葉表皮細胞的自動識別與計數

2020-12-06 騰訊網

本文提出了一種簡單、無需預處理、可自動進行細胞識別和標記的葉表皮細胞計數法，植物表型資訊如下。

葉表皮細胞計數對研究環境或遺傳因素引起的植物發育變化具有重要意義。目前，可以利用掃描電子顯微鏡進行表皮細胞計數，但成本昂貴且耗時較長。也可以利用光學顯微鏡進行表皮細胞計數，但需要進行葉片預處理和人工細胞識別。

分析葉片示意圖

本文提出了一種簡單、無需預處理、可自動進行細胞識別和標記的葉表皮細胞計數法。操作步驟如下：1）將葉片壓在兩個載玻片之間，無需任何預處理，在入射光下獲取數碼顯微照片；2）通過ImageJ的「宏」自動識別和計數表皮細胞。結果發現，應用圖像處理程序獲得的細胞計數與通過手動細胞識別獲得的細胞計數非常接近。綜上所述，該方法是一種可以極大地提高葉表皮篩選的高通量植物表型分析方法。

ImageJ的窗口帶有（a）名為Automatic_cell_marking的宏，以及（b）運行宏後獲得的結果單元格計數

自動計數檢查

來源：

MeleL G, Gargiulo L. Automatic cell identification and counting of leaf epidermis for plant phenotyping. MethodsX. https://doi.org/10.1016/j.mex.2020.100860.

彭博社新聞中的植物表型平臺PhenoMate

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