南方水稻黑條矮縮病毒(SRBSDV)是最近出現的一種水稻病毒,已經蔓延整個亞洲。這種毀滅性的病毒引起水稻植株在不同生長階段,產生各種症狀。microRNA(miRNA),一群21-24 nt的RNA分子,是植物發育過程和應激反應過程的重要調節劑。SRBSDV感染必然會影響水稻miRNA的表達豐度,然而,尚未有報導說明這種新出現的病毒與宿主miRNA之間的相互作用。華南農業大學的周國輝教授帶領的研究團隊探討了miRNA調節水稻SRBSDV感染應答的機制以及水稻病毒疾病的發病機理*,研究成果發表在7月刊的Virus Research上。
研究人員選取了接種病毒3,9,15和20 dpi(days post-inoculation)四個時間點,利用miRNA微陣列分析(晶片分析項目由聯川生物承擔完成)確定各時間點水稻受SRBSDV感染後,miRNA應答表達模式。結果顯示,水稻植株中56個miRNA的表達水平發生了改變,這些變化根據各自的時間表達動力學可歸類到八個不同的調節模式。來自6個miRNA家庭(miR164,R396,R530,R1846,R1858和R2097)的14個miRNA在20dpi被顯著調節。研究人員用RT-qPCR檢驗在3,9和15 dpi,這些家庭成員和它們假定靶基因之間表達水平的相關性。miR164,R396,R530和R1846家族的一些成員被發現與各自的靶基因在SRBSDV感染後3至15days時的表達水平存在正相關或負相關,而在更多的情況下,水稻miRNA與它們的靶基因在接種後的階段是不相關的,這表明一些另外的因素可能介入了水稻的miRNA與靶基因之間的相互作用。
由miR164,R396,R530,R1846和R1858家族靶向結合的水稻基因的功能顯示,這些基因與症狀的發展有關。這些結果有助於深入了解miRNA介導的SRBSDV與水稻的相互作用,進一步闡明水稻miRNA表達與調控的複雜網絡和分子機制。(生物谷Bioon.com)
Donglin Xu, Guiping Mou, Kang Wang, Guohui Zhou MicroRNAs responding to southern rice black-streaked dwarf virus infection and their target genes associated with symptom development in rice (2014) Virus Research 190(22): 60-68 doi: 10.1016/j.virusres.2014.07.007 [article]
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