瑞金新技術(十二)| 急性白血病和髓系腫瘤基因突變組合(panel)檢測

2020-12-03 澎湃新聞

瑞金新技術（十二）| 急性白血病和髓系腫瘤基因突變組合（panel）檢測

2020-11-30 18:26 來源：澎湃新聞·澎湃號·政務

原創 瑞金醫院宣傳科 上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院

生命至上，守正創新

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急性白血病和髓系腫瘤基因突變組合檢測

瑞金新技術

急性白血病和髓系腫瘤基因突變組合(panel)檢測是血研所臨檢實驗室在前期臨床研究的基礎上，自主開發的基於液相探針捕獲和高通量測序技術的覆蓋100個相關基因的基因突變檢測，具有高準確性、高靈敏度、高覆蓋均一性、高捕獲效率和低成本的優勢，適用於急性白血病和髓系腫瘤患者基因突變篩查。

急性白血病是起源於造血幹細胞的惡性克隆性疾病，其特徵為異常的（白血病性）原始細胞及幼稚細胞大量增殖而正常血細胞生成障礙。急性白血病主要分為急性髓細胞白血病（acute myeloid leukemia, AML）和急性淋巴細胞白血病（acute lymphocytic leukemia, ALL），臨床表現為貧血、出血、感染和浸潤等症狀，進展迅速，自然病程僅數月。在兒童及35歲以下成人惡性腫瘤死亡率位居第一。近年來，依據細胞遺傳學異常進行危險度分層的規範化治療顯著提高了這類患者的預後，但仍有約半數的患者缺乏克隆性細胞遺傳學異常而無法得到有效治療，是急性白血病診治面臨的挑戰。

髓系腫瘤是一組高度異質性的造血系統惡性疾病，主要包括上述急性髓細胞白血病（AML）以及骨髓增生異常症候群（myelodysplastic syndrome，MDS）、骨髓增殖性腫瘤（mye1opro1iferative neoplasm，MPN）和骨髓增生異常/骨髓增殖性腫瘤（myelodysplastic/myeloproliferative neoplasm，MDS/MPN）等，多發生於中老年人，具有向急性白血病轉化風險，危害著人們的生命健康。隨著我國人口向老齡化發展，此類疾病發病率有逐年增加趨勢。

隨著分子診斷技術的日益發展，新的白血病和髓系腫瘤分子標誌物不斷湧現。這些疾病特異的分子標誌物為白血病和髓系腫瘤的診斷分型、危險分層，個體化治療、靶向治療及評估預後轉歸提供可靠依據。白血病和髓系腫瘤的診斷也從過去以形態學為主的診斷體系，轉向以精準分子診斷為核心的個體化診斷體系發展。驅動白血病和髓系腫瘤發生的基因突變，如NPM1、CEBPA、FLT3、DNMT3A、KIT、NRAS、TP53、RUNX1、ASXL1、IDH1、IDH2 、TET2、SF3B1、NOTCH1、JAK2、CALR和MPL等，已納入WHO造血和淋巴組織腫瘤分型標準（2016）和我國血液病診療指南，成為臨床必需的常規檢測項目。

為了滿足臨床對急性白血病和髓系腫瘤精準分子分型的需求，血研所臨檢實驗室在前期臨床研究的基礎上，自主開發了基於液相探針捕獲和高通量測序技術的覆蓋100個基因的急性白血病和髓系腫瘤基因突變組合(panel)檢測，以及配套的生物信息自動化分析軟體和血液病資料庫。集探針和分析軟體的整體解決方案保障了此panel在臨床應用中既準確可靠又高效便捷。對臨床開展panel檢測的一年中顯著提升了患者分子異常的檢出率，篩選出更多的高危患者和克隆演進患者，已成為急性白血病和髓系腫瘤精準診治不可或缺的檢測手段。

依據造血和淋巴組織腫瘤WHO分類標準、國內外診療指南、專家共識以及權威文獻或大規模臨床研究報導，醫院設計了適用於急性白血病和髓系腫瘤的100個基因探針組合，並在高GC含量區域進行了探針長度和覆蓋度的優化，對於已知突變設計突變體探針以保證複雜突變的平衡捕獲。在數據分析上，醫院開發了一套多算法比對軟體和並行計算策略，確保數據分析準確快速。

該panel檢測利用高通量測序的技術優勢，可一次在一管反應中並行檢測100個基因（315K）的分子變異，較之前的一代測序技術（單次單管反應檢測長度為1K）顯著提高了基因突變的檢測效率。100個基因的檢測覆蓋度也提高了疾病分子異常的檢出率，其中非M3-AML提高了19.19%( 98.26% vs 79.07%)，不伴融合基因-ALL提高了37.50%( 100% vs 62.50%)，MDS、MDS/MPN、MPN 提高了47.91%( 89.58% vs 41.67%)。異常檢出率的提高不僅豐富了我們對急性白血病和髓系腫瘤發病機制的認識，更重要的是能讓我們根據基因突變對患者進行精準的分子分型、預後分層，為個體化治療提供可靠依據，並為尋找新的治療靶點提供重要線索。

panel檢測還篩選出更多的高危白血病患者（41.6% vs 34.7%），使其儘早行骨髓/造血幹細胞移植治療，改善他們的預後。

panel檢測不僅在初治患者的診斷分型、預後分層中發揮作用，其在患者治療過程中對微小殘留病灶和克隆演變的監測具有更大的優勢。研究已在隨訪的患者中發現2例克隆演進的髓系腫瘤患者，為臨床治療方案的調整提供了依據。

專家門診：

1、李軍民 周三下午/周四下午(特約）

2、沈楊 周三下午，周五上午（特約）

3、吳文 周三上午（特約），周四下午

4、張蘇江 周二下午，周四下午（特約）

5、陳秋生 周四下午/周五下午

6、陳瑜 周二上午/周四下午

7、鄭宇 周一上午/周四下午

8、陳麗 周二下午/周三上午

專病門診：

1、急性白血病專病（每周一、周四下午）

2、骨髓增生異常症候群/骨髓增殖性腫瘤（MDS/MPN）專病（每周三下午）

原標題：《瑞金新技術（十二）| 急性白血病和髓系腫瘤基因突變組合（panel）檢測》

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