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蛋白質組學研究,這篇夠經典!
在正文開始之前,推薦蛋白質組學的一本書和一篇綜述,書是冷泉港蛋白質組學實驗手冊,適合完全不懂零基礎的開始學,綜述是chemical review(影響因子有40多,化學類第一高)上的Protein Analysis by Shotgun/Bottom-up Proteomics,適合有一定基礎的看。
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Matthias Mann:快速高深度DIA蛋白組學全面表徵酵母蛋白質組
釀酒酵母是功能強大的模型物種,可用於系統性的生物學篩選和大規模蛋白質組學方法開發。隨著質譜技術的進步,酵母的全蛋白質組覆蓋幾乎完成。然而,對酵母蛋白質組進行快速高通量分析仍然具有挑戰性。2、技術能力測評一:不同處理條件下酵母大規模蛋白組學分析研究者對不同處理條件下(不同培養基,熱脅迫,滲透壓脅迫,碳飢餓,胺基酸飢餓和氮飢餓等)的酵母進行大規模蛋白組學分析,共定量到3,506種蛋白質;數量統計發現在所有組別中檢測到的蛋白超過90%的定量一致。功能分析發現每種處理都會引發不同的響應,造成不同蛋白的合成與降解,這些變化結果與預期調控變化一致。
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蛋白質組學數據分析——(1)原理
這一篇來自博客園博主的分析,作者:小xuo生一、蛋白質組學概述蛋白質組學是特定系統內蛋白質集合及其相互作用的研究。
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科學家開發出新型定量蛋白質組學分析方法
科學家開發出新型定量蛋白質組學分析方法 作者:小柯機器人 發布時間:2020/11/26 11:45:11 美國威斯康星大學麥迪遜分校Joshua J. Coon、Jesse G.
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基因組學做不了的事 蛋白質組學更精準打擊癌症
此次獲獎是國際蛋白質組學領域對他率先提出並反覆實踐的「蛋白質組學驅動的精準醫學」這一理念與範式的高度認可,標誌著我國蛋白質組學研究再度領跑國際。 那麼,什麼是蛋白質組學?蛋白質組學驅動的精準醫學又是什麼?我國當前研究進展如何?就這些問題,科技日報記者採訪了賀福初院士。
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MCP:高等植物擬南芥蛋白質熱穩定性的蛋白質組學分析
關鍵詞:熱蛋白組,熱穩定性,蛋白質構象,擬南芥 ,串聯質譜◆◆研究速讀◆◆實驗思路:研究者採用六組生物學重複,利用高通量蛋白組學分析結合質譜(Mass Cytometry)、生物信息學分析的方法在擬南芥中鑑定到4246個蛋白,利用熱蛋白組(Thermal Proteome Profiling)分析Tm經驗值與蛋白質熱穩定性各種可能的物理化學決定因素之間的相關性
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做基因組學做不了的事 蛋白質組學可更精準打擊癌症
原標題:做基因組學做不了的事 蛋白質組學可更精準打擊癌症王 琰 魏 寅 王 迪 本報記者 張 強近日,國際人類蛋白質組組織公布了2020年度權威獎勵獲獎名單,中國科學院院士、軍事科學院軍事醫學研究院研究員賀福初榮獲蛋白質組學傑出成就獎。
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首屆中國計算蛋白質組學研討會在京召開
蛋白質組學的興起帶動了質譜技術的快速發展,而質譜技術的進步則拓寬了蛋白質組學研究問題的廣度。隨著蛋白質組學的興起,特別是質譜技術的快速發展,蛋白質組學研究中產生的數據規模越來越大。
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蛋白質組學技術在病毒研究中的應用
儀器信息網訊 蛋白質組學是生命科學領域中的一門新興學科,可以高通量的分析正常及病理條件下機體、組織、細胞或亞細胞成分中全部蛋白質,對不同空間、不同時間上動態變化的蛋白質組的整體進行比較,分析不同蛋白質組之間在表達數量、表達水平和修飾狀態下的差異
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蛋白質組學研究進展與趨勢
2.蛋白質組學研究的策略和範圍 蛋白質組學一經出現,就有兩種研究策略。一種可稱為「竭澤法」,即採用高通量的蛋白質組研究技術分析生物體內儘可能多乃至接近所有的蛋白質,這種觀點從大規模、系統性的角度來看待蛋白質組學,也更符合蛋白質組學的本質。但是,由於蛋白質表達隨空間和時間不斷變化,要分析生物體內所有的蛋白質是一個難以實現的目標。
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新研究為單細胞蛋白質組學定義載體蛋白質組限制
新研究為單細胞蛋白質組學定義載體蛋白質組限制 作者:小柯機器人 發布時間:2020/12/9 13:30:20 美國南加州大學Christopher M.
