薑還是老的辣:看噬菌體如何對抗超級細菌

2020-12-05 中國科普博覽

出品:科普中國

製作:顏飛(中國科學院青島生物能源與過程研究所)

監製:中國科學院計算機網絡信息中心

據中新網報導,新型超級細菌席捲多國,美國感染者近半數在90天內喪命!

「超級細菌」這個字眼並不是第一次霸據螢屏,短短十幾年間它曾多次登上各大媒體的頭條。

KPBS Public Media(KPBS大眾傳媒)曾報導過加州大學教授Tom Patterson與病魔戰鬥的傳奇事跡。

Patterson與妻子遊覽埃及金字塔時突感身體不適,被當地醫院診斷為胰腺炎。在接受治療後Patterson的病情卻持續惡化,於是妻子立刻將他轉移到了德國最好的醫院。德國的大夫對Patterson做了全面的檢查後拿著診斷報告找到了妻子。

「Strathdee女士,這裡有一個好消息和一個壞消息。」

「呃……」

「好吧,好消息就是Patterson並沒有得胰腺炎。」

「太好了!」

「壞消息就是他感染了超級細菌——『鮑曼不動桿菌』。」

「天啊!」

超級細菌:自然界的超級bug

世間萬物生生相剋才能維持自然界的生態平衡,而超級細菌卻不斷地挑戰著這一生存法則。

超級細菌(Superbacteria), 泛指對多種抗生素具有耐藥性的細菌,又稱「多重耐藥性細菌」。抗生素的濫用,可以說是細菌進化成耐藥菌的一大推手。

圖片來源:http://www.163.com/

2016年霍金就在《衛報》上發出警告:「也許不用外星人或隕石撞擊出手,人類濫用抗生素所致的『超級細菌』就足以顛覆世界秩序。」從長遠來看,濫用抗生素莫過於「飲鴆止渴」。人類一手打造的超級細菌,反過頭來又毒害著人類。在上文提到的「鮑曼不動桿菌」就是全球六大「毒梟」之一。

鮑曼不動桿菌(圖片來源:https://en.wikipedia.org/)

眼看著Patterson危在旦夕,醫生們已經向超級細菌舉起了白旗。妻子Strathdee對醫生們說:「也許我可以試試!」原來妻子Strathdee的真實身份是加州大學聖地牙哥全球健康研究所的所長兼傳染病流行病專家!

Strathdee認為既然主流醫學對超級細菌束手無策,就應該另闢蹊徑。面對有35億年進化歷史的細菌,人類唯有到遠古時代去尋找擊敗它的武器。Strathdee歷經千難萬險最終找到了這把「上古寶劍」——噬菌體療法。

噬菌體:人類的「病毒僱傭軍」

噬菌體是一種可以感染和殺滅細菌的病毒,利用該特性可以將噬菌體用於抗菌治療。

鑑於抗生素抗菌的良好療效,噬菌體療法漸漸被人們拋之腦後。直到超級細菌的出現,才使得這把 「上古寶劍」得以重出江湖。

噬菌體病毒結構簡單,靠兩種方式繁殖

噬菌體結構簡單,只由核酸和蛋白質外殼構成。

包括T4噬菌體在內,大多數噬菌體呈「複合對稱殼體結構」,其頭部呈二十面體對稱,尾部呈螺旋對稱。在幾何學立方對稱結構中,以二十面體容積最大。因此採取此種蛋白結構,使得噬菌體可以包裝更多的核酸。

圖片來源:https://en.wikipedia.org/

噬菌體在自然界中的含量極其豐富,約為107 /cm3,我們每天隨食物就可吃下大量噬菌體。

根據繁殖方式可分為溶菌性和溶原性噬菌體。

1、溶菌性噬菌體

溶菌性噬菌體是把自己的基因組注入到宿主菌內進行編碼和複製,組裝成子代噬菌體後裂解宿主菌, 釋放出子代噬菌體。

2、溶源性噬菌體

溶源性噬菌體將基因整合於細菌染色體上,隨細菌染色體的複製而複製,並隨細菌分裂而分配至子代細菌的染色體中,從而達到共存狀態。偶爾可自發地或在某些外界因素的刺激下,進入溶菌性周期,導致細菌裂解。

根據溶菌性噬菌體的這一特性,可將噬菌體作為抗菌製劑來治療相關的細菌感染疾病。

那麼噬菌體是如何吃掉細菌的呢?

