繪製鞍帶石斑魚基因組精細圖譜
2020-11-23 科學網| 中國水科院黃海水產所等 |
| 繪製鞍帶石斑魚基因組精細圖譜 |
鞍帶石斑魚
本報訊（記者廖洋 通訊員李香 彭雲傑）日前，在山東省農業良種工程等項目支持下，中國水產科學研究院黃海水產研究所研究員陳松林團隊、中山大學林浩然院士團隊和美國密西根州立大學教授李偉明團隊等，聯合完成了鞍帶石斑魚（龍膽石斑）的全基因組測序和基因組圖譜繪製，並解析了其先天性免疫和快速生長的基因組學機制。研究成果在線發表於《分子生態資源》。
石斑魚是我國重要的海水養殖經濟魚類。鞍帶石斑魚是石斑魚類中體型最大、生長最快的一種，廣泛應用於石斑魚良種選育。鞍帶石斑魚對巖礁生態系統亦具有重要影響。
研究人員採用二代測序和Hi－C三維基因組技術，構建了染色體水平的鞍帶石斑魚基因組圖譜，結果顯示鞍帶石斑魚基因組大小為1.086Gb，含有24718個蛋白編碼基因。進化分析和共線性分析顯示，鞍帶石斑魚與三棘刺魚關係最近，分化時間距今約1億年，二者的部分染色體發生了融合或分裂。與其他魚類基因組的比較基因組學分析發現，鞍帶石斑魚具有較完善的先天免疫系統，其中一些參與先天性免疫的基因家族發生了顯著擴張，並發生了顯著的DNA序列變化（正選擇）；同時，一些激素信號傳導通路的關鍵基因亦受到正選擇，可能與其生長快速的生物學特徵有關。
鞍帶石斑魚基因組精細圖譜的完成，為解析石斑魚科魚類生長、抗病等重要經濟性狀的分子機制奠定了重要基礎，也為石斑魚雜交育種及良種選育技術的發展提供了有價值的基因資源。
相關論文信息：https://doi.org/10.1111/1755-0998.13048
《中國科學報》 (2019-07-25 第4版 綜合)
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