【中國科學報】小核糖體RNA新概念提出

2020-12-05 中國科學院

中科院上海生科院營養科學研究所翟琦巍研究組在一項研究中，提出了小核糖體RNA （srRNA）這一新概念，並初步發現srRNA和糖尿病存在相關性並具有生物學功能。相關成果近日在線發表在美國《科學公共圖書館·綜合》雜誌上。

據介紹，近年來，小RNA的研究發展迅猛，各種類型的小RNA相繼被發現和鑑定。在小RNA高通量測序數據中，經常會發現存在相當數量的、和核糖體DNA 完全匹配的小RNA。但在常規的數據分析過程中，這些小RNA會被當做是降解的核糖體RNA 而直接捨棄。

翟琦巍團隊分析發現，小鼠miR-696等已經鑑定的10種miRNA序列和rDNA完全匹配，並且小鼠piR-16等已經鑑定的60種piRNA序列也和rDNA完全匹配。這些都提示，和rDNA完全匹配的微小RNA很可能是一類具有生物學功能的非編碼小RNA。

該團隊博士後衛海濱、博士生周犇等在對小RNA高通量測序數據分析時發現，測序數據中存在相當數量的和已有的人、小鼠等哺乳動物基因組不能匹配的小RNA。深入研究發現，由於目前的人、小鼠等哺乳動物的基因組數據中不包含rDNA重複單元，這些小RNA中相當一部分可以和rDNA完全匹配。進一步的小鼠糖尿病模型研究發現，srRNA的表達譜和糖尿病存在相關性。利用細胞模型的初步研究還發現，srRNA具有生物學功能。

該研究團隊認為，srRNA的存在並具有生物學功能是有其合理性的。研究提示，srRNA至少並不完全是隨機降解的產物。同時，srRNA可以特異性地和AGO蛋白結合，提示其可能和miRNA等一樣具有生物學功能。科學家表示，目前已知的很多小RNA是與rDNA完全匹配的，也就是說，這些已知的小RNA就是srRNA。

有關專家認為，srRNA這一新概念的提出，一方面會加深對於小RNA的理解，另一方面會引起研究人員對於srRNA在不同生理病理過程中的作用和機制的重視，為糖尿病等疾病的診斷和治療提供新思路。

（原載於《中國科學報》 2013-02-25 第4版 綜合)

