Nature:測量單個皮膚細胞中積累的DNA突變可預測黑色素瘤風險

2020-12-05 生物谷

2020年10月13日訊/

生物谷

BIOON/---根據一項新的檢測單個皮膚細胞中DNA突變的研究,來自美國加州大學舊金山分校和猶他大學的研究人員指出,早在發現任何可疑的痣之前,就可以估計最致命的皮膚癌---

黑色素瘤

---的風險。相關研究結果近期發表在Nature期刊上,論文標題為「The genomic landscapes of individual melanocytes from human skin」。

鑑定人皮膚細胞中的突變,圖片來自Nature, 2020, doi:10.1038/d41586-020-02749-9。

陽光造成的皮膚損傷會隨著時間的推移而積累,但往往是肉眼不可見的。然而,皮膚細胞內的DNA也會在多年的太陽紫外線照射下積累損傷,這種損傷是可以測量的。

論文通訊作者、加州大學舊金山分校皮膚科助理教授A.Hunter Shain博士表示,這項研究中開發的檢測皮膚損傷的基因組方法可用於估計普通人群中個體的基線

黑色素瘤

風險,並對皮膚科醫生應該多久對某人進行一次癌症篩查提出建議。

Shain說,「事實證明,所謂正常的皮膚中的許多細胞充滿了與黑色素瘤相關的突變,這些突變是陽光照射的結果。

黑色素瘤

通常僅在幾十年的突變損傷積累後才會出現,但有些人的風險比其他人更大。有了我們開發的技術,那些積累突變最多的人可以被更密切地監測,並可以尋求更好地保護自己免受陽光照射。」

黑色素瘤

產生於一種稱為黑素細胞(melanocyte)的皮膚細胞中。黑素細胞製造黑色素,從而有助於保護包括大量存在的角質細胞在內的皮膚細胞免受陽光損傷。但是。當DNA損傷導致黑素細胞生長失控時,黑素細胞面臨著最大的風險。

根據美國癌症協會的統計,黑色素瘤的發病率正在上升。2020年,美國約有10萬人將被

診斷

為黑色素瘤,約有6850人死於這種癌症。白人一生患黑色素瘤的風險約為38分之1,黑人約為1000分之1,西班牙裔約為167分之1。

黑色素瘤

在早期發現時可以通過手術切除,但一旦擴散就很難治療。

在這項研究中,這些作者一次一個細胞地對皮膚樣本中的黑色細胞DNA進行測序,統計突變情況,重點是少數促進黑色素瘤出現和生長的突變。這些皮膚樣本來自六個人:兩個黑色素瘤倖存者和四個從未患過

黑色素瘤

的人的屍體。所有的人都是白人。這些作者分析了來自背部、頭部、腿部、肩部、臀部和腳部的共133個黑素細胞的DNA。

這些作者發現,相比於從未患過黑色素瘤的人的皮膚中的黑素細胞,來自前癌症患者黑色素瘤附近的正常皮膚的黑素細胞有顯著更多的突變,包括

黑色素瘤

相關的突變。

Shain說,有很多痣的人仍然應該接受篩查,但只有30%的

黑色素瘤

產生於已經存在的痣。

Shain說,「黑色素瘤真地可以憑空出現。我們在這項研究中發現,正常皮膚中含有很多已表現出一些癌症相關突變的黑素細胞。從本質上講,我們發現了70%的

黑色素瘤

前體並不是由先前存在的痣產生的。」

Shain說,雖然更多的陽光照射會導致更高的風險,但這種相關性是複雜的,這還與膚色、固有的DNA修復能力和其他因素有關。兒童時期的曬傷可能比成年時期的職業暴露(如戶外工作)帶來更大的風險。Shain說,「測量突變可能是一種衡量所有這些變量對

