實驗室的廢液種類多、成分複雜，具有經常性、間歇性、分散性等特點，難於統一處理，這就需要加強實驗室安全管理，建立實驗室廢液汙染防治體系。
實驗室廢液主要包括：
1.實驗操作過程中產生的各種強酸、強鹼、有機溶液等;
2.清洗各種實驗用具和設備 (各種玻璃容器、進樣瓶、制樣設備等)時產生的廢液;
3.設備冷卻裝置(如各種蒸餾冷卻裝置、儀器設備冷卻裝置等)產生的廢液。
這些廢液應按其性質、成分等採取不同的處理方式。有的廢液可以回收利用其中有用的物質，有的可以直接排至外部排水管網，有的則採用適當方法處理，然後再排外部管網。
例如：一般設備冷卻水經使用後僅水溫有所升高，這類廢液不經處理就可排人水體或外部排水管網：有的經簡單的處理還可重複使用，用於實驗用具的清洗等過程;有的廢液含有毒有害物質、放射性物質，則需經適當處理或間收利用其有用的物質後，使之符合國家規定的排放標準，才可排人水體或外部排放管網。
實驗室廢液處理
收集的實驗室廢液應有適當的貯存場所，避免高溫、日曬、雨淋以及應有防漏和防滲設施，最好放置在有抽氣設備的貯存櫃中或存放於有換氣設備的房間中。貯存容器應明顯標示其種類與性質，不同類型的廢液應分別貯存，不同類型廢液容器不可混貯。
對高濃度廢酸、廢鹼液要經中和至中性時排放。對於含少量被測物和其他試劑的高濃度有機溶劑應回收再用。用於回收的高濃度廢液應集中儲存，以便回收;低濃度的經處理後排放，應根據廢液性質確定儲存容器和儲存條件，不同廢液一般不允許混合，避光、遠離熱源、以免發生不良化學反應。廢液儲存容器必須貼上標籤、寫明種類、儲存時間等。
含不同化學物質的廢液處理方法
含汞、鉻、鉛、鎘、砷、酚、氰的廢液必須經過處理達標後才能排放，實驗室處理方法如下：
含汞、鉛、鎘廢棄物的處理
若不小心將金屬汞散落在實驗室裡(如打碎溫度計)必須及時清除。如用滴管或用在硝酸汞的酸性溶液中浸過得薄銅片、銅絲收集與燒杯中用水覆蓋。散落在地面上的汞顆粒應撒上硫磺粉，生成毒性較小的硫化汞;或噴上用鹽酸酸化過的高錳酸鉀溶液(5：1000體積比)，過1至2小時後清除;或噴上20%三氯化鐵水溶液，幹後再清除(但該方法不能用於金屬表面，會產生腐蝕)。
對於含汞廢液的處理，可先將廢液調至PH8~10家入過量硫化鈉，使其生成硫化汞沉澱，再加入硫酸亞鐵作為共沉澱劑，生成硫化鐵沉澱可將硫化汞微粒吸附沉澱，然後靜止分離，清液可排放，殘渣可用焙燒法回收汞或製成汞鹽。
用鹼將廢液PH調至8~10，生成Pb(OH)2和Cd(OH)2沉澱，再加入硫酸亞鐵作為共沉澱劑，沉澱物可與其他無機物混合進行燒結處理，清液排放。
含鉻、砷、酚、氰廢棄物的處理
含鉻廢液中加入還原劑，如硫酸亞鐵、亞硫酸鈉、鐵屑，在酸性條件下將六價鉻還原成三價鉻，然後加入鹼，如氫氧化鈉、氫氧化鈣碳酸鈉等，使三價格形成Cr(OH)3沉澱，清液可排放。沉澱乾燥後可用焙燒法處理，使其與煤渣一起焙燒，處理後可填埋。
加入氧化鈣，使PH為8，生成砷酸鈣和亞砷酸鈣沉澱，在Fe3+存在時共沉澱。或使溶液PH大於10，加入硫化鈉，與砷反應生成難容、低毒的硫化砷沉澱。產生含砷氣體的試驗在通風櫥中進行。