以T4噬菌體為例,其溶菌周期包括吸附、注射、合成、裝配和釋放五個階段:

吸附:吸附是病毒複製的第一步,也是成功的關鍵。T4噬菌體尾部的尾絲蛋白可與宿主細胞壁上的受體蛋白特異性結合。

注射:噬菌體通過尾部收縮將衣殼內的核酸注入宿主細胞內。

合成:噬菌體基因組利用宿主細胞合成核酸和蛋白質的場所、原料、能量,完成自身大分子的合成。

裝配:噬菌體大分子以一定方式結合,組裝成完整的子代噬菌體,標誌著噬菌體的成熟。

釋放:T4噬菌體裝配完成後以裂解的方式釋放,釋放出的子代病毒又可繼續感染新的細菌,啟動新一輪的溶菌周期。

T4噬菌體溶菌周期(圖片來源:https://en.wikipedia.org/)

亮劍!噬菌體VS超級細菌

相比傳統的抗生素療法,噬菌體療法有諸多優勢。

其一,噬菌體是可以複製的「活藥」,只需小劑量給藥;其二,抗生素的使用容易引起細菌的耐藥性,而噬菌體與細菌在自然界中共同進化,因此能克服細菌抗性;其三,抗生素的廣譜性導致其會對人體的有益菌產生不同程度的損害,破壞體內菌群環境,而噬菌體的專一性則賦予了我們精準打擊的能力。

噬菌體感染細菌(圖片來源:scitech.people.com.cn/)

1、噬菌體雞尾酒療法

大多數噬菌體菌株的寄主範圍過於狹窄,也在一定程度上限制了噬菌體的臨床應用。將多種具有不同裂菌譜的噬菌體製成混合製劑,就像「雞尾酒」,這種製劑可以很好的解決這一問題。

噬菌體雞尾酒療法已被成功應用數十年,由於具有廣譜性,且可降低耐受細菌出現的頻率,仍是目前噬菌體治療主要發展方向之一。

2、噬菌體的基因編輯

合成生物學的興起,使得噬菌體的遺傳改造搭上了快車。

溶菌性噬菌體在裂解細菌的同時,會造成細菌內毒素的大量釋放,引發機體的炎症反應。利用遺傳改造生產複製缺陷或裂解缺陷的噬菌體可避免這一問題。同樣,基因編輯也可以賦予噬菌體對細菌的廣譜性。

3、噬菌體編碼產物

研究發現噬菌體通過「早期蛋白」挾持宿主資源,完成其複製增殖過程。早期蛋白有幹擾宿主細胞DNA複製、抑制細胞正常分裂等功能。目前已利用早期蛋白設計出多種小分子抗菌化合物。

同時,相比活性噬菌體,噬菌體裂解酶具有不可增殖、易於定向操作、較少細菌抗性影響等優點,包括內溶素在內的噬菌體裂解酶已被用於多種細菌感染的防治。

多虧噬菌體療法挽回了Patterson教授的生命,時年70歲高齡的他擁抱著妻子和兒女,對救命恩人感激涕零:「噬菌體療法對我來說是一個奇蹟,也意味著數百萬人在未來有了被治癒的希望。」

霍金老先生雖已仙逝,但他對世人的警示卻依舊迴蕩在我們的耳邊。當代的科學家將會竭盡全力地對抗超級細菌,人類在抗生素濫用的道路上終將懸崖勒馬。

參考資料:

[1] Chanishvili N. Phage therapy-history from Twort and d'Herelle through Soviet experience to current approaches[J]. Adv Virus Res, 2012, 83: 3-40.

[2] Cisek A A, Dabrowska I, Gregorczyk K P, et al. Phage therapy in bacterial infections treatment: one hundred years after the discovery of bacteriophages[J]. Curr Microbiol, 2017, 74(2): 277-283

[3] Hagens S, Habel A, Von A U, et al. Therapy of experimental Pseudomonas infections with a nonreplicating genetically modified phage[J]. Antimicrob Agents Chemother, 2004, 48(10): 3817-3822.