黑色素瘤

風險的淨影響的好方法。」

奇怪的是,與長期暴露在陽光下的區域(如面部)相比,

黑色素瘤

更經常發生在皮膚的間歇性暴露區域,如背部或大腿。與這一規律相一致的是,Shain的研究團隊發現背部和四肢中的黑素細胞發生的突變比頭頸部皮膚中的更多。

Shain說,這項研究中進行的單細胞分析使得人們能夠關注皮膚中相對稀疏的黑素細胞,並識別出具有癌前突變的細胞,不過完成這一目標需要將新的技術方法組合在一起。

由於與包含眾多細胞的典型生物樣本相比,單個細胞中的DNA數量太少,因此必須對DNA進行擴增以獲得足夠的數量。用於擴增DNA的酶會引入錯誤,但Shain團隊使用了額外的實驗室方法來更好地區分擴增錯誤和真正的突變,並開發了計算機算法來進一步提高這種分析的準確性。

Shain說,「我們期待,這些方法的精簡、自動化版本有朝一日將廣泛用於測量

黑色素瘤

的風險,並可作為癌症篩查建議的基礎。」(生物谷 Bioon.com)

參考資料:1.Jessica Tang et al. The genomic landscapes of individual melanocytes from human skin. Nature, 2020, doi:10.1038/s41586-020-2785-8.

2.Seeds of cancer in normal skin
https://www.nature.com/articles/d41586-020-02749-9

3.Risk of deadly skin cancer may be gauged by accumulated DNA damage
https://medicalxpress.com/news/2020-10-deadly-skin-cancer-gauged-accumulated.html

