系統是由相互作用和相互依賴的若干組成部分結合成的具有特定功能的有機整體；這些組成部分作為分系統，又是更大系統的組成部分；系統工程是組織管理系統的規劃、研究、設計、製造、實驗和使用的科學方法。錢學森系統工程思想的理論精髓可以歸納為：頂層設計、科學管理、自主創新、全國協作、綜合集成。系統工程思想是錢學森晚年的重要理論建樹和思想結晶，是支撐其人生歷程中第三座科技創造高峰的代表性成果。在全面深化改革新的歷史起點上，重溫錢學森系統工程思想的理論內涵和現實情懷，具有重要時代價值。
對推進中國特色社會主義事業的歷史啟迪
錢學森系統工程思想的時代機遇。堅持和完善中國特色社會主義制度、推進國家治理體系和治理能力現代化，全面深化改革，離不開系統性思維，離不開堅持全國一盤棋解決問題。習近平總書記指出：「全面深化改革是一項複雜的系統工程，需要加強頂層設計和整體謀劃，加強各項改革關聯性、系統性、可行性研究。」就理論內涵而言，這與錢學森系統工程思想在認識論和方法論上高度契合。
錢學森1978年9月發表的《組織管理的技術——系統工程》一文是系統工程中國學派的奠基之作，而1979年1月《組織管理社會主義建設的技術——社會工程》一文的發表則是他將系統工程思想從工程系統工程向社會系統工程、從工程管理向社會和國家管理推廣，更好實現系統工程社會化服務職能的標誌性成果。
錢學森認為，系統是由相互作用和相互依賴的若干組成部分結合成的具有特定功能的有機整體；這些組成部分作為分系統，又是更大系統的組成部分；系統工程是組織管理系統的規劃、研究、設計、製造、實驗和使用的科學方法。錢學森系統工程思想的理論精髓可以歸納為：頂層設計、科學管理、自主創新、全國協作、綜合集成。與西方系統工程強調「工程」相比，錢學森系統工程思想更強調組織管理的重要性，能夠更好地發揮中國特色社會主義制度的優越性。
錢學森系統工程思想的歷史張力。經過40餘年的推廣、應用和發展，系統工程已經從概念走向理論、從理論走向實踐，從航天型號研製部門走向國家決策機構、從工程技術型號設計走向國家管理頂層設計，衍生出軍事系統工程、農業系統工程、社會系統工程、教育系統工程、法治系統工程等眾多分支學科，滲透到社會的各個領域，成為當今中國社會廣為人知的高頻詞彙之一，並納入了國家公共話語體系。作為對系統工程思想和方法的創新發展，錢學森社會系統工程思想的理論價值在於順應現代科學技術發展客觀趨勢，成為集成多種學科、涉及現代科學技術不同層次，規劃、研究、管理社會的科學方法論；其實踐價值在於面向我國社會主義現代化建設，具有中國特色和時代特徵，旨在認識社會、改造社會、建設社會和管理社會。系統工程無論在思想方法還是工作方法上對我國經濟、政治、文化、社會、生態文明建設等都產生了極其重要的影響。
對構建中國學術話語體系的實踐探索
習近平總書記要求廣大哲學社會科學工作者按照立足中國、借鑑國外，挖掘歷史、把握當代，關懷人類、面向未來的思路，著力構建中國特色哲學社會科學，在指導思想、學科體系、學術體系、話語體系等方面充分體現中國特色、中國風格、中國氣派。錢學森晚年創建現代科學技術體系的過程，實質上是構建哲學社會科學中國學派、提升中國學者學術話語權、向世界發出中國聲音的過程。
錢學森系統工程思想體現了中國特色，做到了整體論與還原論的辯證統一。黨的十九大報告提出，要為解決人類問題貢獻中國智慧和中國方案。錢學森系統工程思想就是在中國特色社會主義偉大實踐中形成並發展起來、集其畢生心智的重大理論創新成果，蘊含著顯著的中國基因，體現了鮮明的中國特色。錢學森通過總結自身長期從事航天系統工程管理實踐，以馬克思主義哲學為指導，根據我國社會主義建設具體實際，提煉出具有中國特色的系統工程思想，形成了系統工程中國學派。這一理論的主要特點是充分發揮中國特色社會主義的制度優勢，在中國共產黨領導下，以馬克思主義哲學為指導，將整個社會作為一個開放的複雜巨系統，以綜合集成法解決社會主義建設過程中面臨的各種複雜性問題。
錢學森系統工程思想與西方系統工程思想雖然在探索整體與部分關係以及研究各組成要素、組織結構、信息流動和控制機理等方面有相似的一面，但彼此在理論內涵、思維模式、目標要求、實踐形式等層面存在很大不同。錢學森系統工程思想的顯著特色在於「中國化」：第一，注重總體設計。即從國家和民族的高度來思考社會主義建設問題，在做好頂層設計、實現所要達到的目標時，一方面從組織領導上突出民主集中制和黨的領導，另一方面在具體落實上傾全國之力集中攻關，體現了中國特色社會主義的制度優勢和組織優勢。第二，強調內部協調。社會主義建設本身就是一個大的系統工程，牽涉經濟、政治、文化、社會和生態文明等方方面面，協調發展是系統運行的本質要求。第三，植根傳統文化。中國傳統文化為錢學森系統工程思想提供了文化滋養和思維方式。錢學森系統論建立在中國傳統整體論基礎上，並做到了東方整體論與西方還原論的辯證統一。因此，錢學森系統工程思想具有鮮明的民族性和本土性。
