一個好的框架應該是靈活的、低耦合的，所以配置系統是重要的也是必需的。ThinkPHP提供的配置核心都是基於PHP數組的。在ThinkPHP中，配置文件都是自動加載的（也就是不用顯示require），加載順序為：默認配置->公共配置->模式配置->調試配置->場景配置->模塊配置->擴展配置->動態配置。加載順序優先級從左往右依次遞增，也就是說「動態配置」是最高優先級，如果左邊的配置和右邊有重複，系統會使用右邊的值。
默認配置是ThinkPHP「大道至簡，開發由我」宗旨的核心體現，旨在減少開發的編碼工作而設計的。默認情況下，該配置文件路徑為ThinkPHP/Conf/convention.php，對於一個新的Web項目，，除了資料庫配置可能要自定義之後，幾乎不需要額外的配置定義。所謂公共配置，指的是一個應用下的所有模塊都會加載的配置文件。默認情況下，公共配置的文件路徑為Application/Common/Conf/config.php。針對配置的操作無非讀寫而已，ThinkPHP提供了很方便的配置操作函數C（大寫字母C）。ThinkPHP按照默認的順序加載完配置之後，配置全局有效，在框架作用範圍內（一般指應用目錄下），所有配置都可以直接使用C函數讀取（包括ThinkPHP默認配置）。作為配置操作的一個重要函數，不得不單獨提下C函數。打開文件ThinkPHP/Common/functions.php，可以看到C函數定義如下：
可以看到ThinkPHP的注釋是很詳盡的，就算是沒有使用過C函數的程式設計師，看完注釋之後對C函數的使用方法應該是沒有問題的。C語言函數算法說明如下：
（1）定義static $_config變量，static方式定義的變量本次請求內全局有效。
（2）如果傳入的$name為空，返回所有配置；如果不為空，進入第3步。
（3）判斷$name是否為字符串，如果是，進入第4步；否則進入第12步。
（4）判斷$name中是否有「.」,如果沒有，進入第5步；否則進入第8步。
（5）將$name轉換為大寫，如果$value為null，進入第6步；否則進入第7步。
（6）判斷是否存在名為$name的配置，如果存在，則返回該配置的值；否則返回默認值。
（7）將名稱為$name的配置值設為$value,並返回null。
（8）將$name分割為數組，加入傳入的$name為「user.name」，分割完之後$name為['user','name']。
（9）將$name數組的第1個元素「user」轉換為大寫，如果傳入的$value為null，則進入第10步，負責進入第11步。
（10）判斷是否存在$_config[$name[0]][$name[1]]（本例中為$_config['user']['name']）的配置，如果存在，返回$_config[$name[0]][$name[1]]的值，否則返回null。
（11）將名稱為$_config[$name[0]][$name[1]](本例中為$_config['user']['name']）的配置值設為$value,並返回null。
（12）如果$name是數組，則將該數組的全部鍵名轉換為大寫後合併到全局配置中去。
（13）最後返回null是為了防止非法調用函數。
通過源碼分析發現，ThinkPHP的配置名稱只有一級是不區分大小寫的，也就是說C（『DATA_CACHE_TYPE』）和C（『data_cache_type』）的返回值是相等的，但是二級配置是區分大小寫的，也就是說C（『user.name』）和C（『user.NAME』）是不相等的。另外，關於無限級配置，因為源碼中可以看到ThinkPHP在對配置的處理只處理到二級，不支持二級以上配置。