陳松林研究員主導繪製褐牙鮃全基因組精細圖譜,揭示比目魚變態發育...

2020-12-08 水產養殖網

陳松林研究員主導繪製褐牙鮃全基因組精細圖譜,揭示比目魚變態發育的分子機制

2016-12-09 11:04:00  水產養殖網  出處:水產學報        瀏覽量: 5162 次 我要評論

2016年12月6日,著名雜誌《Nature&nbspGenetics》(影響因子31.616)在線發表了由《水產學報》副主編、《漁業學報》(英文)(即《Aquaculture&nbspand&nbspFisheries》)副主編、中國水產科學研究院黃海水產研究所陳松林研究員帶領的研究團隊與上海海洋大學、德國維爾茨堡大學、葡萄牙阿爾加夫大學、深圳華大基因研究院等單位的科研人員的合作研究成果。邵長偉、鮑寶龍、謝志遠、陳新頁、李波、賈曉東為該論文的共同第一作者,陳松林、Manfred&nbspSchartl,&nbsp王清印、Deborah&nbspPower(《漁業學報》副主編)為該論文的共同通訊作者。
該論文完成了褐牙鮃全基因組解析並揭示了光傳導通路調控變態過程眼睛移動和體色左右不對稱建立的機制。

褐牙鮃等比目魚類眼睛、體色等左右不對稱是非常獨特的現象,也是自達爾文發表《物種起源》以來進化論引起激烈爭論的著名案例之一。上海海洋大學鮑寶龍實驗室聯合黃海水產研究所陳松林實驗室等單位,通過褐牙鮃全基因組分析,發現光傳導通路調控眼睛移動和體色左右不對稱建立。通過顯微注射光傳導通路關鍵分子視黃酸至褐牙鮃移動眼眶下區域,發現視黃酸通過幹擾甲狀腺激素對視黃酸受體/甲狀腺激素受體形成的異二聚體作用而抑制眼睛移動,這是首次表明脊椎動物變態,不僅僅由甲狀腺激素調控,而是存在與其有拮抗關係的調控機制。此外,眼睛移動伴隨身體偏轉90度後,比目魚仔魚倒伏成為底棲生活的稚魚,其身體有眼側體色深而無眼側(著底側)體色淺,人們對於這種兩側不對稱現象形成的機制,尚不得其解。此次研究發現褐牙鮃體表分布有感光功能的視錐蛋白,通過分別在兩側照射不同顏色的光線和在無眼側注射視黃酸,發現在褐牙鮃變態倒伏後,主要是有眼側的感藍光視蛋白接收到水表面來的藍光,導致體表合成視黃酸,誘導成體型黑色素細胞分化。而無眼側(著底側)由於缺少光線,導致該體側黑色素細胞形成很少。這是首次揭示了比目魚類體色左右不對稱建立的機制,發現了光線調控魚類體色深淺的主要信號通路,這對於理解其它底層魚類和上層魚類背腹面體色深淺也有重要幫助。