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【Cell】迄今最大規模乳腺癌蛋白質組學分析:發現新亞型 提出新療法
導言:核酸與蛋白質是構成生物體的主要大分子。隨著人類基因組等大量生物體全基因組序列的破譯和功能基因組研究的展開,生命科學家越來越關注如何用基因組研究的模式開展蛋白質組學的研究。近日,貝勒醫學院、麻省理工學院和哈佛大學等機構的研究人員通過強大的蛋白質組學分析,深入了解了乳腺癌的生物學複雜性。
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不停歇的蛋白質組學分析:賽默飛全新一代Exploris 240質譜
關注我們,更多乾貨和驚喜好禮周嶽 黃敏引言Orbitrap Exploris 240新產品的到來,進一步拓展了超高分辨質譜在蛋白質組學領域的產品線,同時也為我們帶來全新的蛋白質組學體驗。Exploris 240在蛋白質組學應用概覽Exploris 240是四極杆和超高場Orbitrap的串聯質譜,解析度最高可達240,000,掃描速度高達22Hz,在蛋白質分析的功能上支持APD(Advanced Peak detection)算法;R 45000用於TMT 11plex和TMTpro(16plex)的分析;兼容FAIMS Pro離子淌度接口;
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毛細管電泳及其應用(capillary electrophoresis, CE)
(五)非水毛細管電泳(nonaqueous capillary electrophoresis,NACE):利用純有機溶劑(甲醯胺及其衍生物、乙腈、醋酸、甲醇、二甲亞碸等)或混合試劑替代水介質來完成樣品的電泳分析。NACE主要用於分析不易溶於水而易溶於有機溶劑的物質,分離在水溶劑中淌度十分相似的物質,研究在水中難以發生的反應等。
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iTRAQ蛋白質組學、GC-MS代謝組學對柑橘黃龍病影響果肉風味研究
和代謝組學研究方法,對被柑橘黃龍病菌感染的柑橘樹果實進行了基於蛋白質和代謝物的代謝通路分析,探究了症狀果實異味的機理。 中文標題:蛋白質組學和代謝組學分析為被柑橘黃龍病菌感染的柑橘樹的水果異味提供深入理解研究對象
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長篇回顧|蛋白質組學的發展:生命科學的裡程碑
此外,細胞內表達的蛋白質在時間和空間尺度上具有動態變化的性質,因此細胞內蛋白質的分析遠比基因組的分析複雜和具有挑戰性。基因組學的研究對象是DNA,DNA的性質較為穩定,且微量的目標樣品可以通過PCR技術將其擴增,從而便於研究。目前DNA測序技術已較為成熟,且基因組學的資料庫已相對完善,對於基因的研究已經進入了相對成熟的階段。
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《Nature Methods》年度技術盤點——定向蛋白質組學技術
2012年,定向蛋白質組學技術(targeted proteomics)榮膺《自然-方法》年度生命科學技術。 定向蛋白質組學是基於質譜技術快速檢測目標蛋白的技術,該技術具有靈敏度高、重複性好的特點。基於質譜的鳥槍蛋白質組學研究是將蛋白質酶解,片段化成肽片段進行質譜分析。
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「鳥槍法(shotgun)」定量蛋白質組學技術介紹
他們把這種思路稱為多維蛋白質鑑定技術,即Mud PIT(multidi-mensional protein identification technology)。與傳統的雙向電泳技術相比具有靈敏度更高,動態檢測範圍更廣等特點。 鳥槍法(shotgun)可以分析全細胞裂解樣品和組織抽提物,也可以分析亞細胞分級組分、分離的細胞器等其他亞蛋白質組。如果樣品已經過穩定同位素標記。
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新方法再次提高單細胞蛋白質組學質譜定量準確度
單細胞蛋白質組學在蛋白豐度檢測、轉錄修飾和翻譯後修飾方面填補了單細胞轉錄組學的空白。 單細胞蛋白質組學質譜(SCoPE-MS)是近年來興起的一種定量分析多功能單細胞蛋白質組的方法,這種方法採用同位素標記和載體蛋白質組學來分析單個細胞。
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Cell:人類結腸癌蛋白質基因組學分析揭示出新的治療策略
2019年5月8日訊/生物谷BIOON/---在一項新的研究中,來自美國國家癌症研究所、貝勒醫學院、太平洋西北國家實驗室、華盛頓大學、範德堡大學和德克薩斯大學衛生科學中心等研究機構的研究人員通過對來自患者的結腸癌組織產生的全部基因和蛋白的分析,對這種腫瘤有了更全面的認識,並指出新的癌症生物學機制和可能的新治療策略。