全基因組關聯研究發現重症COVID-19遺傳易感基因

2021-01-09 健康一線視頻網

截至2020年6月23日為止，全球已確診的新冠肺炎（Covid-19）病例超過922萬，死亡總數超過47萬。

在Covid-19大流行期間，感染者的表現各異，大多數僅出現輕度症狀，甚至沒有症狀，而嚴重的Covid-19患者伴有呼吸衰竭、肺間質性肺炎及急性呼吸窘迫症候群等。目前已報導較高的死亡率與高齡、男性、高血壓、糖尿病和其他肥胖相關的心血管疾病特徵相關的臨床關聯，但人們對嚴重Covid-19的發病機制及其相關因素仍了解甚少。

近日，來自挪威奧斯陸大學的研究團隊在《The New England JournalOf Medicine》上發表了其對重症Covid-19與呼吸衰竭的全基因組相關性的最新研究結果。其檢測到Covid-19呼吸衰竭與基因座3p21.31的rs11385942和基因座9q34.2的rs657152的交叉複製關聯，3p21.31基因簇是Covid-19呼吸衰竭患者的遺傳易感性基因座，而9q34.2位點的關聯信號與ABO血型位點一致，與其他血型相比，A型血的重症風險更高，O型血可能具有保護作用。

DOI: 10.1056/NEJMoa2020283

具體來說，研究人員對義大利和西班牙七家醫院中的1980名出現呼吸衰竭的Covid-19重症患者進行全基因組關聯研究，同時招募了來自義大利和西班牙的2381名參與者分別作為其對照。結果共分析了8582968個單核苷酸多態性，並對其進行薈萃分析。

在整體薈萃分析中，研究人員發現了兩個與Covid-19誘導的呼吸衰竭相關的基因組範圍全基因組關聯：rs11385942插入-缺失基因座3p21.31處的GA或G變異（GA等位基因優勢比為1.77）和基因座9q34.2的rs657152 A或C SNP（A等位基因的優勢比為1.32）。在西班牙和義大利的子集分析中，這兩個基因座均顯示出顯著關聯。

GWAS總結圖的薈萃分析統計，突出兩個易感性位點與嚴重Covid-19呼吸衰竭相關

除此之外，還鑑定到24個與Covid-19誘發的呼吸衰竭相關的不同的基因組基因座。基因座3p21.31和9q34.2處的關聯信號可分別精細映射到22個和38個變異。

3p21.31位點的關聯信號包含六個基因（SLC6A20，LZTFL1，CCR9，FYCO1，CXCR6和XCR1），rs11385942的風險等位基因GA與CXCR6的表達減少和SLC6A20的表達增加相關，LZTFL1在人肺細胞中強烈表達。研究人員還發現，經年齡和性別矯正後，接受機械通氣的患者中3p21.31（rs11385942）的風險等位基因頻率高於僅接受氧氣補充的患者（優勢比為1.56）。

與嚴重Covid-19呼吸衰竭相關的敏感位點區域關聯圖

同時，研究人員發現，基因座9q34.2的關聯信號與ABO血型基因座一致，在校正年齡和性別進行薈萃分析後，A型血型患者的風險高於其他血型患者（風險比為1.45），而O型血相比其他血型更具保護作用（風險比為0.65）。而僅接受補充氧氣的患者與接受機械通氣的患者在血型分布上無顯著差異。

總而言之，研究人員對義大利和西班牙的Covid-19患者進行了GWAS分析，在3p21.31號染色體基因簇上檢測到一個新的易感基因座，並確認了Covid-19中ABO血型系統是潛在的症狀參與調控者。這一發現，對了解嚴重Covid-19的發病機制及其相關因素提供了一定的基礎。

參考資料：

[1] GenomewideAssociation Study of Severe Covid-19 with Respiratory Failure.

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