用這種方法可重複製備數微克的酵母DNA，得到的酵母DNA能被限制性內切核酸酶有效切割，也可用作PCR的模板。注意，酵母菌落能直接用於PCR，無需純化酵母DNA。
在方案6步驟9~12中，介紹了一種與菌落PCR類似的方法。在第1章方案17中提供了另一種製備酵母DNA的方法。
用10mL YPD培養基培養酵母。將酵母培養物在30'C、中度振蕩條件下培養過夜。
2.轉移5mL細胞到離心管中。2000g (Sorvall SS-34 轉子，4100r/min) 離心5min,收集細胞。將多餘的培養物放到4'C保存。
3.用0.5mL山梨糖醇緩衝液重懸細胞。將細胞懸液轉移到一個微量離心管中。
4.加入20μL酵母溶細胞酶100T的溶液(用山梨糖醇緩衝液配成2.5mg/mL濃度)。將細胞懸液在37C溫育lh.
5.用微型離心機離心1lmin,收集細胞，吸出上清液。
6.用0.5mL酵母重懸緩衝液重懸細胞。
7.加入50μL 10%的SDS.蓋上管蓋，快速顛倒離心管數次混勻。將離心管65C溫育30min。
8.加入0.2mL 5mol/L的乙酸鉀，冰上放置管子lh。分離DNA
9.在微型離心機中，以最大轉速4'C離心5min，使細胞碎片沉積。
10.室溫下用寬孔吸頭轉移上清到一個新的微量離心管中。
11.加入等體積室溫的異丙醇，沉澱核酸。將管內容物混勻，室溫放置5min。
▲不要使沉澱反應超過5min.
12.在微型離心機中以最大轉速離心10s回收沉澱的核酸。吸出上清液，沉澱在空氣中乾燥10min。