研究總結CRISPR–Cas實驗的設計和分析

2020-11-27 科學網

研究總結CRISPR–Cas實驗的設計和分析

作者：

小柯機器人

發布時間：2020/4/19 23:15:22

近日，美國哈佛大學與麻省理工學院聯合的博德研究所John G. Doench等研究人員總結了CRISPR–Cas實驗的設計和分析。這一綜述論文於2020年4月13日在線發表在國際學術期刊《自然—生物技術》上。

目前，龐大且不斷擴展的CRISPR-Cas系統可在目標實驗和大規模實驗中快速且靈活地操作基因組。人們已經開發了許多軟體工具和分析方法用於CRISPR–Cas實驗的設計和分析，包括在不同操縱模式下最優嚮導RNA的設計以及對此類實驗結果的分析。

 

研究人員表示，近期研究中的一個主要重點是開發綜合工具，從而用於大規模的CRISPR基因篩選數據。隨著這一領域的不斷發展，現有的挑戰不僅在於創新，更需要積極維護和改進現有工具，進而促使不同學科的研究人員可以依靠穩定的計算資源來進行CRISPR-Cas實驗。

 

附：英文原文

Title: Design and analysis of CRISPR–Cas experiments

Author: Ruth E. Hanna, John G. Doench

Issue&Volume: 2020-04-13

Abstract: A large and ever-expanding set of CRISPR–Cas systems now enables the rapid and flexible manipulation of genomes in both targeted and large-scale experiments. Numerous software tools and analytical methods have been developed for the design and analysis of CRISPR–Cas experiments, including resources to design optimal guide RNAs for various modes of manipulation and to analyze the results of such experiments. A major recent focus has been the development of comprehensive tools for use on data from large-scale CRISPR-based genetic screens. As this field continues to progress, a clear ongoing challenge is not only to innovate, but to actively maintain and improve existing tools so that researchers across disciplines can rely on a stable set of excellent computational resources for CRISPR–Cas experiments.

DOI: 10.1038/s41587-020-0490-7

Source: https://www.nature.com/articles/s41587-020-0490-7

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