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細菌ClassIII轉錄因子CueR轉錄激活的分子機制被揭示
Nature Chem Biol | 張餘研究組揭示細菌ClassIII轉錄因子CueR轉錄激活的分子機制以下文章來源於中科院分子植物卓越中心 ,作者CEMPS2020年9月28日,Nature Chemical Biology 在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心合成生物學重點實驗室張餘研究組題為
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研究揭示細菌ECFσ因子介導的轉錄起始分子機制
該文主要研究了細菌ECF σ因子的結構、ECF σ因子特異性識別啟動子DNA序列,以及ECFσ因子起始轉錄的分子機制,重點探討了ECF σ因子的σ2/σ4 linker區域的結構與功能。 細菌基因轉錄首先需要DNA-directedRNA polymerase (RNAP)與轉錄起始σ因子形成RNA聚合酶全酶,隨後RNAP全酶識別啟動子DNA,打開雙鏈DNA形成轉錄泡,起始RNA合成。細菌的基因表達主要由轉錄起始σ因子調控。其中看家σ因子負責細菌基本生命活動的基因表達。
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研究揭示出一類新的細菌轉錄調控因子的結構功能機制
轉錄是RNA聚合酶根據基因的DNA序列合成信使RNA的過程,是基因表達的起始步驟。在細菌中,σ因子是RNA聚合酶識別基因啟動子並起始轉錄的關鍵組分。近年來,在一些梭菌和桿菌中發現一類廣泛存在的σ因子及其共轉錄的抗σ因子——SigI和RsgI,它們的一些結構域和已知蛋白沒有同源性,代表了一類新的特殊的細菌σ/抗σ因子。熱纖梭菌等一些產纖維小體細菌具有8-16對的SigI/RsgI因子,這在其他已知類型的σ/抗σ因子中比較少見。已有的研究表明這些SigI/RsgI因子負責纖維小體的調控表達,但其結構與功能機制仍未闡明。
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Cell| 揭示廣泛存在於細菌中的逆轉錄酶系統是抗噬菌體防禦系統的一部分
揭示了廣泛存在於細菌中的逆轉錄酶系統是抗噬菌體防禦系統的一部分,其機制主要是通過阻礙噬菌體感染介導抗噬菌體活性的產生。逆轉錄酶是由一個非編碼RNA(ncRNA)和一個特殊的逆轉錄酶(RT)組成的遺傳元件。RT以ncRNA為模板,生成RNA和DNA組分共價連接的嵌合RNA/DNA分子。
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Nature Chem Biol | 張餘研究組揭示細菌ClassIII轉錄因子CueR轉錄...
大約50年前,法國著名科學家Jacob和Monod發現乳糖操縱子,首次提出基因表達受到蛋白調控。在隨後的幾十年中,科學家們利用化學交聯、DNA足跡、遺傳突變等方法嘗試了解轉錄因子調控基因轉錄的具體機制,大家發現轉錄因子在啟動子DNA的結合位置直接決定了其對於下遊基因的影響,一般來講,轉錄因子結合在核心啟動子區域(-35區和-10區)上遊發揮轉錄激活功能,轉錄因子結合在核心啟動子區域或者基因內部則抑制轉錄。
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科學家揭示瘧疾感染時CD4+ T細胞內效應因子動態轉換的機制
科學家揭示瘧疾感染時CD4+ T細胞內效應因子動態轉換的機制 作者:小柯機器人 發布時間:2020/10/13 16:39:03 澳大利亞彼得·多爾蒂感染與免疫研究所Ashraful Haque研究團隊在研究中取得進展。
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分子植物卓越中心等揭示細菌Class III轉錄激活機制
Class III轉錄因子CueR轉錄激活的分子機制。Steitz研究組以CAP為模型,在Science上報導細菌Class I與II轉錄激活因子與RNA聚合酶及啟動子DNA的複合物結構,揭示出經典的轉錄激活分子機制。總體來說,它們通過DNA結合結構域與啟動子DNA相互作用,通過其轉錄激活結構域與RNA聚合酶相互作用,將RNAP聚合酶富集到其調控的啟動子DNA區域激活轉錄。在探索CAP轉錄激活機制的同時,David C.
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分子植物卓越中心等揭示細菌Class III轉錄激活機制
9月28日,中國科學院分子植物科學卓越創新中心合成生物學重點實驗室研究員張餘課題組在Nature Chemical Biology上,在線發表題為CueR activates transcription through a DNA distortion mechanism的研究論文,主要研究細菌Class III轉錄因子CueR轉錄激活的分子機制。
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揭示先鋒轉錄因子在細胞凋亡表觀遺傳中的關鍵作用 | Cell Research
Evans, Yunfu Sun, Gergana Dobreva 發表時間:2019/04/25 數字識別碼: 10.1038/s41422-019-0168-1 原文連結:http://t.cn/EKljgTi 微信連結:https://mp.weixin.qq.com/s/sneIJJuGWsIcJ9oXFLlI4A
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研究揭示轉錄因子Foxp3塑造調節性T細胞身份的機制
研究揭示轉錄因子Foxp3塑造調節性T細胞身份的機制 作者:小柯機器人 發布時間:2020/11/11 22:43:59 美國斯隆凱特林研究所Alexander Y.
