武漢植物園真雙子葉植物基部類群葉綠體基因組研究獲進展

2020-11-24 中國科學院

武漢植物園真雙子葉植物基部類群葉綠體基因組研究獲進展

2017-09-26 武漢植物園

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　　毛茛目星葉草科僅包含星葉草和獨葉草兩個東亞特有種。這兩個種均為國家重點保護植物，它們具有跟裸子植物銀杏相似的開放式二叉狀分枝葉脈脈序，這在被子植物中十分罕見。 

　　為了更好地研究真雙子葉植物基部類群葉綠體基因組的進化趨勢，中國科學院武漢植物園博士孫延霞對星葉草和獨葉草的葉綠體基因組全序列進行了測序、分析，並重建了毛茛目全部共七個科的系統發育關係。他們在星葉草和獨葉草葉綠體基因組的大單拷貝區均發現了一個49kb和一個3.5kb的倒置區域；另外，在星葉草葉綠體基因組的反向重複區發現了一段非常罕見的序列重組結構；accD在星葉草葉綠體基因組中完全丟失；在獨葉草的葉綠體基因組中，ΨndhA, ΨndhB, ΨndhD, ΨndhH 和 ΨndhK被鑑定為假基因，而ndhC, ndhF, ndhI 和 ndhG則完全丟失。以上特徵在所有已報導的真雙子葉植物基部類群葉綠體基因組中均為星葉草科所特有。基於葉綠體基因組全序列的毛茛目系統基因組學分析強烈支持星葉草科和木通科的姐妹關係。

　　該研究是孫延霞在真雙子葉植物基部類群葉綠體基因組研究中繼發表在Plos One和Molecular Phylogeny and Evolution的研究工作後的又一新的成果。論文正式發表在BMC Genomics（2017 18:592）上。

　　論文連結

星葉草和獨葉草葉綠體基因組物理圖譜（左上）和毛茛目系統基因組學分析結果

　　毛茛目星葉草科僅包含星葉草和獨葉草兩個東亞特有種。這兩個種均為國家重點保護植物，它們具有跟裸子植物銀杏相似的開放式二叉狀分枝葉脈脈序，這在被子植物中十分罕見。 
　　為了更好地研究真雙子葉植物基部類群葉綠體基因組的進化趨勢，中國科學院武漢植物園博士孫延霞對星葉草和獨葉草的葉綠體基因組全序列進行了測序、分析，並重建了毛茛目全部共七個科的系統發育關係。他們在星葉草和獨葉草葉綠體基因組的大單拷貝區均發現了一個49kb和一個3.5kb的倒置區域；另外，在星葉草葉綠體基因組的反向重複區發現了一段非常罕見的序列重組結構；accD在星葉草葉綠體基因組中完全丟失；在獨葉草的葉綠體基因組中，ΨndhA, ΨndhB, ΨndhD, ΨndhH 和 ΨndhK被鑑定為假基因，而ndhC, ndhF, ndhI 和 ndhG則完全丟失。以上特徵在所有已報導的真雙子葉植物基部類群葉綠體基因組中均為星葉草科所特有。基於葉綠體基因組全序列的毛茛目系統基因組學分析強烈支持星葉草科和木通科的姐妹關係。
　　該研究是孫延霞在真雙子葉植物基部類群葉綠體基因組研究中繼發表在Plos One和Molecular Phylogeny and Evolution的研究工作後的又一新的成果。論文正式發表在BMC Genomics（2017 18:592）上。
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星葉草和獨葉草葉綠體基因組物理圖譜（左上）和毛茛目系統基因組學分析結果

列印 責任編輯：任霄鵬

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