國際病毒分類委員會（ICT V）第七次報告（1999），將所有已知的病毒根據核酸類型分為DNA病毒——單股DNA病毒，DNA病毒——雙股DNA病毒，DNA與RNA反轉錄病毒，RNA病毒——雙股RNA病毒，RNA病毒——單鏈、單股RNA病毒，裸露RNA病毒及類病毒等八大類群。此外，還增設亞病毒因子一類。這個報告認可的病毒約4000種，設有三個病毒目，64個病毒科，9個病毒亞科，233個病毒屬，其中29個病毒屬為獨立病毒屬。亞病毒因子類群，不設科和屬。包括衛星病毒和prion（傳染性蛋白質顆粒或朊病毒）。一些屬性不很明確的屬稱暫定病毒屬。
病毒在自然界分布廣泛，可感染細菌、真菌、植物、動物和人，常引起宿主發病。但在許多情況下，病毒也可與宿主共存而不引起明顯的疾病。
Cafeteria roenbergensis病毒
Cafeteria roenbergensis病毒的發現模糊了什麼是活的有機體，以及什麼是非生命之間的界限。Cafeteria roenbergensis，是一種世界上最大、最複雜的海洋病毒，該病毒主要感染那些吃海洋生態系統中非常重要和分布廣泛的浮遊生物的掠食者。大多數的病毒都是輕裝旅行的。它們僅僅攜帶了合成新病毒所需的少量基因，並依賴其宿主的機制來完成剩下的工作。2010年10月，加拿大溫哥華市不列顛哥倫比亞大學的Matthias G. Fischera和同事發現了一種被稱為Cafeteria roenbergensis飛病毒——它攜帶了令人難以置信的約73萬個脫氧核糖核酸（DNA）鹼基對，其中包括超過500個類似於基因的區域。2010年10月25日，研究人員在美國《國家科學院院刊》（PNAS）網絡版上報告了這一研究成果。這也使得這種病毒成為已知最大的海洋病毒，它甚至比一些細菌所具有的DNA還要多。
這種病毒主要感染那些吃海洋生態系統中非常重要和分布廣泛的浮遊生物的掠食者。這種病毒的基因組比一些細胞生物的基因組還大。此外，Cafeteria roenbergensis病毒成為目前（2010年10月）已知的世界最大海洋病毒和第二大病毒，排名僅次於淡水病毒——多噬棘阿米巴模仿病毒，後者擁有120萬個鹼基對。這種病毒可能還是一大組未知但是具有生態重要性的海洋巨型病毒的代表。
研究人員推測，與較小的病毒相比，例如愛滋病病毒（HⅣ）或皰疹病毒，這種病毒——能夠感染Cafeteria roenbergensis，後者是一種獵食性的單細胞有機體，能夠捕食海洋中的細菌和其他病毒——在其蛋白質的合成過程中扮演了一個更加積極的角色。研究人員指出，這種病毒擁有大量基因，這些基因通常被活細胞用於修復它們的DNA損傷以及合成蛋白質和糖。它還擁有編碼病毒複製需要但是必須從宿主生物那裡獲取的一些蛋白質的基因。
科學家一般不會把病毒劃歸為活的生物體，這是因為病毒無法獨立複製，但是像這樣的巨大病毒——具有它們自己的蛋白質合成機制以及其他通常在活體細胞中才能夠完成的功能——模糊了什麼是活的有機體，以及什麼是非生命之間的界限。唯一已知的較大病毒能夠感染一種淡水變形蟲，且被認為是一個近親。
流感病毒是根據其表面結構來命名的。H代表了血凝素，它的作用是讓病毒能夠結合宿主細胞；N代表了神經氨酸苷酶，其作用是讓已經自我複製的病毒從細胞中釋放出去。甲型流感中H可分為16個亞型，N可分為9個亞型。所有這些亞型的病毒都曾從鳥類體內分離出來過。
醫學分類一，呼吸道病毒及腸道病毒
麻疹病毒，脊髓灰質炎病毒，柯薩奇病素
二，蟲媒病毒及出血熱病毒
流行性乙型腦炎病毒，登革病毒，出血熱病毒，漢坦病毒，伊波拉病毒
三，狂犬病病毒與逆轉錄病毒
狂犬病病毒，人類免疫缺陷病毒，人類嗜T細胞病毒
四，肝炎病毒
A型肝炎病毒，B型肝炎病毒，C型肝炎病毒，丁型肝炎病毒，戊型肝炎病毒。
五，皰疹病毒
單純皰疹病毒，水痘-帶狀皰疹病毒，巨細胞病毒，EBV
六，其他病毒
人類乳頭瘤病毒，輪狀病毒，冠狀病毒，風疹病毒