本期為大家推薦一個專門查詢螢光定量PCR引物的網站:PrimerBank,
網址為:https://pga.mgh.harvard.edu/primerbank/,下面以小鼠GAPDH基因為例展示該網站的使用方法。
1.點擊Search by下拉選項,選擇NCBI Gene Symbol(也可以選擇其他項,如NCBI Gene ID,需要到NCBI上查到該基因的ID);
2.點擊Species下拉選項,選擇Mouse(Species下拉選項僅有Mouse和Human);
3.在For text中輸入GAPDH(若第2步選擇的是NCBI Gene ID,這裡輸入小鼠GAPDH基因的ID:14433);
查詢結果首先介紹了所輸入基因的基本信息,包括NCBI GeneID,GeneBank Accession等;
其次也可以看到四對引物:
每對引物都給出了引物長度,退火溫度、所處位置以及擴增產物長度等詳細信息。
給出的第四對引物還有實驗驗證的結果,點擊第四對引物綠色陰影部分:
可以看到這對引物經過了瓊脂糖凝膠電泳,螢光定量擴增的等實驗驗證。
同時,還可以在該頁面反饋用完這對引物後的結果,並且還可以提交自己設計的引物。
網站功能還是比較強大和實用的,如果需要,趕緊去體驗一下吧!
信息來源: 小杜聊科研
圖文編輯:安逸樹
責任編輯:王華瑤