冠狀病毒RNA結構預測潛在藥物靶點
2020-11-12 藥渡近日，格羅寧根大學，華沙國際分子與細胞生物學研究所和萊頓大學的研究人員詳細研究了SARS-CoV-2冠狀病毒RNA基因組結構。 RNA結構是開發抗病毒藥物的潛在目標。結果於11月10日作為「突破性論文」發表在《Nuclear Acid Research》雜誌上。
在整個人類歷史中，細菌和病毒引起的傳染病一直存在。在過去的18年中，由於冠狀病毒（包括SARS和MERS）引起的嚴重急性呼吸道綜合症，導致全世界許多人死亡。最近，持續的COVID-19大流行已經奪走了100萬人的生命，表明迫切需要新的方法來對抗冠狀病毒感染。
COVID-19是由SARS-CoV-2（一種帶有線性單鏈正鏈RNA基因組的β冠狀病毒）引起的。與其他RNA病毒相似，SARS-CoV-2 RNA結構有望在冠狀病毒在人細胞中的複製中發揮關鍵作用。儘管具有這種重要性，迄今為止，僅研究了少數功能相關的冠狀病毒結構RNA元件。因此，IIMCB（波蘭）的研究人員與格羅寧根大學和萊頓大學（均在荷蘭）的科學家一起，使用各種先進技術對SARS-CoV-2 RNA基因組結構進行了廣泛的表徵。
這項研究由格羅寧根大學的Danny Incarnato博士協調進行，涉及RNA結構探測，以獲取完整的SARS-CoV-2冠狀病毒基因組在體外和在活感染細胞中的單鹼基解析度二級結構圖。隨後，研究小組確定了SARS-CoV-2 RNA序列中的至少87個區域，這些區域似乎形成了明確的緊湊結構。其中，至少有10％在冠狀病毒中處於強大的進化選擇壓力下。重要的是，這是首次確定整個冠狀病毒RNA（具有約30,000個核苷酸的最長的病毒RNA之一）的結構。
Incarnato解釋說：「我們首先在體外鑑定了病毒RNA結構，然後確認了它們在細胞內病毒RNA中的存在。這意味著我們的結果非常可靠。」同樣，在某些RNA結構中發現了「口袋」狀表位，因此可以設計小分子靶向這些口袋，從而阻礙病毒RNA的功能。 此外，由於許多結構在不同的冠狀病毒之間是保守的，這意味著靶向SARS-CoV-2的藥物也可能有效對抗未來的新病毒株。''
科學家們還發現了SARS-CoV-2 RNA的固有非結構化部分。 Incarnato解釋說：「這些可能是反義寡核苷酸治療的靶標。。
總之，這項合作研究為將來的工作奠定了堅實的基礎，該工作旨在開發潛在的小分子藥物來治療SARS-CoV-2感染以及其他冠狀病毒的感染。
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