生殖隔離就是指親緣關係接近的類群在自然的條件下不交配，即使交配了也無法繁殖後代或者後代也無法具有生育能力的一種隔離機制。
人和黑猩猩雖然有98%以上的基因是相似的，而且共祖，但是人和大猩猩無法繁殖後代的，前蘇聯的科學家就這一點做過一個實驗。
人類的起源同樣是一個非常複雜的問題。第一個人類是從哪裡來的？在很早之前，不同的人種之間又是怎麼樣的一個關係呢？
在後代的科學研究中，科學家在很多人種當中同時發現了智人和尼安德特人的基因，說明在某個歷史時期這兩個人種進行過聯姻和交配，但是卻從來沒有找到過智人和直立人的共同後代。為什麼尼安德特人和晚期智人並沒有生殖隔離，但是直立人卻和晚期智人有呢？
直立人
人類是從猿人開始轉變的，而猿人就是「直立人」，是從猿類到人類過渡的階段。科學家現在普遍認為，直立人是現代人的祖先，直立人大概最早在180萬~300萬年前廣泛生活在非洲、歐洲、亞洲等地區。我們都非常熟悉的在周口店出土的「北京人」就是屬於直立人。
鼎盛時期，直立人基本統治了非洲和亞洲的地區，所向披靡。
智人
智人是從直立人不斷演變進化而來的。大約在25萬年前，直立人的腦容量突然發生了巨大的變化，大大地得到了提升，因此「智人」就開始站在歷史的舞臺上了。
智人又根據不同的階段劃分為早期智人和晚期智人。
早期智人大概距今5~20萬年以前，他們的腦容量都遠遠高於直立人，平均在1300毫升左右，但是大腦的結構比較原始簡單。從樣貌上來看，仍然保持著很多猿人的特徵。這時候的早期智人已經能夠打制石器，並使用複合工具了；雖然不會使用天然火，但是也能人工生活了，並開始進入了母系氏族了。
晚期智人是距今1~5萬年的人類，它們的樣貌特徵已經非常接近現代人了，能夠製造磨光的石器和骨器了，也能夠鑽木取火了。我們熟悉的山頂洞人就是屬於晚期智人了，他們已經具有一定的生產能力和文化水平了。
尼安德特人
而尼安德特人其實就是屬於早期的智人。隨著尼安德特人的消失，也有多種說法。有的認為是尼安德特人慢慢進化成了晚期智人，也有人認為可能是被文明水平更高的種族入侵，滅絕了。
我們再次回到最開始的問題，為什麼尼安德特人和晚期智人並沒有生殖隔離呢？
尼安德特人和晚期智人在人類的劃分上其實都已經屬於是智人了，而且尼安德特人也具有了一定的文明水平。而且從人類進化的路徑來看，尼安德特人和晚期智人相隔的時間其實很短，而且更多的只是在樣貌上發生了變化。
但是晚期智人和直立人的年代差別就很廣了。中間可能就隔了幾百萬年。在這幾百萬年基因慢慢就進化成了不相容的部分。
為什麼尼安德特人的Y染色體消失了
科學界一直有一個問題困擾著很多人， 就是為什麼尼安德特人的Y染色體為什麼逐漸消失了？現在檢測到了尼安德特人的基因當中基本上都只有X染色體，而Y染色體的位置已經逐步被智人所取代了。
是否尼安德特人和晚期智人之間還是存在部分的生殖隔離，導致尼安德特人的Y染色體消失呢？
當然也有科學家提出可能是因為尼安德特人由於人口數量太少，基因中積累了大量的有害突變基因，而智人的基因庫則更為多元化，遺傳優勢更為明顯。
小結：
生殖隔離是很多人都感興趣的一個問題，究竟不同的「人種」之間是否能夠交配、繁殖後代？現代基因測序的結果表明，直立人和晚期智人是不進行通婚的，它們之間具有生殖隔離。
但是尼安德特人和晚期智人就不存在生殖隔離。其實尼安德特人屬於早期的智人，和晚期智人相隔的年代不是很久。
但是尼安德特人與晚期智人之間是否也存在部分的生殖隔離呢？不然尼安德特人Y染色體消失要如何解釋呢？
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