低濃度含酚廢液可加入次氯酸鈉或漂白粉，使酚氧化城市和二氧化碳。高濃度可使用丁酸乙脂萃取，在用少量氫氧化鈉溶液反覆萃取。調解PH後，進行重蒸餾，提純後使用。
低濃度廢液可加入氫氧化鈉調節PH為10以上，再加入高錳酸鉀粉末(3%)，使氰化物分解。若是高濃度的，可使用鹼性氯化法處理，先用鹼調至PH為10以上，加入次氯酸鈉或漂白粉。經充分叫板，氫化物分解為二氧化碳和氮氣，放置24小時排放。含氰化物費也不得亂倒或與酸混合，生成揮發性氰化氫氣體有劇毒。
廢液的回收使用：
加強試劑回收利用不僅可以減少實驗室廢液產生的總量，同時又節省了實驗室的費用支出。例如實驗室中部分有機溶劑不直接參與化學反應，使用後雜誌含量少，可通過蒸餾、萃取、吸附等方法回收提純，監測後可再次使用。
混合廢液
互不作用的廢液可用鐵粉處理。調節廢液PH3-4，加入鐵粉，攪拌半小時，用鹼調節PH 9左右，攪拌10分鐘，加入高分子混凝劑沉澱，清液可排放，沉澱物作為廢渣處理。
三氯甲烷的回收
將三氯甲烷廢液一次用水、濃硫酸(三氯甲烷量的十分之一)、純水、鹽酸羥胺溶液(0.5% AR)洗滌。用重蒸餾水洗滌兩次，將洗好的三氯甲烷用汙水氯化鈣脫水，放置幾天，過濾，蒸餾。蒸餾速度為每秒1~2滴，收集沸程為60~62攝氏度的餾出液(標框下)，保存於棕色試劑瓶中(不可用橡膠塞)。
實驗室廢液處理方式：
1.焚燒法
①將可燃性物質的廢液，置於燃燒爐中燃燒。如果數量很少，可把它裝入鐵製或瓷製容器，選擇室外安全的地方把它燃燒。點火時，取一長棒，在其一端紮上沾有油類的破布，或用木片等東西，站在上風方向進行點火燃燒。並且，必須監視至燒完為止。
②對難於燃燒的物質，可把它與可燃性物質混合燃燒，或者把它噴入配備有助燃器的焚燒爐中燃燒。對多氯聯苯之類難於燃燒的物質，往往會排出一部份還未焚燒的物質，要加以注意。對含水的高濃度有機類廢液，此法亦能進行焚燒。
③對由於燃燒而產生NO2 SO2 或HCl 之類有害氣體的廢液，必須用配備有洗滌器的焚燒爐燃燒。此時，必須用鹼液洗滌燃燒廢氣，除去其中的有害氣體。
④對固體物質亦可將其溶解於可燃性溶劑中然後使之燃燒。
2.溶劑萃取法
①對含水的低濃度廢液，用與水不相混合的正己烷之類揮發性溶劑進行萃取，分離出溶劑層後，把它進行焚燒。再用吹入空氣的方法，將水層中的溶劑吹出。
②對形成乳濁液之類的廢液，不能用此法處理，要用焚燒法處理。
3.吸附法
用活性炭硅藻土礬土層片狀織物聚丙烯聚酯片氨基甲酸乙酯泡沫塑料稻草屑及鋸末之類能良好吸附溶劑的物質使其充分吸附後與吸附劑一起焚燒。
4.氧化分解法
在含水的低濃度有機類廢液中，對其易氧化分解的廢液，用H2O2 KMnO4 NaOCl H2SO4+HNO3 HNO3+HClO4 H2SO4+HClO4 及廢鉻酸混合液等物質，將其氧化分解。然後，按上述無機類實驗廢液的處理方法加以處理。
5.水解法
對有機酸或無機酸的酯類，以及一部份有機磷化合物等容易發生水解的物質，可加入氫氧化鈉或氫氧化鈣， 在室溫或加熱下進行水解。水解後，若廢液無毒害時，把它中和、稀釋後，即可排放。如果含有有害物質時，用吸附等適當的方法加以處理。