錢學森系統工程思想彰顯了理論自信，做到了理論之維與價值之維的有機結合。習近平總書記在主持中共中央政治局第二十次集體學習時指出，必須高度重視理論的作用，增強理論自信和戰略定力，對經過反覆實踐和比較得出的正確理論，要堅定不移堅持。系統工程思想正是發端於中國航天實踐並在我國經濟社會生活中得到檢驗的「正確理論」。就學術貢獻而言，錢學森堅持以我國「兩彈一星」重大科學技術工程為理論原點，著眼服務於中國社會主義建設事業，在系統科學領域努力探索構建具有中國特色、彰顯自身特質的學科體系、學術體系、話語體系。這些系統性的創新成就使中國系統科學贏得了實質性自我學術主張和學術話語權，並在世界學術之林創立了具有「中國學派」身份標籤的系統科學體系。在此意義上，錢學森是一位使我國哲學社會科學形成自身特色和優勢的先行者和拓荒者。關於系統工程的發展前景，晚年錢學森曾指出，系統科學是20世紀中葉興起的一場科學革命，而系統工程的實踐又將引起一場技術革命，這場科學和技術革命在21世紀必將促發組織管理的革命。
對完善科學決策機制的現實意義
從「系統五性」到「五位一體」：錢學森社會系統工程思想的當代呈現。「五位一體」總體布局是黨中央頂層設計執政理念的具體體現。只有堅持「五個建設」全面推進、協調發展，才能形成經濟富裕、政治民主、文化繁榮、社會公平、生態良好的發展格局，把我國建設成為富強民主文明和諧美麗的社會主義現代化強國。全面推進「五位一體」總體布局重在統籌，統籌需要以科學的方法論為引領，錢學森社會系統工程思想可以為「五位一體」總體布局提供有理論價值和實踐意義的借鑑。
錢學森社會系統工程思想是錢學森系統工程思想的社會化拓展。社會系統作為開放的複雜巨系統，具有開放性、複雜性、層次性、整體性和動態性五重屬性。經濟建設、政治建設、文化建設、社會建設、生態文明建設「五位一體」總體布局是黨中央全面深化改革的一項重大戰略部署，成為新時代中國特色社會主義建設的一項重大社會系統工程，同樣具有開放性、複雜性、層次性、整體性和動態性特徵。結合「五位一體」總體布局，認真審視系統工程在國家治理這一社會管理系統中的重要作用發現，系統工程不僅是一種技術和方法，更是一種具有普遍價值和意義的科學方法論。這就要求我們在解決複雜問題時運用系統的觀點思考問題，用科學的方法求解問題。而針對國家治理過程中一些牽一髮而動全身、具有開放複雜巨系統特徵的社會系統工程問題，錢學森創立的「從定性到定量綜合集成的方法」可以成為解決此類問題的科學方法。
從「綜合集成」到「科學決策」：新時代領導幹部隊伍建設的理論召喚。黨的十九屆四中全會以國家治理體系和治理能力現代化為主題，向全黨提出了新的要求。除了制度體系，還有一個很重要的決策體系。錢學森提出定性與定量相結合的綜合集成方法之初衷，在於建立科學有效的決策機制。綜合集成方法的實質是把智慧體系、知識體系、技術體系有機結合起來，構成一個高度智能化的知識—智慧融合體系。其最終實踐形式是一個集專家、數據+信息+知識、計算機於一體的巨型智能系統——從定性到定量綜合集成研討廳體系。錢學森指出，如果將定性與定量兩種研究方法結合起來，使專家群體、數據和各種信息、計算機技術三者集成為一個系統，就可以有效處理複雜巨系統問題。他認為，這是研究處理開放複雜巨系統問題當前唯一可行的方法。在百年未有之大變局時代背景下，面對全球化進程受阻、國際格局不確定因素日益增多、國內各種新舊矛盾疊加、社會大系統循環面臨多重挑戰等情況，我們更需要科學決策。
堅持底線思維，著力防範化解重大風險，關鍵在領導幹部。如何提高領導幹部的系統科學素養及其決策能力和水平，是我國當前能否運用科學的思維方法貫徹執行黨中央指導方針的關鍵因素。上世紀七八十年代，錢學森應邀赴中央黨校為各級領導幹部作了關於現代科學技術體系、社會主義建設的大戰略問題等多場專題報告。其中很多內容涉及如何加強領導幹部隊伍建設、提高領導幹部素質和能力、實現領導決策科學化民主化等方面。他多次提出，從我國現代化建設的要求看，學習領導科學，努力實現領導工作的科學化，是在新的歷史條件下每一個領導幹部面臨的重要而又必須解決的新課題。