通過了解細菌的新陳代謝,提高生物燃料的產量

2020-12-05 科技報告與資訊

本文參加百家號#科學了不起#系列徵文賽。

細菌通過消耗「食物」來產生化學物質,一項新的研究對細菌如何控制這一過程進行研究,研究成果可用於加強生物體將植物轉化為生物燃料的效率。這項研究由加州大學河濱分校和太平洋西北國家實驗室的科學家共同進行,研究成果發表在《Journal of the Royal Society Interface》上。

在文章中,作者描述了建模過程和實驗情況,實驗結果表明細胞具有故障安全機制,可以防止它們產生過多的代謝中間體。代謝中間體是將新陳代謝中的每個反應相互耦合的化學物質。這些控制機制的關鍵是酶,酶加快了涉及生長和能量生產等生物功能的化學反應。

"細胞的新陳代謝由一堆酶組成。當細胞遇到食物時,一種酶將其分解成一個分子,可以被後面的酶使用,最終產生能量,"研究報告的共同作者、UCR兼職數學教授、太平洋西北國家實驗室計算科學家William Cannon解釋說。

酶不能產生過多的代謝中間物。代謝中間物的量是由該產物在細胞中已經存在的數量來控制的。"這樣代謝物的濃度就不會高到使細胞內的液體變得像糖漿一樣粘稠,過於黏稠會導致細胞死亡,"Cannon說。

目前生物燃料製備的主要問題是將植物材料轉化為乙醇的效率還比較低。通常情況下,大腸桿菌被設計為分解木質素,即植物細胞壁的堅韌部分,因此它可以發酵成燃料。

"生物燃料製備所用的工程細菌存在的最大問題是,製備過程會讓細菌生病,"Cannon說。"因為我們讓它們過度生產蛋白質,導致它們可能會生病。我們在這項研究中學到的東西可以幫助我們更智能地設計它們。"知道哪些酶需要防止過度生產,可以幫助科學家設計出能生產更多它們想要的東西,而少生產它們不想要的東西。

該研究採用了數學控制理論,學習系統如何自我控制,以及用機器學習來預測哪些酶需要被控制,以防止代謝物的過度堆積。

論文標題為《Enzyme activities predicted by metabolite concentrations and solvent capacity in the cell》。