 資訊分類

相關焦點

  • 剛解鎖石斑魚基因精細圖譜,島城科學家又破譯大毛蛤「基因天書」
    該項研究成果為蚶科貝類抗病抗逆、生長發育等重要性狀的遺傳解析以及種質改良等相關研究提供了重要理論支撐。「解鎖」體型最大石斑魚基因精細圖譜本月初消息,黃海水產研究所等單位聯合完成鞍帶石斑魚基因組精細圖譜繪製。
  • Nat Genet:破譯首個比目魚基因組 揭秘性染色體起源及底棲適應機制
    近日,迄今為止世界上首個比目魚基因組——半滑舌鰨全基因組精細圖譜在青島宣布完成。中國水產科學研究院黃海水產研究所研究員陳松林表示,這是世界上首個測序完成的比目魚基因組圖譜,標誌著鮃鰈魚類養殖研究進入基因組時代。
  • 繪製鞍帶石斑魚基因組精細圖譜
    中國水科院黃海水產所等
  • 鞍帶石斑魚基因組精細圖譜繪製完成
    日前,在山東省農業良種工程等項目支持下,海洋試點國家實驗室海洋漁業科學與食物產出過程功能實驗室(以下簡稱「海洋漁業功能實驗室」)陳松林研究員團隊、林浩然院士團隊和美國密西根州立大學李偉明教授團隊等,聯合完成了鞍帶石斑魚(龍膽石斑)的全基因組測序和基因組圖譜繪製,並解析了其先天性免疫和快速生長的基因組學機制。
  • 陳松林手繪魚類基因圖譜 國內率先建立「魚類精子庫」
    陳松林是魚類生物技術與遺傳育種專家,30多年來,他始終戰鬥在水產科研第一線。陳松林團隊最出名的成果要數「破解舌頭魚基因圖」,該成果當時轟動一時,甚至讓人類對魚類基因密碼的認識提升一個臺階。
  • 鞍帶石斑魚基因組精細圖譜成功繪製
    日前,在山東省農業良種工程等項目支持下,黃海水產研究所陳松林研究員團隊、中山大學林浩然院士團隊和美國密西根州立大學李偉明教授團隊等,聯合完成了鞍帶石斑魚(龍膽石斑)的全基因組測序和基因組圖譜繪製,並解析了其先天性免疫和快速生長的基因組學機制。
  • 海參全基因組精細參考圖譜由中科院海洋所完成繪製
    (仿刺參 海參Apostichous japonicus)齊魯網10月13日訊(記者 田進 通訊員 劉洋 王敏)10月13日,國際學術期刊PLoS Biology在線刊發了由中國科學院海洋研究所楊紅生研究員課題組和相建海、李富花研究員課題組主導,天津生物晶片技術公司、加拿大紐芬蘭紀念大學等單位合作
  • 鞍帶石斑魚基因組精細圖譜成功繪製—新聞—科學網
    鞍帶石斑魚(龍膽石斑魚)       日前,在山東省農業良種工程等項目支持下,黃海水產研究所陳松林研究員團隊、中山大學林浩然院士團隊和美國密西根州立大學李偉明教授團隊等,聯合完成了鞍帶石斑魚(龍膽石斑)的全基因組測序和基因組圖譜繪製,並解析了其先天性免疫和快速生長的基因組學機制。
  • 黃海水產所等單位完成鞍帶石斑魚基因圖譜繪製
    日前在山東省農業良種工程等項目支持下,黃海水產研究所陳松林研究員團隊、中山大學林浩然院士團隊和美國密西根州立大學李偉明教授團隊等,聯合完成了鞍帶石斑魚(龍膽石斑)的全基因組測序和基因組圖譜繪製,並解析了其先天性免疫和快速生長的基因組學機制。
  • ...高原升溫、遠望3號船、全基因組精細圖譜、量子糾纏純化、RNA-DNA
    ——新華社「新華視點」微博  2  青藏高原升溫2°C徑流變化及影響獲揭示  1月13日,第二次青藏高原綜合科學考察研究隊發布消息稱,中科院青藏高原所研究員汪濤及合作者利用觀測數據約束了地球系統模式對降水和徑流的未來預估, 繪製了包括印度河、恆河、雅魯藏布江、怒江、湄公河、
  • 鯉魚全基因組序列精細圖譜繪製完成
    原標題:鯉魚全基因組序列精細圖譜繪製完成   本報記者 馬愛平   日前,鯉魚全基因組序列精細圖譜已繪製完成,該基因組覆蓋約為16.9億鹼基,包含52610個功能基因,功能基因數目是大多數硬骨魚類基因數目的兩倍。