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Cell | 細菌逆轉錄酶在抗噬菌體防禦中的作用
2020年11月5日,以色列魏茨曼科學研究所分子遺傳學系Rotem Sorek研究組在Cell 雜誌上發表文章Bacterial Retrons Function In Anti-Phage Defense,揭示了廣泛存在於細菌中的逆轉錄酶系統是抗噬菌體防禦系統的一部分
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基因轉錄調控:共激活因子的多樣性及調控機制
Roeder教授首先發現了真核生物RNA聚合酶I、II、III,從而開創了真核生物轉錄調控領域。隨後Roeder實驗室採用生物化學方法建立了體外轉錄系統,並利用該系統分離和鑑定了眾多關鍵轉錄調控因子,其中包括第一個真核轉錄因子TFIIIA、中介體複合物(mediator)以及多種通用轉錄因子(GTFs),並且揭示了染色質結構(包括組蛋白修飾)在表觀遺傳水平對基因轉錄的影響。
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細菌轉錄爆發現象的分子機制被揭示
最近,哈佛大學化學與生物化學系的謝曉亮實驗室與北京國際數學研究中心的葛顥研究員合作,揭示了細菌內轉錄隨機爆發現象(Transcriptional bursting)的分子機制,這種隨機性是很多細胞和組織中細胞與細胞間基因表達量不同的主要根源之一
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研究揭示蛻膜NK細胞抵抗滋養層細菌感染機制
研究揭示蛻膜NK細胞抵抗滋養層細菌感染機制 作者:小柯機器人 發布時間:2020/8/23 21:47:34 美國哈佛醫學院Judy Lieberman等研究人員合作發現,蛻膜NK細胞通過轉移顆粒溶素來選擇性殺死滋養細胞中的細菌
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Sci Adv & Cell Death & Dis:揭秘特殊轉錄因子LRH-1在機體炎性...
2019年8月4日 訊 /生物谷BIOON/ --近日,一項刊登在國際雜誌Science Advances上的研究報告中,來自堪薩斯大學的科學家們通過研究發現,LRH-1蛋白或在機體免疫系統中扮演著關鍵的角色,抑制該蛋白的功能或能有效幫助治療多種炎性疾病。
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Cell:揭示精細胞存在廣泛的轉錄掃描機制
圖片來自Cell, 2020, doi:10.1016/j.cell.2019.12.015。這項研究著重關注生物學的一個奧秘:人精細胞激活的基因數量是迄今為止最多的(90%),這種模式也在小鼠、鳥類和果蠅等其他物種中觀察到。大多數器官中的細胞表達大約60%的遺傳密碼,或僅表達某種細胞類型完成它的特定任務所需的一部分基因。
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研究揭示VOZ轉錄因子介導的水稻抗稻瘟病新機制
近日,中國農業科學院植物保護研究所作物有害生物功能基因組研究創新團隊發現高等植物特有的維管植物單鋅指(VOZ)轉錄因子是植物抗病的關鍵因子,揭示了VOZ轉錄因子作為橋梁連通泛素連接酶對抗病蛋白調控的分子機制,為創製新的病害防控策略和抗病分子育種奠定了理論基礎。
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研究揭示cGAMP信號保護細菌免受病毒感染機制
研究揭示cGAMP信號保護細菌免受病毒感染機制 作者:小柯機器人 發布時間:2019/9/19 14:04:57 以色列魏茨曼科學研究所Rotem Sorek和Gil Amitai合作發現了環GMP-AMP(cGAMP)信號保護細菌免受病毒感染的機制
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浙中醫藥學院開國銀團隊揭示bZIP轉錄因子調控丹參中酚酸與丹參酮生物合成的分子機制
(ABA)響應的bZIP轉錄因子SmbZIP1正調控丹酚酸但負調控丹參酮生物合成的分子機制。由於近年來野生丹參資源匱乏,人工種植丹參品質退化嚴重,如何提高丹參中活性成分酚酸類與丹參酮的含量成為中藥資源領域的研究熱點之一,而深入解析丹參活性成分生物合成的調控機制是開展丹參活性成分代謝工程的基礎。研究表明遺傳操縱轉錄因子能夠顯著促進植物中次級代謝產物的生物合成。
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生物物理所等揭示轉錄因子STAT6特異識別N4位點DNA的分子機制
11月1日,《美國科學院院刊》(PNAS)雜誌在線發表了中國科學院生物物理研究所題為Structural basis for DNA recognition by STAT6 的研究論文,首次揭示STAT6對N4位點DNA的識別機制。