2020-09-04 16:17 來源:澎湃新聞·澎湃號·湃客
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癌症是一大類疾病,其特徵在於基因組中的突變或其他改變導致細胞生長不受控制。腫瘤可出現數百至數千個突變,但只有少數幾個對其致瘤能力至關重要。這些關鍵突變影響癌症驅動基因的功能。尋找具有這種癌症驅動突變的基因是癌症研究的主要目標之一。
近日,西班牙巴塞隆納科學技術研究所的研究團隊在 Nature Reviews Cancer 雜誌發表了題為:A compendium of mutational cancer driver genes 的論文。
通過對來自66種癌症的28076個腫瘤樣本的基因組進行分析,鑑定了568個癌症驅動基因。這是迄今為止癌症驅動基因最完整全景圖。目前該研究數據已在 IntOGen 平臺更新。
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研究人員對來自66種癌症的28076個腫瘤樣本進行了廣泛的計算分析,並確定了568個癌症驅動基因。這些關鍵基因在調控細胞生長,細胞周期和DNA複製等方面起特定作用。
這些基因的突變賦予惡性細胞快速無休止繁殖,逃避免疫系統和其他防禦系統,擴散和侵襲其他組織,以及為其自身利益而改變環境的能力。
通過鑑定這568種癌症驅動基因,研究人員觀察到大多數基因具有高度特異性,並且其突變僅能觸發幾種腫瘤類型。
但是,也有一小部分癌症驅動基因功能強大,TP53、PIK3CA、KMT2C、ARID1A、KMT2D、LRP1B、PTEN、RB1、FAT4、KRAS,這10個基因每個的突變都能導致20多種不同類型的癌症,其中最誇張的就是大名鼎鼎的 TP53 基因,其突變導致的癌症超過50種。
儘管自從首次發現癌症驅動基因以來,研究人員就認識到了它們具有不同程度的特異性,但是有了這個癌症驅動基因圖譜,就可以無偏見地解決這個問題。
之前的研究表明,癌症平均由四種關鍵的癌症驅動基因平均引起。有些腫瘤僅由一種基因突變導致,而有些腫瘤,例如結直腸癌和子宮腫瘤等,10多種基因突變均可導致。
此外,其他基因組改變,例如結構突變、基因拷貝數改變以及基因組非編碼區突變也有助於腫瘤發生。
在癌症基因組學開始之前,科學家們已經鑑定了幾十個癌症驅動基因,在此後的二三十年裡,科學家們陸續很如研究並表徵了這些基因的功能。
而相比之下,在對第一個腫瘤基因組進行測序以來不到二十年的時間裡,科學家們已經發現了數百種癌症驅動基因。DNA測序技術的進步和生物信息學方法的發展,使得發現癌症驅動基因的速度越來越快。這也導致了癌症驅動基因的數量與人類已表徵的癌症驅動基因數量之間存在了巨大的知識鴻溝。
這也在一定程度上意味著,儘快全面解析這568個癌症驅動基因驅動腫瘤發生發展,縮小這些知識鴻溝,是短期內癌症基因組學研究的重大挑戰和努力方向。
該研究的領導者 Nuria Lopez-Bigas 表示:「癌症驅動基因彙編為臨床和基礎研究領域的癌症研究人員提供了至關重要的知識,並且對臨床決策具有重要影響。如果我們知道腫瘤的致癌能力依賴於一種特定的蛋白質,那麼研究人員就能夠會採用經過批准的靶向療法,例如抗體或其他阻礙其功能的抑制劑來治療癌症。」
該項目的領導者——Nuria Lopez-Bigas
參考連結:
https://www.nature.com/articles/s41568-020-0290-x
https://www.intogen.org/search
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