PCR ARRAY應用——信號通路篇

2020-12-04 PCR晶片網

·案例一：WNT信號通路PCR ARRAY

·案例二：Toll樣受體信號通路和炎性細胞因子PCR ARRAY

·案例三：小鼠TGF-β/BMP信號通路PCR ARRAY

·案例四：小鼠p53信號通路PCR ARRAY

·案例五：大鼠NFκB信號通路PCR ARRAY

·案例六：人MAPK信號通路PCR ARRAY

·案例七：人低氧信號通路PCR ARRAY

·案例八：人DNA損傷信號通路PCR ARRAY

·案例九：人細胞死亡通路發現PCR ARRAY

·案例十：DNA修覆信號通路PCR ARRAY

案例一

CCN3對系統性硬化症和馬凡氏症候群中原纖維形成的拮抗作用

文章信息：

Antagonistic Effect of the Matricellular Signaling Protein CCN3 on TGF-b- and Wnt-Mediated Fibrillinogenesis in Systemic Sclerosis and Marfan Syndrome

Raphael Lemaire , Giuseppina Farina, Julie Bayle , Michael Dimarzio

doi:10.1038/jid.2010.15

發表雜誌：Journal of Investigative Dermatology （IF=7）

實驗材料：瀰漫性系統硬化症（SSc）患者皮膚

實驗方法：瀰漫性SSC患者(n=12)和健康對照者(n=5)皮膚進行WNT信號通路PCR ARRAY檢測

實驗目的：研究瀰漫性SSc皮膚中fibrillin-1和CCN3和Wnt刺激的關聯，檢測了瀰漫性SSc中的Wnt信號和活性。

使用晶片：WNT信號通路PCR ARRAY

案例二

急性應激對脾臟固有免疫功能的影響

文章信息：

The impact of acute-stressor exposure on splenic innate immunity: A gene expression analysis

Thomas Maslanik , Isaac Bernstein-Hanley , Bryan Helwig , Monika Fleshner

https://doi.org/10.1016/j.bbi.2011.08.006

發表雜誌：Brain, Behavior, and Immunity （IF=6）

實驗材料：344隻成年雄性Fisher大鼠

實驗方法：對大鼠進行壓力試驗，隨後用toll樣受體信號和炎症細胞因子和受體PCR陣列比較應激組和對照組大鼠脾臟基因表達的差異

實驗目的：研究急性應激源暴露對脾臟免疫調節因子表達的影響。

使用晶片：Toll樣受體信號通路PCR ARRAY和炎性細胞因子PCR ARRAY

案例三

TGF-β途徑介導阿黴素（DOX）對心肌內皮細胞的作用

文章信息：

The TGF-β pathway mediates doxorubicin effects on cardiac endothelial cells

Zuyue Sun , Jill Schriewer , Mingxin Tang , Jerry Marlin , Frederick Taylor

https://doi.org/10.1016/j.yjmcc.2015.12.010

發表雜誌：Journal of Molecular and Cellular Cardiology （IF=4）

實驗材料：C57BL/6 小鼠

實驗方法：實驗組小鼠注射Dox無菌鹽水溶液（n=24，每隻動物每周注射6次Dox），對照組小鼠注射生理鹽水（n=17），BMP/TGF-β途徑PCR陣列分析Dox治療6周後小鼠心臟的基因表達情況

實驗目的：研究阿黴素對小鼠心臟基因表達的影響

使用晶片：小鼠TGF-β/BMP信號通路PCR ARRAY

案例四

Mdm2 Ser394的ATM磷酸化調節小鼠DNA損傷反應

文章信息：

ATM Phosphorylation of Mdm2 Ser394 Regulates the Amplitude and Duration of the DNA Damage Response in Mice

Hugh S. Gannon, Bruce A. Woda, and Stephen N. Jones

DOI 10.1016/j.ccr.2012.04.011

發表雜誌：Cancer Cell （IF=26）

實驗材料：帶有Mdm2 Ser394的小鼠

實驗方法：使用p53信號通路PCR陣列對受輻照的WT小鼠和A / A純合小鼠、D / D純合小鼠胸腺細胞中的多個p53靶基因進行分析

實驗目的：研究經輻照處理的小鼠胸腺細胞中Mdm2 Ser394對p53靶基因的激活機制

使用晶片：p53信號通路PCR ARRAY

案例五

慢性青春期應激性（CAS）改變大鼠中樞和周圍神經免疫反應性

文章信息：

Chronic Adolescent Stress Sex-Specifically Alters Central and Peripheral Neuro-Immune Reactivity in Rats

