用。
5使用殺滅藍藻的藥物。
5.青泥苔
青泥苔屬絲狀綠藻，消耗池中的大量養分使水質變瘦，影響浮遊生物的正常繁殖。青苔它既消耗魚池中的溶氧，又對魚類生長起阻礙作用。且當青泥苔大量繁殖時影響魚苗活動，魚苗常被亂絲纏繞致死。
青苔的危害：
⑴青苔大量繁殖後消耗了養殖水體中的無機鹽類，使池水中正常的營養物質代謝遭到破壞，水質變得清瘦。
⑵養殖前期魚苗太過弱小，青苔大量繁殖易導致苗種(包括蝦蟹)被纏繞進食困難最終被纏繞致死。
⑶青苔死亡分解後產生硫化氫等有害物質，引起水質發黑、發臭，水體中溶解氧含量偏低導致水生動物中毒死亡。
⑷青苔大量繁殖與養蟹池中的水草爭奪水中營養易導致水草生長緩慢。
防除方法：
1每立方米水體用0.7～1克硫酸銅全池撥灑。
2每畝水面用50千克草木灰撒施，使其不能進行光合作用而死亡。
3每畝用食用級石膏5公斤，加水調製成漿狀，向全池潑灑，並對青苔多的地方適當多潑些。一般在潑灑2日後，魚池中的青苔便會消失，且在短時間內不會再生。
4施用市售滅藻類藥物。
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