相關焦點

  • Cell:讓細菌變成自養生物!靠消耗二氧化碳生長
    這一成就凸顯了細菌新陳代謝的驚人可塑性,並為未來的碳中和生物生產提供框架。自養生物與異養生物生物分為自養生物(將有機碳轉化為生物質)和異養生物(消耗有機化合物)。自養生物控制著地球上的生物量,供應食物和燃料,更好地理解自養生長的原理和促進自養生長的方法對於實現可持續發展的道路至關重要。合成生物學的一個巨大挑戰是使異養模式生物變為合成自養。
  • 美華裔教授從細菌獲取生物燃油 有望規模生產
    過去兩年中普通汽油全美平均價每加侖從1.9美元直升到3.5美元,加州更是突破4美元,人們對新型綠色燃料取代傳統化石燃料的願望越發迫切。美國加州大學伯克利分校化學系助理教授張嘉瑜(Michelle Chang)和她的研究團隊,用基因轉換和替代酶的方式從大腸桿菌中獲取可替代汽油和柴油的生物燃料丁醇。這個突破性發現令人們有望從加油站購買到低成本綠色生物燃料。
  • Nature Chemical Biology :從大腸桿菌中獲取生物燃料
    美國加州大學伯克利分校化學系助理教授張嘉瑜(Michelle Chang)和她的研究團隊,用基因轉換和替代酶的方式從大腸桿菌中獲取可替代汽油和柴油的生物燃料丁醇。這個突破性發現令人們有望從加油站購買到低成本綠色生物燃料。廣泛分布在土壤中的梭菌會自然產生一種化學物丁醇,它是繼乙醇後被稱為第二代的新型生物燃料。
  • 通過健身減肥最重要的一件事!就是提高你的新陳代謝
    在你健身減肥過程,一定會聽很多教練和「過來人」告訴你,提高新陳代謝對於減肥有多重要。那麼今天就來說說新陳代謝的真相。一般說的新陳代謝是指為通氣、血液循環和溫度調節提供燃料所需的熱量。卡路裡的燃燒也需要包括消化和吸收消耗的食物,以及日常生活活動。
  • 讓細菌進化成像植物一樣的自養生物...
    ,使其可以像植物一樣通過吸收二氧化碳來構建細胞。這一成果為利用工程細菌將我們視為廢物的產品轉化為燃料、食品或其他感興趣的化合物開闢了令人振奮的新前景。生物學家通常把世界分為兩種類型的生物:自養生物(有機碳轉化為生物量)和異養生物(消耗有機化合物)。自養生物控制著地球上的生物量,並供應我們所需要的食物和燃料。更好地理解自養生長的原理以及促進自養生長的方法對於實現可持續發展至關重要。
  • 讓細菌進化成像植物一樣的自養生物……
    ,使其可以像植物一樣通過吸收二氧化碳來構建細胞。 這一成果為利用工程細菌將我們視為廢物的產品轉化為燃料、食品或其他感興趣的化合物開闢了令人振奮的新前景。 生物學家通常把世界分為兩種類型的生物:自養生物(有機碳轉化為生物量)和異養生物(消耗有機化合物)。自養生物控制著地球上的生物量,並供應我們所需要的食物和燃料。更好地理解自養生長的原理以及促進自養生長的方法對於實現可持續發展至關重要。
  • 生物燃料產量低怎麼破?小小藻類成大幫手!
    想讓大自然的生物們自願為我們提供燃料?想多了!它們為了生長與生存,總是會將自己攝取的能量變成很多東西,像脂肪、蛋白質、DNA什麼的。但是對於生物燃料來說,重點差不多只在它們的脂肪上面。因為脂肪本身就是長鏈的碳氫化合物,與我們平常用的液體燃料的結構已經是非常的相近。
  • 美國完成團藻基因組測序以研發生物燃料
    在為交通運輸提供碳中性(平衡)燃料這條漫長且艱難的道路上,美國能源部正尋求多種途徑力圖實現自己的目標。能源部的努力包括探尋自然界中潛在的新型燃料資源,它們包括從陸地上可作為纖維質原料的植物(如快速生長的樹木和多年生牧草)到水中及其他生長環境中的產油生物(如海藻和細菌),極具多樣性。
  • 科學家發現「嗜極細菌」 或成未來燃料來源
    【環球科技綜合報導】據臺灣「中央社」2月3日報導,在不遠的將來,汽車、火車與飛機的動力,或許可由利用一些極端細菌而獲得。據英國《每日郵報》2月3日報導,科學家「無意間」在極高鹽度與鹼性環境中發現一種細菌,它能夠產生氫。而氫有非常高的能量密度,是汽油或柴油的3倍,且氫也可用在燃料電池,效率據稱是燃燒引擎的兩倍。
  • 新機制提高生物法合成萜烯類化合物產量—新聞—科學網