相關焦點

  • Nature:檢測黑素細胞基因組,有望預測黑色素瘤風險
    皮膚黑色素瘤是由黑色素細胞(皮膚中產生色素的細胞)引起的皮膚癌,光照是形成黑色素瘤的主要誘變因素。對黑色素瘤腫瘤組織的測序發現,體細胞突變與之密切相關,因此早期診斷意義重大。但目前尚不清楚這些突變是否發生在腫瘤形成過程中,以及在腫瘤轉化過程中其積累速度是否加快。由於黑色素細胞在皮膚中稀疏分布,整體細胞測序並不適用於檢測黑色素細胞突變。
  • Nature genetics:轉座子突變分析發現黑色素瘤驅動基因
    beauty(SB)轉座子造成的突變能夠促進BRAFv600e突變小鼠黑色素瘤的發生,同時還發現了1232個可能驅動黑色素瘤發生的候選癌基因。 黑色素瘤是一種轉移性極高的惡性皮膚腫瘤,其發生可能受到環境和基因的共同影響。在黑色素瘤中,BRAFv600e是一個重要的基因突變,對於黑色素瘤的發生具有重要驅動作用。雖然接近一半的人類黑色素瘤病人都攜帶BRAFv600e突變,但協同這些突變共同促進黑色素瘤發生的基因一直沒有研究。
  • Nature:可視化觀察黑色素瘤早期轉移,鑑定出一種新的治療靶標
    肺部淋巴管(綠色)中的轉移性黑色素瘤細胞(紅色),圖片來自CNIO。2017年7月3日/生物谷BIOON/---皮膚黑色素瘤(cutaneous melanoma)是一種最為致命性的皮膚癌。對它的早期檢測是特別重要的。
  • 淋巴可保護轉移性黑色素瘤細胞免於肥大症
    淋巴可保護轉移性黑色素瘤細胞免於肥大症 作者:小柯機器人 發布時間:2020/8/21 15:02:45 美國德克薩斯大學西南醫學中心Sean J. Morrison研究組取得最新進展。
  • 新型TCR療法tebentafusp治療葡萄膜黑色素瘤
    tebentafusp被設計成專門靶向gp100,這是一種在黑色素細胞和黑色素瘤中表達的譜系抗原。tebentafusp是使用Immucore公司ImmTAC技術平臺開發的第一個分子,旨在重新定向和激活T細胞以識別和殺死腫瘤細胞。此外,美國FDA已授予tebentafusp治療葡萄膜黑色素瘤(UM)的孤兒藥資格(ODD)和快速通道資格(FTD)。
  • Cell:黑色素瘤的異質性阻礙了有效的免疫反應
    在一項新的研究中,來自以色列魏茨曼科學研究所和美國國家癌症研究所等研究機構的研究人員發現在黑色素瘤中,如果腫瘤中的細胞能夠分化為更加多樣化的亞型,那麼它就不太可能受到免疫系統的影響,這就降低了免疫療法發揮療效的機會。這些研究結果可能為設計針對癌症患者的個性化治療方案提供了更好的工具,並且為研發抗癌疫苗指明了新的途徑。
  • Nature:黑色素瘤如何對抗腫瘤免疫做出反應?
    -γ(IFNγ)信號,並可以改善黑色素瘤患者對檢查點免疫療法的反應。然而,在黑色素瘤患者中,使用抑制IDO1與阻斷PD1通路相結合的臨床試驗,與單獨的PD1通路阻斷相比,並沒有提高治療的療效,這表明我們對IDO1的作用以及隨之而來的色氨酸在mRNA翻譯和癌症進展中的降解不完全了解。
  • MDM2拮抗劑可抵消黑色素瘤對CDK4/6抑制劑的抗性
    在一項新的研究中,來自美國退伍軍人事務部和範德比爾特大學林格拉姆癌症中心研究人員確定了一種針對黑色素瘤患者的潛在二線治療方案。他們報導了多種小鼠模型和人類腫瘤切片培養測定中的腫瘤消退。論文共同作者Ann Richmond博士說,「40%以上的黑色素瘤表現出CDKN2A缺失或突變,CDKN2A是一個調節CDK4/6和MDM2來控制細胞周期的基因。」儘管CDK4/6的激活是黑色素瘤產生的關鍵機制,但是CDK4/6抑制劑對黑色素瘤的效果不同於乳腺癌。Vilgelm及其同事們試圖了解其中的原因。
  • 皮膚衰老改變胞外基質成分 可促進黑色素瘤轉移
    皮膚的改變是衰老的最顯著特徵之一,人類皮膚包括表皮層和真皮層,在真皮層中包含許多由真皮成纖維細胞分泌的富含膠原蛋白的細胞外基質成分。年輕的真皮成纖維細胞能夠分泌許多細胞外基質成分,包括蛋白聚糖、糖蛋白和軟骨連接蛋白。HAPLN1是一種透明質酸和蛋白聚糖類連接蛋白,也是分泌的細胞外基質成分中含量最高的一種蛋白成分。
  • 新型TCR療法tebentafusp治療葡萄膜黑色素瘤...
