對人類胚胎進行基因編輯一直是一件飽受爭議的事情。圖片來源:Pascal Goetgheluck/Science Photo LibraryEditing of human embryos is controversial.
近日,科學家進行了一系列使用CRISPR-Cas9編輯人胚胎基因組的實驗。結果揭示,該過程可能對靶位點或其附近的基因組造成不必要的巨大變化。
這三項獨立研究均已發表在預印本伺服器bioRxiv上,並揭示了CRISPR–Cas9基因編輯的新風險。既往研究表明,CRISPR–Cas9引起的脫靶突變常常發生在距離靶點很遠的位置。但最近的研究發現,不僅僅是目標位點的遠處,CRISPR–Cas9也會在目標位點附近引入不必要的突變,這是傳統方法所不能檢測到的。
澳大利亞國立大學遺傳學家Gaétan Burgio表示,這些靶向效應更重要、更難以消除。
編輯人類胚胎來預防遺傳病的安全爭論一直在持續,因為這樣做會對基因組造成永久、可遺傳的改變。「如果把以生殖為目的的人類胚胎基因編輯活動比作是太空飛行,那麼最新的研究相當於把發射臺上未起飛的火箭給炸了。」美國加州大學伯克利分校研究基因編輯的Fyodor Urnov說。
2015年,研究人員在實驗室首次使用CRISPR編輯人類胚胎。從那時起,世界各地的研究團隊開始嘗試這個過程,目的是對基因進行精確的編輯。但這樣的研究仍然很少,而且通常受到嚴格的監管。
CRISPR-Cas9基因編輯的關鍵是細胞主動修復被切割的DNA。「這些最新研究告訴我們,人們對這個過程的了解遠遠不夠。」英國紐卡斯爾大學生殖生物學家Mary Herbert說,用Cas9酶攻擊DNA之前,我們需要充分了解細胞裡究竟會發生什麼。
英國弗朗西斯·克裡克研究所發育生物學家Kathy Niakan團隊於6月5日在bioRxiv發布了第一篇論文。在這項研究中,研究人員使用CRISPR-Cas9在POU5F1基因中引入突變,該基因對胚胎發育很重要。在18個被編輯的胚胎中,約22%被檢出在POU5F1周圍發生大量突變,包括DNA的重排和數千個鹼基的缺失。這遠遠超出了研究人員的預期。
另一篇研究由美國哥倫比亞大學幹細胞生物學家Dieter Egli實驗室完成,他們試圖使用CRISPR-Cas9糾正EYS2基因的突變,這種突變會導致失明。基因編輯後,大約一半的胚胎丟失了大量的染色體片段,有時甚至是EYS基因所在的整個染色體。
第三篇研究是美國俄勒岡健康與科學大學生殖生物學家Shoukhrat Mitalipov課題組負責。他們研究了帶有引發心臟疾病突變的胚胎,也發現CRISPR-Cas9編輯會影響目標位點所在的染色體。
這些意想不到的後果是DNA修復機制帶來的。CRISPR-Cas9通過一小段 RNA將Cas9酶定位到目標位點,隨後Cas9切斷兩條DNA鏈,最後細胞會修復這個雙鏈缺口。
基因編輯是在修復過程中發生的。通常情況下,細胞會用一種容易出錯的機制來修復缺口,結果是少量鹼基的插入或刪除。如果人為地給細胞提供DNA模板,細胞有時會用這個模板來修補缺口,從而引入新的DNA序列。但是,DNA雙鏈斷裂還會導致DNA序列的混亂或染色體的缺失。
既往研究已表明,在小鼠胚胎或人類細胞中使用CRISPR編輯會造成不必要的巨大影響。但是,Urnov表示,在人類胚胎中完成這項工作也很重要,因為不同的細胞類型可能對基因編輯做出不同的反應。
之前的研究通常只關注單個或幾個鹼基的突變,從而遺漏了這種大規模的染色體變異。最新的三項研究專門尋找這些目標位點附近的大規模突變,Urnov認為,科學界應更加認真地對待這一問題,而不是心存僥倖。
三項研究提出了不同的機制以解釋觀察到的現象。Egli和Niakan的團隊將胚胎中觀察到的大部分變化歸因於大量的缺失和重排。Mitalipov團隊認為,他們發現的變異中有40%由基因轉換引起。
相關論文信息:
https://doi.org/0.1101/2020.06.05.135913
https://doi.org/10.1101/2020.06.17.149237
https://doi.org/10.1101/2020.06.19.162214
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