[4] Krause R M. Studies on bacteriophages of hemolytic streptococci. I. factors influencing the interaction of phage and susceptible host cell[J]. J Exp Med, 1957, 106(3): 365-384.

[5] Krause R M. Studies on bacteriophages of hemolytic streptococci. I. factors influencing the interaction of phage and susceptible host cell[J]. J Exp Med, 1957, 106(3): 365-384.

[6] Kusradze I, Karumidze N, Rigvava S, et al. Characterization and testing the efciency of Acinetobacter baumannii phage vB-GEC_Ab-M-G7 as an antibacterial agent[J]. Front in Microbiol, 2016, 7(12): 1590-1590.

[7] Matsuda T, Freeman T A, Hilbert D W, et al. Lysisdeficient bacteriophage therapy decreases endotoxin and inflammatory mediator release and improves survival in a murine peritonitis model[J]. Surgery, 2005, 137(6): 639-646.

[8] Rohwer F, Segall A M. In retrospect: A century of phage lessons[J]. Nature, 2015, 528(7580): 46-48.

[9] Savalia D, Westblade L F, Goel M, et al. Genomic and proteomic analysis of phiEco32,a novel Escherichia coli bacteriophage[J]. J Mol Biol, 2008, 377(3): 774-789.

相關焦點

  • 「撕碎」細菌細胞壁 裂解酶噬菌體輕鬆「吃掉」超級細菌
    近年來研究發現,由於新型抗生素的研製速度遠遠趕不上耐藥菌的進化速度,部分糞腸球菌耐藥性嚴重,逐漸演變成「超級細菌」。俗話說「一物降一物」,「超級細菌」的天敵又會是誰呢?來自福建師範大學生命科學學院、南方生物醫學研究中心歐陽松應教授認為,噬菌體或能做到。
  • 探究噬菌體的秘密,看看它們是如何殺死超級細菌的
    這項研究由莫納什生物醫學發現研究所的副教授法斯利·古裡巴利和特雷弗·利思戈教授領導,它概述了利用高解析度成像技術揭示稱為噬菌體的病毒如何攻擊和殺死傷寒病原體傷寒沙門氏菌,為科學家提供了一種新的理解,即如何將它們用於正在進行的抗微生物耐藥性(AMR)的鬥爭中。
  • 研究發現噬菌體病毒可使超級細菌恢復對抗生素的敏感性
    據外媒報導,除了病毒,「超級細菌」也已經引起了全球關注。這些狡猾的細菌正在快速進化對抗生素的抗藥性,這意味著一些最好的藥物可能很快就會無法發揮效用。現在,澳大利亞的研究人員找到了一種繞過這些所謂的「超級細菌」的抗藥性的方法--用捕食性病毒分散它們的注意力。
  • 超級耐藥菌感染如何破解?深圳首例應用噬菌體治療臨床試驗取得進展