Mandakh Bekhbat, Paul A. Howell, Sydney A. Rowson, Sean D. Kelly, Malú G. Tansey, Gretchen N. Neigh

https://doi.org/10.1016/j.bbi.2018.12.005

發表雜誌：Brain, Behavior, and Immunity （IF=6）

實驗材料：將大鼠分為四組：1）雌性/NS/LPS後2h；2）雌性/CAS/LPS後2h；3）雄性/NS/LPS後2h；4）雄性/CAS/LPS後2h

實驗方法：雄性和雌性青春期大鼠進行CAS範式壓力或未受到任何壓力。壓力試驗後所有大鼠注射脂多糖或媒介物的，NFκB信號PCR晶片檢測大鼠海馬體

實驗目的：在雄性和雌性大鼠海馬體中CAS對NFκB相關基因的表達的影響

使用晶片：大鼠NFκB信號通路PCR ARRAY

案例六

IGF1R/IRS1可抑制急性淋巴細胞白血病細胞PI3K/AKT/mTOR和MAPK信號轉導

文章信息：

IGF1R/IRS1 targeting has cytotoxic activity and inhibits PI3K/AKT/mTOR and MAPK signaling in acute lymphoblastic leukemia cells

Jaqueline Cristina Fernandes , Bruna Alves Fenerich , Juan Luiz Coelho-Silva, Priscila Santos Scheucher

https://doi.org/10.1016/j.canlet.2019.04.030

發表雜誌：Cancer Letters（IF=7）

實驗材料：人急性淋巴細胞白血病細胞系Jurkat、MOLT-4、Namalwa、Raji和來自健康捐贈者和所有患者的原代細胞

實驗方法：DMSO和NT157處理Jurkat細胞，使用PCR陣列測試了它們對MAPK調控基因表達的影響

實驗目的：為了研究IGF1R信號抑制劑影響細胞周期進程的分子機制

使用晶片：人MAPK信號通路PCR ARRAY

案例七

長期低氧對乳腺癌細胞系MCF7基因表達的影響

文章信息：

Gene expression alterations in chronic hypoxic MCF7 breast cancer cell line

Feda' H. Hamdan, Malek A. Zihlif

https://doi.org/10.1016/j.ygeno.2014.10.010

發表雜誌：Genomics（IF=6）

實驗材料：MCF7乳腺癌細胞

實驗方法：將MCF7細胞暴露於低氧環境中，常氧細胞為對照，進行低氧信號通路PCR陣列檢測

實驗目的：缺氧細胞與常氧細胞基因表達差異

使用晶片：人低氧信號通路PCR ARRAY

案例八

金雀異黃素對HL-7702細胞的輻射防護作用

文章信息：

Radioprotective effects of genistein on HL-7702 cells via the inhibition of apoptosis and DNA damage

Lihua Song , Lijun Ma , Fengsong Cong , Xiuhua Shen , Pu Jing , Xiong Ying, Haiyue Zhou, Jing Jiang , Yongye Fu , Hongli Yan

https://doi.org/10.1016/j.canlet.2015.06.008

發表雜誌：Cancer Letters（IF=7）

實驗材料：人胚肝L-02細胞

實驗方法：L-02細胞分為非處理對照組（NC）、金雀異黃素處理組（GEN）、輻射（R）組和金雀異黃素+輻射組（GEN+R），使用含96個基因的DNA損傷信號通路PCR ARRAY檢測

實驗目的：研究GEN減輕放射線誘導的DNA損傷的分子機制。

使用晶片：人DNA損傷信號通路PCR ARRAY

案例九

草甘膦對人神經母細胞瘤細胞氧化應激、神經元發育和細胞死亡信號通路的影響

文章信息：

Use of human neuroblastoma SH-SY5Y cells to evaluate glyphosate-induced effects on oxidative stress, neuronal development and cell death signaling pathways

María-Aránzazu Martínez, José-LuisR odríguez, Bernardo Lopez-Torres

https://doi.org/10.1016/j.envint.2019.105414

發表雜誌：Environment International （IF=7）

實驗材料：人多巴胺能神經母細胞瘤SH-SY5Y細胞系

實驗方法：草甘膦和AMPA處理細胞，進行細胞死亡通路發現PCR ARRAY檢測，對比處理組和對照組基因表達差異

實驗目的：草甘膦和AMPA對細胞死亡途徑基因表達譜的影響

使用晶片：人細胞死亡通路發現PCR ARRAY

案例十

甲醛（FA）和丙烯醛（ACR）混合物對人支氣管上皮BEAS-2B細胞的分子機制

文章信息：

The multiplex interactions and molecular mechanism on genotoxicity induced by for-maldehyde and acrolein mixtures on human bronchial

Sen Zhang, Huan Chen, Jingni Zhang, Jun Li, Hongwei Hou, Qingyuan Hu

https://doi.org/10.1016/j.envint.2020.105943

發表雜誌：Environment International （IF=7）

實驗材料：人支氣管上皮BEAS-2B細胞

實驗方法：甲醛（FA），丙烯醛 （ACR），甲醛和丙烯醛混合物（FAM）處理BEAS-2B細胞，進行DNA修覆信號通路PCR ARRAY檢測

實驗目的：研究FA，ACR，FAM在DNA修覆信號通路中的分子機制

使用晶片：DNA修覆信號通路PCR ARRAY

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