紅旗河工程也是藏水入疆工程，一旦可行，那麼沙漠真的有可能變成綠洲。紅旗河工程全長6180公裡，大致與長江相當。起點在我國西藏雅魯藏布江的大拐彎處，終點位於我國的新疆喀什，一旦可行，那麼西北地區，尤其是新疆，將迎來有史以來最大的巨變。
紅旗河工程是怎樣從西藏調水進入新疆？雅魯藏布大拐彎是雅魯藏布江，水量最為豐富的地區之一。這裡的水位海拔2558米，沿途區帕隆藏布之水，自流509公裡之後，進入怒江。怒江水位海拔2380米，之後於三江併流處穿越橫斷山脈。借用怒江河道60公裡後，經隧道進入瀾滄江，瀾滄江水位海拔2230米。
進入瀾滄江江河到43公裡之後，經隧道進入金沙江，進入金沙江河道97公裡之後，以隧道明渠和水庫相結合的方式，到達雅礱江。此時水位海拔2119米。穿過雅礱江之後，繞過大雪山，到達大渡河，此處水位海拔2022米。隨後繞過邛崍市到達岷江，此處水位海拔1945米。
此後，一路向北繞過岷山，到達白龍江，此處水位海拔1880米，繼續向北到達渭河，此處水位海拔1808。向渭河補充淡水，解決關中平原的缺水問題。之後向西北方向，到達劉家峽水庫和黃河匯合。此處水位海拔1735米。之後以明渠的方式繞行進入河西走廊。沿祁連山東側的平原，經武威市，金昌市，張掖市，酒泉市。最後到達玉門市。此處海拔1550米。
接著，沿阿爾金山崑崙山的山前平原，到達羅布泊的南部，隨後進入塔克拉瑪幹沙漠，為沙漠補水。這一段也決定了沙漠是否能夠變成綠洲。沿塔克拉瑪幹沙漠的南部進入和田，最終到達喀什，喀什海拔水位一1300百米，整個幹流的工程就已經結束。
除了幹流之外，還設計有三條支流，第一條就是紅延河工程，通向延安方向的黃土高原，為黃土高原補水。第二條就是通往內蒙古和北京方向的漠北河工程，為我國缺水的北方進行補水。第三條就是起點，位於玉門市的春風河工程。從玉門市繞北山西側延伸至吐哈盆地，紅旗河工程全程6180多公裡，其中含200多公裡的自然河道，落差達到1258米。
紅旗河工程取水水位降低，因此水量充足，預計每年總調水量可以達到600億立方米，僅佔主要河流取水點總量的21%，將在我國西北乾旱地區形成約20平方公裡的綠洲。由於權限保持高水位運行，可以治療覆蓋絕大部分乾旱地區。
然而這對工程也面臨著諸多的難關，不僅要穿越眾多的主要河流，還有解決海拔高低落差的問題。由於途徑的大部分地區地形地勢惡劣，大都要穿越雪山荒漠，對建造技術的要求也是空前絕後的，而且六千多公裡的工程耗資也是個天文數字。對於環境的影響有多大也需要考證。沙漠變綠洲，在歷史上一直也是人類的夢想。
未來如果工程真的能夠實現的話，那麼我國的西北部將會在衛星地圖上從南方一樣的碧綠。