    tebentafusp被設計成專門靶向gp100,這是一種在黑色素細胞和黑色素瘤中表達的譜系抗原。tebentafusp是使用Immucore公司ImmTAC技術平臺開發的第一個分子,旨在重新定向和激活T細胞以識別和殺死腫瘤細胞。
  • 高危3期黑色素瘤術後輔助治療!諾華Tafinlar+Mekinist結果公布
    結果顯示,在高危III期BRAF突變陽性黑色素瘤患者中,手術切除黑色素瘤後使用靶向組合療法Tafinlar(dabrafenib)與Mekinist(trametinib)進行術後輔助治療,可提供長期、持久的無復發生存(RFS)益處:有一半以上(52%)的患者在5年內存活且無復發。
  • ...膜黑色素瘤進軍_葡萄膜黑色素瘤_納武利尤單抗_伊匹木單抗_醫脈通
    前言:葡萄膜黑色素瘤是黑色素瘤中一種罕見類型,對於轉移性的葡萄膜黑色素瘤至今尚無標準治療方案,免疫單藥對其療效甚微。近期JCO報導一項單臂的II期研究,探索了免疫雙藥是否可帶來療效的改善。葡萄膜黑色素瘤是最常見的成人原發性眼內惡性腫瘤,約佔每年確診的黑色素瘤總數的5%左右。
  • Cancer Dis:皮膚衰老改變胞外基質成分 可促進黑色素瘤轉移
    2018年11月7日 訊 /生物谷BIOON/ --皮膚的改變是衰老的最顯著特徵之一,人類皮膚包括表皮層和真皮層,在真皮層中包含許多由真皮成纖維細胞分泌的富含膠原蛋白的細胞外基質成分。年輕的真皮成纖維細胞能夠分泌許多細胞外基質成分,包括蛋白聚糖、糖蛋白和軟骨連接蛋白。
  • Nature:抑制U34-tRNA酶有望治療對靶向療法產生抵抗性的惡性黑色素瘤
    2018年6月29日/生物谷BIOON/---在一項新的研究中,來自比利時列日大學等研究機構的研究人員發現一種新的治療對已對靶向療法產生抵抗性的惡性黑色素瘤的機會。他們揭示出惡性黑色素瘤細胞能夠重編程它們的蛋白合成機制,並且在產生抵抗性期間對一個新的修飾tRNA的酶家族上癮。
  • 維生素D受體基因突變與黑素瘤風險相關
    維生素D受體基因突變與黑素瘤風險相關
  • 納米脂質體攜帶特效藥可靶向殺滅黑色素瘤細胞
    核心提示:研究人員通過研究開發了一種納米顆粒,其可以將治療黑色素瘤的藥物直接運輸到癌症患處。藥物可以被包裝裝載於脂質球中,這種脂質球明顯小於頭髮的寬度,這就可以使得脂質球溶解於血流中從而抑制副作用的產生。包含藥物的納米顆粒隨後會隨著血流運輸至腫瘤患處,在腫瘤患處不斷積累並且釋放藥物殺滅癌細胞。
  • 科學家發現新型超突變:一種酶劫持正常DNA修復過程產生突變霧 幫助...
    最著名的局部超突變類型稱為突變陣雨或雷暴,這種情況很少見,它會導致在一個小區域內積累許多突變,例如單個基因。來自巴塞隆納IRB基因組數據科學實驗室的研究人員,由ICREA研究員Fran Supek領導,發現了一種名為「突變霧」的新型超突變,它可以在每個細胞中產生數百個突變。這些突變廣泛分布,但在基因組中最重要的基因所在區域(所謂的常染色質)積累。
  • Cell Rep:不同腫瘤細胞可相互協作促進惡性黑色素瘤的擴散
    來自曼徹斯特大學的研究人員表示,皮膚癌細胞可以互相合作實現在機體中的快速擴散,某些黑色素瘤細胞生長速度尤其之快,但這些癌細胞卻並不擅長於侵襲周圍的組織,而其它黑色素瘤細胞則完全相反,它們雖然生長緩慢但是可以快速實現周圍組織的侵襲,相關研究為開發新型藥物來治療黑色素瘤提供了一定幫助。
  • 速遞丨靶向YAP介導的T細胞抑制或將改善BRAF突變型黑色素瘤患者預後
    獲取MCF7,MDA-MB231和A172細胞並在補充10% FBS的DMEM中培養。獲取HT29,KM12和A549細胞,並在補充10% FBS的RPMI1640中培養。獲取前,通過Sanger測序證實黑色素瘤細胞系BRAFV600E突變。連續處理2μMPLX4032兩個月,產生BRAFi耐藥性A375SM細胞。在含有2μMPLX4032的培養基中培養BRAFi耐藥性細胞系。
  • Science:利用單細胞RNA測序分析黑色素瘤
    在一項新的研究中,通過與麻省理工學院副教授、單細胞分析先鋒Alex Shalek合作,Garraway團隊研究黑色素瘤,即最為致命的皮膚癌。他們的研究有助揭示腫瘤的多樣性細胞環境,這不僅對腫瘤中的癌細胞異質性,也對可能影響癌症行為和對治療作出的反應的T細胞和其他細胞,提供深入認識。