  • 中國科學家首次構建高效節水穀物糜子全基因組精細圖譜—新聞...
    讀懂糜子的「初心」
  • 中國啟動十萬人基因組計劃:繪製國人精細基因組圖譜
    中國啟動十萬人基因組計劃:繪製國人精細基因組圖譜 今天(12月28日),我國啟動「中國十萬人基因組計劃」,這是我國在人類基因組研究領域實施的首個重大國家計劃,也是目前世界最大規模的人類基因組計劃。
  • 中國熱帶農業科學院成功繪製香蕉B基因組精細圖譜
    新華社海口7月16日電(記者劉詩豪 陳凱姿)記者16日獲悉,中國熱帶農業科學院聯合11家單位,繪製了雙單倍體香蕉野生種Pisang Klutuk Wulung(BB基因組)的精細基因組圖譜,揭示了香蕉A、B基因組的分化,二倍化進程中A、B基因組的特點、多倍體香蕉A、B亞基因組之間同源交換與重組規律等重要科學問題
  • 【科技日報】小麥A基因組序列精細圖譜完成
    ,該所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、遺傳發育所基因組分析平臺與中國科學院種子創新研究院等合作,最新完成了小麥A基因組序列精細圖譜。  中國科學院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體國家重點實驗室的小麥基因組研究團隊與遺傳發育所的梁承志課題組等合作,通過構建A基因組測序,結合全基因組單分子測序以及最新物理圖譜構建技術,完成了烏拉爾圖小麥材料G1812的基因組測序和精細組裝,繪製出了7條染色體的序列圖譜,注釋出了41507個蛋白編碼基因,實現了小麥基因組研究的重大突破。
  • 麵包小麥精細表觀組圖譜繪製及全基因組順式作用元件鑑定
    近日,中國科學院植物生理生態研究所和南京農業大學團隊合作生成並繪製麵包小麥精細的表觀組圖譜,以此為基礎針對性開發整合計算流程對全基因組順式調控元件進行了系統的挖掘與鑑定,並初步探索了其作用機制,為小麥基因調控機制解析研究提供了重要的資源。
  • 水稻全基因組DNA腺嘌呤甲基化圖譜被繪製
    近日,中國農業科學院生物技術研究所研究員谷曉峰課題組繪製了全基因組腺嘌呤甲基化修飾圖譜,並發現其參與生長發育、光合作用、逆境適應等生物學功能。相關研究成果在線發表於《分子植物》。水稻是重要的糧食作物,培育高產、穩產、優質等綜合性狀優良的水稻品種是科學研究和生產中的重大需求。作為兩個主要亞種,秈稻和粳稻具有不同的農藝性狀,相對而言秈稻產量較高,粳稻食用品質更好。
  • 海洋所科研人員繪製完成牡蠣全基因組序列圖譜
    近日,牡蠣基因組計劃(Oyster Genome Project,OGP)項目組宣布,歷時兩年的牡蠣基因組序列圖譜終於繪製完成。這是世界上第一張養殖貝類的全基因組序列圖譜,標誌著基於短序列的高雜合度基因組拼接和組裝技術獲得了重大突破。據悉,目前的基因組圖譜已達到國際領先的基因組圖譜標準。近年來,我國的海水養殖業取得了長足發展。
  • 中國科學家繪製人類海馬體發育的細胞圖譜和基因調控網絡
    該工作系統闡明了人海馬體胚胎發育過程中的基因表達調控網絡和細胞命運決定因子,繪製了高精度發育細胞圖譜,解析了海馬發育過程中的不同細胞類型及其關鍵的分子與調控網絡。海馬體,是由端腦的內側區域發育而來,是大腦中一個至關重要的特殊結構。
  • 高溫超導高速磁浮工程化樣車、青藏高原升溫、遠望3號船、全基因組精細圖譜、量子糾纏純化、RNA-DNA
    ——新華社「新華視點」微博1月13日,第二次青藏高原綜合科學考察研究隊發布消息稱,中科院青藏高原所研究員汪濤及合作者利用觀測數據約束了地球系統模式對降水和徑流的未來預估,繪製了包括印度河、恆河、雅魯藏布江、怒江、湄公河、長江和黃河等主要河流上遊人均水資源量分布圖。