相關焦點

  • PLoS ONE:小核糖體RNA新概念
    近日，國際學術期刊PLoS ONE在線發表了中科院上海生科院營養科學研究所翟琦巍研究組的最新研究進展：「Profiling and Identification of Small rDNA-Derived RNAs and Their Potential Biological Functions」，提出了小核糖體RNA (Small rDNA-Derived RNA
  • 【中國科學報】「傲嬌」的核糖體:不是所有mRNA我都看得上
    論文通訊作者周旭宇告訴《中國科學報》。　　他介紹，調節性T細胞依據其活化狀態可以分為靜息狀態的cTreg和活化狀態的eTreg兩個亞群， TCR信號的激活對cTreg到eTreg的轉化是必需的。針對調節性T細胞的轉錄組學和蛋白質組學的聯合分析結果，已證實蛋白質和mRNA之間表達的相關性並不強，但目前在轉錄後層面對調節性T細胞活化狀態的調控機制，人們還知之甚少。
  • 葉綠體核糖體RNA加工分子機制研究獲進展—新聞—科學網
    中科院植物所要實現精確的RNA操作，需要特異地識別靶向目標RNA分子並對其進行剪切。但到目前為止，這類序列特異的RNA內切酶在自然界中還沒有被發現。因此，尋找一類序列特異的RNA內切酶顯得尤為重要。中科院植物研究所盧從明研究組日前在相關領域取得進展，相關論文2月6日在線發表於美國《國家科學院院刊》。
  • 光壽紅課題組在《PNAS》上揭示反義核糖體小幹擾RNA新功能
    核糖體RNA作為一類重要的非編碼RNA，是細胞內含量最高的RNA組分，同時也是細胞內蛋白質翻譯機器的主要組成成分。近日，中國科學技術大學光壽紅教授課題組首次揭示了反義核糖體小幹擾RNA（risiRNA）參與核糖體RNA代謝調控和穩態維持：即細胞內錯誤加工的核糖體RNA片段除了被代謝降解之外，還可以激活細胞內的RNA幹擾通路，合成risiRNA，並通過細胞核RNA幹擾通路對核糖體RNA在轉錄水平進行調控。
  • 核糖體RNA及其大小
    核糖體
  • RNA控制核糖體基因的沉默
    在這種現象中一套親代遺傳給雜合體子代的核糖體基因遭受沉默。當核仁在從單親那裡遺傳來的染色體上形成時，細胞核內就會發生核仁顯性現象。核糖核酸RNA基因的表達驅動了這些核仁的形成。兩種不同種類的植物或動物雜合後，總是選擇表達雜合中一特殊親代種類的核糖體RNA基因，而無論該特殊親代種類是母系還是父系。 核糖核酸RNA是核糖體的一個主要成分，而核糖體是細胞的蛋白生產基地。
  • 「傲嬌」的核糖體:不是所有mRNA我都看得上
    論文通訊作者周旭宇告訴《中國科學報》。他介紹，調節性T細胞依據其活化狀態可以分為靜息狀態的cTreg和活化狀態的eTreg兩個亞群， TCR信號的激活對cTreg到eTreg的轉化是必需的。針對調節性T細胞的轉錄組學和蛋白質組學的聯合分析結果，已證實蛋白質和mRNA之間表達的相關性並不強，但目前在轉錄後層面對調節性T細胞活化狀態的調控機制，人們還知之甚少。
  • 科學網—細胞核仁中長非編碼RNA機制獲揭示
    核糖體RNA（rRNA）與蛋白質結合形成核糖體，是蛋白質生物合成的裝配機。人體細胞中含有約400個拷貝的核糖體DNA序列，但僅有一半可以轉變成rRNA。rRNA轉錄不足將導致骨髓衰竭性貧血，轉錄過多則易引發多種癌症。 這項差異轉錄調控之謎長期未解。如今陳玲玲研究組對於SLERT的研究就此提出了一種新的機制，解答了這一謎團。
  • 【中國科學報】環形RNA在免疫過程中扮演重要角色
    【中國科學報】環形RNA在免疫過程中扮演重要角色 2019-04-30 中國科學報 黃辛 林濱霞 　　陳玲玲告訴《中國科學報》，這些發現不僅首次揭示了環形RNA的降解途徑及其特殊二級結構特徵，並提示環形RNA作為之前被忽略的一類新RNA分子家族可以通過形成雙鏈莖環結構發揮免疫調控的新功能。　　這項研究為環形RNA在天然免疫中的代謝和功能研究奠定了基礎，並為自身免疫病的臨床診療提供了新思路。
  • 非編碼RNA研究園地 | 一種大環肽與腫瘤發生的自然通訊