    「深圳首例應用噬菌體治療耐藥菌感染在深圳市人民醫院臨床試驗獲得重要進展,該臨床研究表明應用噬菌體治療臨床超級耐藥菌的感染具有極大的應用價值。」治療團隊經過評估制定了詳細的治療方案,並採取抗生素和針對耐藥鮑曼不動桿菌的專一性噬菌體聯合霧化給藥的方式,經過連續兩個星期的治療,成功清除了患者肺部感染的耐藥鮑曼不動桿菌,患者病情穩定。該臨床研究表明應用噬菌體治療臨床超級耐藥菌的感染具有極大的應用價值,噬菌體研究也是未來深圳先進院合成生物所的重點研究領域。
  • 每年有70萬人死於超級細菌感染,芬蘭教授建議用噬菌體對付
    每年有70萬人死於超級細菌感染,芬蘭教授建議用噬菌體對付 因抗生素濫用等因素導致的「超級細菌」一直是困擾醫學界的難題。
  • 噬菌體與宿主細菌的相互作用--吸附篇
    那麼在這一階段,噬菌體與宿主細菌是如何相互作用的呢? 2.1 宿主對抗噬菌體吸附的策略 細菌阻斷噬菌體吸附的機制至少可分為三類:噬菌體受體的突變或掩蓋,產生胞外基質以阻斷受體被識別,及使用競爭性受體抑制劑等(圖1)。
  • 噬菌體藥物行業:超30億合作,它能否從耐藥性細菌中解救人類?
    談起耐藥性細菌,一般人也許覺得離我們還比較遙遠。但實際上,耐藥性細菌的全球性威脅已經是山雨欲來,尋找有效的新對抗手段迫在眉睫。 抗生素在細菌耐藥性面前陷入僵局 細菌耐藥性對人類健康造成巨大挑戰 青黴素在二戰期間的發現和臨床應用,標誌著人類對抗細菌感染步入了抗生素時代。青黴素和隨後出現的頭孢類、四環素類、大環內酯類、碳青黴烯類等各種類型的抗生素在幫助人類對抗細菌感染性疾病方面立下了赫赫戰功。
  • 薑還是老的辣呀,龍隊大展神威,再創總決賽單打奪冠紀錄
    看完了今下午這兩場單打決賽,我不得不說一句,姜真的還是老的辣呀。雖然國乒已提前包攬國際乒聯總決賽男女單打冠軍,但今下午這兩場決賽仍是非常值得一看,畢竟這恰好是兩場新老選手的較量,女單陳夢VS王曼昱,男單馬龍VS樊振東。
  • 噬菌體:中國的那些事兒
    這文章名字有點長:《丈夫金字塔感染超級細菌,試遍所有抗生素無效。絕望中,她重拾起了人類對抗細菌的古老武器...》。 這雖然是來自「英國那些事兒」,說的其實是美國的事兒。其實要說的事標題基本都說清楚了,除了這古老武器的名字:噬菌體。 這文章不是標題黨,其實寫得不錯,值得一看。說的事也是真事,美國的媒體上有報導。
  • 噬菌體治療的前世、今生與未來
    近期, 網上一則報導使噬菌體治療這一人類對抗細菌的古老「武器」引起了全球關注。美國加州大學Tom Patterson教授被「超級細菌」鮑曼不動桿菌感染, 他的妻子Steffanie Strathdee, 加州大學聖地牙哥全球健康研究所所長兼傳染病流行病專家, 在學術和人脈資源都集聚的優勢條件下遍尋治療方法, 試遍所有有用的抗生素無效, 絕望中她想到了用細菌的「天敵」噬菌體來治療, 最終使用美國軍方研製的噬菌體挽救了Patterson教授的生命。該病例一時引起轟動。
  • 果然薑還是老的辣!郭富城自曝財政大權,方媛再次淪為群嘲對象
    #郭富城自曝將財產給經紀人打理#果然薑還是老的辣近日,郭富城在代言某銀行活動時遭到了媒體的採訪,對於這位天王,媒體的八卦之心是熊熊燃燒起來,採訪初期,郭富城表現出來的人設還是頗為正常的,看起來只是一個普通愛女的父親,為了自己的兩女兒做了精心的打算。
  • 噬菌體真的這麼厲害嗎?細菌會不會進化出殺死噬菌體的抗體?
    細胞壁對細菌的影響跟這差不多。不過,人家有其他武器,那便是莢膜。主要成分還是一些糖類和蛋白質,其實這玩兒的作用吧。。。跟腿毛差不多,就跟蚊子會被腿毛纏住,喪失行動能力直到被你拍死一樣,噬菌體再牛逼,也會迷失在莢膜的重重濃霧之中,更牛逼的是,有的細菌甚至可以將蛋白質酶釋放到莢膜裡,專門分解噬菌體的外殼,靠,這簡直就是帶了持續掉血效果的戰爭迷霧,反正挺牛B。
