4 海水鹽度
鹽度是限制珊瑚分布的重要因素, 適合珊瑚生長的鹽度範圍為32~40 。造礁珊瑚是真正的海洋物種,對高鹽度海水錶現了較強的耐受性,在有些海區,如波斯灣,鹽度高達42,珊瑚可以很好的生長 。但是,低鹽會影響珊瑚的生長與分布,在很多河口低鹽水域珊瑚只能零星分布,不能長成較好的珊瑚群落。有研究表明快速的降低鹽度珊瑚會白化死亡。
5 人類過度捕魚
在熱帶地區,當地漁民大規模使用氰化物捕捉珊瑚礁魚類,嚴重威脅了珊瑚的健康。在很多沿海地區,人們使用除草劑和殺蟲劑,經過地表流到海洋中,也對珊瑚造成了很大的危害。
人類的過度捕魚還導致珊瑚礁生態系統的食物鏈不平衡,隨著一些草食性魚類的減少,大型海藻的大規模增殖,從而促進以珊瑚為主的生物群落向以大藻為主的生物群落轉移。
6 全球二氧化碳濃度的升高
由於海洋吸收、釋放大氣中過量二氧化碳,海水正在逐漸變酸。這種變遷對海洋生態系統和依靠珊瑚礁旅遊的海洋經濟構成災難性後果--現在還無法逆轉。(詳見【二氧化碳的另類問題】)