正式開始之前我們要先了解什麼是回交！
接下來以植物舉例說明，讓大家更容易理解，有這樣兩種棉花：A棉花可以抗蟲病、B棉花產量大、易存活總之有各種優點，但可惜的是就不抗蟲，每次到蟲災都大量死亡。這樣來看B棉花更加具有發展經濟價值，那麼如何讓B棉花也能抗蟲病，但是不能丟掉自己以前的優良性狀哪？
科學家就想出了「回交育種」的辦法，把B棉花作為輪迴親本，A棉花作為非輪迴親本只使用一次。A棉花和B棉花雜交形成了子一代，挑選出A棉花的有利性狀子一代F1，讓F1繼續與B棉花雜交（這一次就被稱為回交）生成新的子代，挑選A棉花的有利性狀F2繼續與B棉花雜家（第二次回交），重複這樣的過程回交的次數越多，最終形成的子代越純，也就是含有B棉花的有利性狀基因佔比越高。對於植物育種最後形成的子代還可以讓它們自交，Aa這樣的個體自交，假如是有利性狀，那麼在後代中包括了AA、Aa、aa這三種個體，那麼自交後選擇的就是AA這樣的純個體，這就是最終目標。
如果把回交放在動物身上，有的人就簡單地把它理解為近親繁殖了，近親繁殖的危害就是可能把某些隱性遺傳的不利基因在親子中體現出來。
但實際上還是有一定區別的，馬和驢嚴格意義上來講是兩個物種，它們之間存在著生殖隔離，但是馬和驢的交配產生後代也就是騾子，騾子是不可育的，馬的回交應該指的是騾子和親代的馬再繼續交配，但前邊我們都說了騾子百分之九十九以上是不可育的，只有在某些極特殊的情況下才可能發生育種。
在農村飼養家畜，有的希望可以得到更好的後代，都會去專門的配種站。例如以豬為例子希望生下更多的豬寶寶，那麼待豬寶寶長大後如果配種站的豬壽命足夠長，那麼長大後的豬寶寶還是可以去那配種的。那麼問題中所說的「馬的回交」也是如此，這種情況在某種意義上就是回交。大多數動物都可以回交，這在胚胎學、生理學研究領域很常見，最簡單的就是對實驗小白鼠進行回交，得到期望的性狀進行研究。
文/科學黑洞，圖片來源網絡侵刪。