    該肽主要與rna結合蛋白(包括m6A)相互作用。m6A一個閱讀器IGF2BP1，因此被命名為「RNA結合調節肽」(RBRP)。具有編碼潛力的incRNAs的鑑定具有編碼潛力的incRNA必須與核糖體結合。
  • 核仁RNA聚合酶II促進核糖體生物發生
    核仁RNA聚合酶II促進核糖體生物發生 作者：小柯機器人 發布時間：2020/7/16 16:48:37 加拿大多倫多大學Karim Mekhail及其研究組發現核仁RNA聚合酶II促進核糖體形成。
  • 核仁與某種RNA的合成以及核糖體的形成有啥關係?
    核仁的功能是：與某種RNA的合成以及核糖體的形成相關。那麼問題來了，這裡的某種RNA和哪種RNA？和核仁相關這麼理解？根據「與核糖體的形成相關」不難推出，「某種RNA」應該是rRNA，也就是核糖體RNA。那麼，rRNA的合成應該是以DNA為模板的轉錄。轉錄過程在哪裡進行呢？
  • 【中國科學報】科學家提出電催化一氧化氮還原合成氨新策略
    【中國科學報】科學家提出電催化一氧化氮還原合成氨新策略 2020-03-30 中國科學報 劉萬生 龍軍 李佳怡 > 【字體：大 中 小】 語音播報
  • 核糖體RNA基因拷貝數變異和表達調控方面獲進展
    核糖體是細胞中最重要的細胞器之一，負責將細胞轉錄出來的信使RNA（messenger RNA，簡稱「mRNA」）翻譯成蛋白質。真核生物的核糖體，主要由4種核糖體 RNA（rRNA）和80多種核糖體蛋白組成。其中，45S rRNA基因位點通過轉錄加工可以產生18S、5.8S和25S rRNA；而5SrRNA基因位點行使5S rRNA的轉錄。隨後，25S、5.8S以及5S RNA結合核糖體蛋白形成核糖體大亞基，同時18S RNA與其他核糖體蛋白形成核糖體小亞基，最終組裝成細胞中的「蛋白加工工廠」。
  • 核糖體
    ，P49「核糖體有的附於粗面內質網上，有的游離在細胞質基質中，是「生產蛋白質的機器」」，P56「核仁核糖體的形成有關」【疑難問題】真核細胞的核糖體和原核細胞的核糖體有沒有區別？核糖體的具體結構是怎麼樣的？核糖體的形成和核仁有什麼詳細的關係？【疑難解析】生物界有兩種基本類型的核糖體：一種是原核細胞核糖體，另一個種是真核細胞核糖體。兩種核糖體都由兩個大小不同的亞基組成，每個亞基都含有rRNA和蛋白質。
  • 核糖體的結構
    好多讀者說找不到我們公眾號了大家星標一下，下回就能正常看到推送了喲~核糖體的結構
  • 【中國科學報】研究人員提出「動態尺寸效應」決定納米粒子穩定機制
    近日，中科院大連化物所研究員包信和、楊帆帶領納米與界面催化研究團隊，首次提出「動態尺寸效應」決定納米粒子穩定機制，相關研究成果發表在《自然—通訊》上。　　傳統認識中，納米材料隨尺寸減小、缺陷密度增高帶來高反應活性，但也會隨之犧牲長期的穩定性。
  • Molecular Cell:反義RNA新機制 核糖體競爭mRNA起始位點
    生物谷援引華文生技網報導：Uppsala大學研究人員最近發現了一種全新RNA抑制途徑，即反義RNA與核糖體競爭mRNA的起始位點，從而達到抑制或影響RNA轉錄的作用。文章發表於近日出版的Molecular Cell上。      以往人們一直認為反義RNA通過與mRNA結合，從而抑制核糖體閱讀目標基因，抑制了mRNA轉錄。
  • 最微觀清晰的核糖體結構圖
    惠特福德和康奈爾大學醫學院，美國加州大學伯克利分校和洛斯阿拉莫斯國家實驗室的合作者提出了一種計算的框架，被稱為核糖體的分子機器，這一研究可更好地幫助我們了解核糖體的引擎原理，相關論文發表在近期的PLoS計算生物學上。我們都知道，一般的汽車是如何工作的：踩動油門踏板前進，剎車停止，方向盤決定方向。不過，彈出打開引擎蓋，你會發現這些零件在不同的汽車中有很多的細微差別。
  • 學習筆記 核糖體的結構
    核糖體就是一個。印象中細胞中大量的游離核糖體，由蛋白質和RNA組成的巨大複合體（印象裡總覺得複合體的大部分是蛋白質），將mRNA翻譯成蛋白質；還有粗面內質網上的核糖體，主要合成分泌蛋白，經由高爾基體將分泌蛋白運出細胞。       今天聽高寧老師報告，看到這張圖： Gao, N., and Frank, J. (2006).