藻類植物共有23000餘種，而淡水藻類在自然界分布很廣，江河、湖泊、水庫、小溪、池塘、積水坑、沼澤、冰雪、溫泉、土壤、巖石、樹皮、牆壁乃至花盆外壁上，都有它們的蹤跡。有時候在江、湖泊或者池塘上會看到水體呈現藍色、綠色的現象，被稱為「水華」。這是藻類在受到有機汙染時大量爆發造成的，2008年的太湖藍藻水華事件，使許多地下水受到威脅，太湖附近的人們對水產生了恐懼，給他們的生產生活造成了巨大災害與損失。
對浮遊藻類、附生藻類及氣生、亞氣生藻類的採集方法有所不同，利用浮遊網對浮遊藻類進行採集，或者用標本瓶灌入；附生藻類多用鑷子直接撈取；可用小鏟或採集刀刮取氣生藻類，並放入標本袋中。測定海拔、水溫、pH等，為此在採集過程中制定了採集記錄卡，在採集過程中還需要考慮的氣候、風向、位置等地理方面的因素，這樣既有利於採集方法的選擇使用，也對地理一些知識進行實踐性利用。
藻類植物採集時，選取採樣點很重要。第一，要確定其地理位置，包括經緯度、所處的方位。可以藉助GPS進行定位，很簡單的讀取數據。但是，也可以利用物體的影子和正午太陽高度來確定採樣點的地理位置，用竹竿影子和正午太陽高度的大小、北京時間等來確定其經緯度，例如：採集時若正好是6月22日，北京時間1點整，在採樣點立一豎直的竹竿，觀測到影子的長度最短，並利用量角器測出太陽光線與地平面的夾角為73.5°。
分析：影子最短即當地正午地方時12時整，而北京時間為13時，由此推斷採樣點的經度為105°E,根據太陽光線與地平面的夾角，推斷出其緯度為39°56′N。第二，觀察附近的地形地貌及植物的生長狀況，其海拔走勢如何，觀察植物在不同的海拔高度生長是否一樣，海拔越高越會呈現出高緯度的植物類型，從而可以加深理解植物生長與緯度、光照的關係等課堂理論知識，利用以上方法既可以解決在沒有GPS定位儀的情況下準確判斷採樣點的地理位置，也可以初步判斷採樣點選擇是否合適。
在採樣設置好以後，還可以觀察當地的人們生產生活狀況。採樣點若是河流，需要了解一下當地工業布局是否合理，是處於採樣點的上遊還是下遊方向，工業廢水、生活用水排入河流進行汙染後則可以改變藻類的生活環境。這樣就可以通過水體的顏色，初步判斷藻類類群組成。例如水色很綠，可能浮遊綠藻很多；如水色為茶褐色，可能含有很多硅藻、隱藻或甲藻；如果水面有一層薄的綠膜，可能是裸藻形成的「水華」；水面如果漂浮著藍綠色團塊，可能是藍藻；淺水溝渠或水溝底泥表面，如有一層醬油褐色，則多為硅藻等等。
在某一個地點進行藻類採集時，還要考慮當地的氣候大環境。由於每個季節氣壓帶和風帶隨著太陽直射點的移動而移動，以及海陸熱力差異所造成盛行的風向不同，浮遊藻類的生長地點則也隨著風向的改變而有一定的變化。每個季節對同一水域內的藻類進行採集的時候，需對這一時間段內的風向進行觀察，以我國為例，在夏季的時候，受海陸熱力差異的影響，北半球被低壓控制，多盛行東亞季風的夏季風，由海洋吹向陸地，高溫潮溼；
冬季，為極地大陸氣團或變性極地大陸氣團所控制，盛行西北、北和東北風，由大陸吹向海洋，寒冷乾燥。那麼就可以根據這一特點在不同季節採集時，一般則是在主導風向的下行風方向進行採集，許多藻類隨著水的流動進行聚集，這樣就可以獲取藻類的種類多樣化，生物的含量相應也愈多。夏季採集時，可以在採樣點的西南、東南及南風的下行風處進行採集；冬季，若不結冰的時候，在採樣點西北、東北和北風等主導風向的下行風向處進行採集。
由於我國地處北半球，季風氣候顯著，夏季的主要天氣特徵是高溫多雨，降水較多，使許多大江、大河水位上漲，不斷的衝刷岸邊，含沙量增加，水體變的渾濁，採樣點所處的水域亦會出現相同的現象，可以初步判斷藻類的數量則有可能減少，採集時就需要增加浮遊網撈取次數，以獲取藻類最大量。冬季的時候，降水較少，在北方許多大江、大河都結冰封凍，喜歡冷水環境的藻類就會大量繁殖。
若是選在河流中進行藻類植物採集時，觀察河流的岸堤衝刷情況：若是一條自東向西流向的河流，採集時就應該在靠近南岸附近進行採集，由於地轉偏向力的原因，許多藻類隨之沉積在南岸；河流流向若是南北方向的，泥沙帶著藻類則多在西岸沉積。了解了這一點，採集時就可以在藻類有可能沉積的地點進行採集，有時也可以不借用採集網等其他工具，省時省力。
通過以上的介紹，將課堂上所學到的地理知識應用到採集藻類植物的實踐活動中，也對藻類採集有一定的針對性。了解到藻類在自然界的分布、生長情況，認識到「水華」爆發時水體環境的狀況，並且在野外實踐中觀察各種地理現象，可以搜集和積累大量的感性材料，將其與我們在課堂上學到的理論知識有機地結合起來。這樣，不僅認識到地理科學與人類的生活和生產有著密切的聯繫，而且，對增加自己的觀察能力、分析問題和解決問題的實際能力，以及對擴大我們的地理知識領域、鍛鍊學生的意志等方面，都有著積極的促進作用。