TMB專家共識發布|腫瘤突變負荷檢測及臨床應用中國專家共識

2020-11-19 闊然生物醫藥科技

專家共識一:TMB 一般是指特定區域內體細胞非同義突變的個數,通常用每兆鹼基有多少個突變表示(XX 個突變/Mb)。TMB 評估受樣本質量和數量、檢測基因組大小、生信分析方法等多種因素影響,臨床應用前應了解TMB 的適用範圍。不同檢測方法獲得的TMB 應進行系統評估,判斷是否具有可比性。TMB 數值可反映腫瘤內產生腫瘤新抗原的潛力,與DNA 修復缺陷密切相關,在多種腫瘤中dMMR和MSI-H 患者具有較高的TMB。


專家共識二:tTMB 是一個新興的獨立ICIs 治療療效預測標誌物,與多種腫瘤類型ICIs 單藥或兩種ICIs 聯合治療的療效相關,已證實可作為泛癌種免疫治療療效的預測標誌物。推薦既往標準治療後疾病進展且沒有更好替代療法的實體瘤患者,尤其是高TMB 的患者進行TMB 檢測,有助於擴大免疫治療獲益人群。中國人群TMB 的獨立預測價值仍需更多前瞻性研究驗證。


專家共識三:目前研究證據顯示在NSCLC 中bTMB與tTMB 具有顯著相關性,但bTMB 檢測無統一標準。多項回顧性研究發現高bTMB 與NSCLC 患者接受單藥ICIs 治療獲益顯著相關,但尚未獲得高級別前瞻性臨床研究證實。

專家共識四:推薦使用近期石蠟包埋腫瘤組織樣本進行tTMB 檢測,待檢測組織應首先完成病理質控並確保惡性腫瘤細胞數能夠滿足檢測要求。為過濾胚系突變對後續tTMB 評估的影響,應採集患者外周血、唾液或正常組織作為對照樣本。建議優先採用NMPA 批准上市的核酸提取試劑盒進行基因組DNA 提取,tTMB 檢測實驗室應根據實際需求建立合適的DNA 樣品質控標準和操作流程,對待測DNA樣品純度、濃度及片段化程度進行嚴格質控。腫瘤原發灶與遠處轉移灶組織均可用於tTMB 評估。



專家共識五:採用靶向測序Panel 進行TMB 評估時,建議與WES 評估的TMB 進行一致性評價。靶向測序Panel 覆蓋範圍原則上不應約1.0 Mb,最低有效測序深度應≥500層。建議進行TMB 檢測的靶向測序Panel 儘可能涵蓋患者更多的其他分子遺傳信息,包括可指導靶向治療的驅動基因突變、與基因變異產生相關的免疫治療正向預測因子以及可能的免疫治療負向預測因子。目前已有多款NGS 測序

儀獲國家NMPA 批准用於臨床基因檢測,不同實驗室可依據樣本量、時效要求選擇不同測序平臺。


專家共識六:基於靶向測序Panel 的TMB 檢測應以WES 檢測為金標準,納入影響蛋白質編碼的體細胞突變,應保證檢出突變頻率>5%的體細胞突變,以保證TMB 檢測值的準確性和穩定性;應依託ICIs療效隨訪資料庫對基因組比對和突變檢出算法開展標準化研究;Panel 檢測區域可影響TMB 值,應通過至少1 000 例WES 數據予以校正。同時建議使用對照樣本過濾胚系變異。




專家共識七:
TMB 值在不同癌種中存在顯著差異,應依據ICIs 臨床療效確定閾值,才能最大可能篩選出ICIs 治療的潛在獲益人群。值得注意的是,不同靶向測序Panel 的TMB 檢測體系之間TMB 閾值不能通用。


專家共識八:TMB 報告內容除重點描述TMB 計算原則和數值外,還應針對癌種的免疫治療意義進行解讀;同時還需系統評估Panel 檢測的各種驅動基因突變情況,以全面解患者的腫瘤生物學特徵,建議應用分子腫瘤診治專家組模式(MTB)進行臨床輔助決策。

闊然生物醫藥科技(上海)有限公司成立於2015年,總部位於上海,作為腫瘤精準醫療領域踐行者,闊然擁有兩家(上海、徐州)國家衛生健康委員會認證的醫學檢驗實驗室,以及享譽業界、多學科交叉的專家團隊,擁有科技發明專利8項、軟體著作權18項,尤其是測序Panel和多標免疫組化產品組合、免疫微環境定製化檢測及腦膠質瘤基因檢測方面,在全國具有不可替代的優勢。憑藉「產品+服務」的業務形態和「預防、篩查、個性化診療」的業務組合,闊然基因服務數萬名腫瘤患者和高危人群,以及數百家科研機構、醫院。2019年榮獲「上海市高新技術企業」認定。


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