  • 傾城時光:薑還是老的辣,看看這四位商場老狐狸的生存之道
    傾城時光:薑還是老的辣,看看這四位商場老狐狸的生存之道在《你和我的傾城時光》中,厲致誠、寧維凱還有陳錚三個人的競爭其實在他們上一輩的時候就已經開始了。都說商場如戰場,這一句話說的一點都沒有錯。程峰在劇中飾演的是安卡達的總裁,表面上看,程峰是一個和藹可親的人,但是內心卻有很多的計謀,他的手段也是非常的不簡單。而他最大的弱點就是他的女兒程美子,成飛也非常的寵溺自己的這一個女兒。第二位就是陳志軍。陳志軍的扮演者是吳毅將。
  • 在地球生存38億年的納米機器人「噬菌體」,可能用於醫療方面!
    這是一個有關於人類命運的納米機器人「噬菌體」噬菌體誕生於地球上的第一個細菌,之前目前地球上發現最古老的細菌化石來自於三十八億年前,噬菌體是以專門獵殺細菌為生的獵手,它介於生物和非生物之間,所以被稱為納米機器人。
  • 中國團隊發現凝血因子或有助對抗「超級細菌」
    新華社倫敦8月9日電(記者張家偉)一個中國團隊9日發布報告說,他們發現凝血因子這種人體受傷後參與血液凝固的血液成分,有潛力在對抗多重耐藥的「超級細菌」方面發揮作用。四川大學學者領銜的團隊在中國科學院與英國自然出版集團合作出版的期刊《細胞研究》上發布報告說,他們發現凝血因子VII、IX和X除了在凝血過程中有重要作用,可能還可以對抗革蘭氏陰性菌,其中包括綠膿桿菌和鮑曼不動桿菌等耐藥性極強的「超級細菌」。
  • 重金屬鎵可用於對抗「超級細菌」
    新華社華盛頓9月26日電(記者周舟)美國研究人員26日說,他們發現重金屬鎵有望用於開發新的抗生素,對抗綠膿桿菌這種「超級細菌」。  綠膿桿菌可導致肺部、尿路以及傷口等感染。癌症和愛滋病等患者由於自身抗感染能力受損,容易感染這種細菌。尋找新型抗生素對抗這種「超級細菌」一直是研究人員的目標。
  • 在地球生存38億年的納米機器人「噬菌體」,可能用於醫療方面
    ,之前目前地球上發現最古老的細菌化石來自於三十八億年前,噬菌體是以專門獵殺細菌為生的獵手,它介於生物和非生物之間,所以被稱為納米機器人。英國醫生弗萊明發現青黴素可以殺死細菌後,人們就開始大量的使用抗生素。但是快一百年過去了,細菌也在進化,進化出了對各種抗生素的免疫力。我們不斷地加大抗生素的威力,細菌就會進化出更強的免疫力。這是一個惡性的循環,這個循環的終點就是超級細菌的誕生。
  • 這種新型合成抗生素 可對抗「超級細菌」
    臨床抗生素的濫用導致並加速了超級細菌的蔓延,使針對超級細菌的新型抗生素的研發顯得迫在眉睫。近日,林肯大學的科學家們開發出一種合成的teixobactin藥物並成功治療了小鼠的細菌感染,推動了將teixobactin藥物作為臨床抗超級細菌藥物的進程。
  • 西瓜視頻帶你認識地球上吃細菌的病毒,外形如同外星機器
    看到這個噬菌體的名字我們就知道這傢伙不一般,一起來看看西瓜視頻創作人是如何分享關於噬菌體的知識的。噬菌體這個小小的病毒機器人有時候可以拯救人類,我們可以把它注射到身體裡面去殺死那些超級細菌,噬菌體是一種非常強大的病毒
  • ...環境中發現351種新的巨大噬菌體,它們模糊了病毒和細菌之間的界線
    這些病毒被稱為噬菌體,這是因為它們吞噬細菌---細菌的大小和複雜性被認為是生命的典型特徵。它們攜帶著通常在細菌中發現的許多基因,並使用這些基因抵抗它們的細菌宿主。在它們當中,存在迄今為止發現的一種最大的噬菌體:它的基因組長735000個鹼基(即735kb),比噬菌體的平均基因組大近15倍。這個已知最大的噬菌體基因組比許多細菌的基因組大得多。Banfield說,「我們正在探索地球的微生物組,有時會出現意想不到的事情。一方面,這些巨大噬菌體彌合了無生命的噬菌體與細菌和古生菌之間的鴻溝。