    近年來,因其加氫產物在生物燃料領域的潛在應用價值而受到越來越多的關注。近日,中科院青島生物能源與過程研究所生物基材料組群精細化學品研究組在該領域取得進展,相關成果發表於《生物燃料技術》。 該研究組長期從事生物合成萜烯類化合物的研究工作,並在蒎烯、檜烯、松油烯等化合物的生物合成方面取得了一系列重要進展。
  • 「吃貨」拯救世界,細菌如何通過吃吃吃拯救地球?
    他表示,糞便中哪種細菌帶來了這種有益效應,我們無法確定。我們可以在醫學中精確運用一些細菌,因為我們了解其運作原理。大腸桿菌就是其中的典範,此菌寄生於人體,基本無害。經過幾十年來的研究,我們對大腸桿菌有了充分的了解,使其基本成為一個可編程的微型生物電腦,用於治療各種疾病。
  • 細菌如何通過吃吃吃拯救地球?
    他表示,糞便中哪種細菌帶來了這種有益效應,我們無法確定。我們可以在醫學中精確運用一些細菌,因為我們了解其運作原理。大腸桿菌就是其中的典範,此菌寄生於人體,基本無害。經過幾十年來的研究,我們對大腸桿菌有了充分的了解,使其基本成為一個可編程的微型生物電腦,用於治療各種疾病。
  • 生物工程水稻可顯著提高穀物產量
    據外媒New Atlas報導,來自中國的新研究表明,提高水稻作物光合效率的新技術可以使穀物產量提高27%。
  • 生物科學:開放式資料庫包含全球人體新陳代謝的知識!
    生物科學:開放式資料庫包含全球人體新陳代謝的知識!由盧森堡大學盧森堡系統生物醫學中心(LCSB)牽頭的國際研究聯盟開發了一個世界上獨一無二的資料庫:虛擬代謝人類資料庫(VMH)。VMH是一系列知識,來自世界各地的研究人員在過去60年中產生了關於人體新陳代謝的知識。
  • 通過表觀遺傳修飾的方法提高麥角菌屬中麥角生物鹼的產量
    因此本研究擬通過表觀遺傳修飾的方法來提高麥角菌屬中麥角生物鹼的產量。研究內容: 首先作者通過考察不同HATi(包括:漆樹酸,薑黃素及山竹子素)和HDACi(包括:伏立諾他,丙戊酸鈉)對麥角菌屬中麥角生物鹼生物合成的影響,發現HDACi對麥角生物鹼的生物合成具有積極的影響,接著對HDACi的用量進行了優化,結果發現,當伏立諾他(SAHA)的用量達到500 μM
  • 青島能源所藍藻生物液體燃料研究取得系列進展
    藍藻是一類能夠進行植物型放氧光合作用的原核微生物,細胞結構相對簡單,生長迅速,遺傳操作體系成熟,易於基因工程改造。通過基因工程改造藍藻,可以構建高效定向生物合成生物液體燃料的代謝途徑,實現在單一生物體內從太陽能和二氧化碳到生物液體燃料的直接轉化及胞外分泌,對開發新一代光合能源微生物系統、解決生物質資源不足這一生物質能源發展面臨的最大瓶頸問題具有重要意義。
  • 科學家研製出細菌發電生物電池
    這項重大突破將會導致由細菌產生的清潔電流,或稱「生物電池(bio batteries)」誕生。 該研究成果發表美國《國家科學院院刊》(PNAS)上,它顯示,細菌接觸到金屬或者是礦物質時,它們體內的化學物質就會生成電流,並通過細胞膜流出體外。這意味著可以把細菌直接「束縛」到電極上,這一發現表明我們又向成功制出高效微生物燃料電池邁進了一大步。
  • 正確飲食提高新陳代謝
    核心提示:新陳代謝減慢,燃燒脂肪的速度也會相對減慢,因此要想減肥,就要加快新陳代謝的速率。下面,編輯就教大家7個加快新陳代謝速率的飲食減肥方法,輕輕鬆鬆吃出好身材。這是因為辣味食物當中含有一種能促使機體代謝告訴運轉的化合物,這種化合物能提高新陳代謝率23%。所以MM們,可以的話,適當吃在飯菜中加一點辣椒末吧。  3.吃魚與代謝快慢有關  MM們,你們或許還不知道,據研究發現,經常吃魚的人體內的一種名為「萊普汀」的荷爾蒙水平就會更低。
  • 航空生物燃料 綠色天空的必然選擇
    2010年10月國際民航組織(ICAO)第37次會議上,所有成員國承諾了一個框架性減排目標:到2020年全球燃油效率平均每年提高2%,到2050年航空業實現碳中和。碳中和的實現方式包括生物燃油、空管技術改進、飛機和發動機技術的創新等。不過,當下面對能源危機和氣候變化的雙重挑戰,僅憑飛機燃燒效率和航空公司營運效率的提高,無法確保能源的可持續,也無法從根本上實現碳減排。
  • 新陳代謝到底是啥?
    你是否常聽說:我的新陳代謝變慢了,所以越來越胖。到底新陳代謝是個啥玩意兒?今天我們來好好的了解一下。