漏膠及汙染同位素的危險性增大。
2.若使用雙鏈探針,在100C加熱3p標記的雙鏈DNA 5min,使之變性,然後迅速移至冰水中冷卻。
此外,可以加入0.1倍體積的3mol/L NaOH變性探針。室溫下Smin後,將探針移至冰水中,加入0.05倍體積的1mol/L Tris-Cl (pH72)和0.1倍體積3mo/L HCI,冰水放置直到使用。單鏈探針不需變性。
3.把變性的或單鏈放射性標記的探針直接加到預雜交液中,在合適的溫度下繼續溫育12~ 16h。為了檢測低豐度mRNA,需使用至少0.1μg特異活性超過2X 10°cpm/ug的探針。
當探針與靶基因非同源時,即低嚴謹性雜交,最好在較低的溫度(37~42C)下進行雜交,雜交緩衝液含有50%去離子化甲醯胺、0.25mol/L 磷酸鈉(pH7.2)、0.25mol/L NaCl和79%SDS。
探針與固定於固體支持物上的核酸雜交的具體條件請參閱第2章,方案1~13.4.雜交後,將膜從塑膠袋中取出,在室溫下迅速轉移到含有100~ 200mL 1X SSC。
0.1%SDS的塑料盒內,將盒蓋好,置於水平振蕩器上,溫和振蕩10min。
▲在洗染步驟中,任何時候都不要讓膜乾燥。如果使用單鏈探針,將洗滌液中的SDS濃度增至1%。
在會甲醯胺的緩衝液中低嚴謹性雜交之後,23C下用2XSSC衝洗膜,然後23C下用2XSSC, 0.5XSSC 和0.1xSSC 含0.1% SDS的洗液分別洗膜1Smin,最後50C下用會1% SDS得0.1XSSC洗膜。