6.生物化學處理法
用活性汙泥之類東西並吹入空氣進行處理。例如，對含有乙醇、乙酸、動植物性油脂、蛋白質及澱粉等的稀溶液，可用此法進行處理。
含一般有機溶劑的廢液：
一般有機溶劑是指醇類、酯類、有機酸酮及醚等由C、H、O 元素構成的物質。對此類物質的廢液中的可燃性物質，用焚燒法處理。對難於燃燒的物質及可燃性物質的低濃度廢液，則用溶劑萃取法、吸附法及氧化分解法處理。再者，廢液中含有重金屬時，要保管好焚燒殘渣。但是，對其易被生物分解的物質(即通過微生物的作用而容易分解的物質)，其稀溶液經用水稀釋後，即可排放。
含石油動植物性油脂的廢液此類廢液包括：苯、已烷、二甲苯、甲苯、煤油、輕油、重油、潤滑油、切削油、機器油、動植物性油脂及液體和固體脂肪酸等物質的廢液。對其可燃性物質，用焚燒法處理。對其難於燃燒的物質及低濃度的廢液，則用溶劑萃取法或吸附法處理。對含機油之類的廢液，含有重金屬時，要保管好焚燒殘渣。
生物實驗室廢液處理：
生物實驗室產生的廢液汙染主要是化學性汙染和生物性汙染，另外還有放射性汙染。
化學性汙染包括有機物汙染和無機物汙染。有機物汙染主要是有機試劑汙染和有機樣品汙染。在大多數情況下，實驗室中的有機試劑並不直接參與發生反應，僅僅起溶劑作用，因此消耗的有機試劑以各種形式排放到周邊的環境中，排放總量大致就相當於試劑的消耗量。日復一日，年復一年，排放量十分可觀。有機樣品汙染包括一些劇毒的有機樣品，如農藥、苯並(α)芘、黃麴黴毒素、亞硝胺等。無機物汙染有強酸、強鹼的汙染，重金屬汙染，氰化物汙染等。其中汞、砷、鉛、鎘、鉻等重金屬的毒性不僅強，且有在人體中有蓄積性。
生物性汙染包括生物廢棄物汙染和生物細菌毒素汙染。生物廢棄物有檢驗實驗室的標本，如血液、尿、糞便、痰液和嘔吐物等;檢驗用品，如實驗器材、細菌培養基和細菌陽性標本等。生物實驗室的通風設備設計不完善或實驗過程個人安全保護漏洞，會使生物細菌毒素擴散傳播，帶來汙染，甚至帶來嚴重不良後果。2003年非典流行肆虐後，許多生物實驗室加強對SAS病毒的研究，之後報導的非典感染者，多是科研工作者在實驗室研究時被感染的。
在對這些汙染處理的時候，需要注意以下幾個方面：
廢液的濃度超過規定的濃度時，必須進行處理。但處理設施比較齊全時，往往把廢液的處理濃度限制放寬。
最好先將廢液分別處理，如果是貯存後一併處理時，雖然其處理方法將有所不同，但原則上要將可以統一處理的各種化合物收集後進行處理。
處理含有絡離子、螯合物之類的廢液時，如果有幹擾成份存在，要把含有這些成份的廢液另外收集。
下列廢液不能互相混合：
①過氧化物與有機物;
②氰化物、硫化物、次氯酸鹽與酸;
③鹽酸、氫氟酸等揮發性酸與不揮發性酸;
④濃硫酸、磺酸、羥基酸、聚磷酸等酸類與其它的酸;
⑤銨鹽、揮發性胺與鹼。
要選擇沒有破損及不會被廢液腐蝕的容器進行收集。將所收集的廢液的成份及含量，貼上明顯的標籤，並置於安全的地點保存。特別是毒性大的廢液，尤要十分注意。
對硫醇、胺等會發出臭味的廢液和會發生氰、磷化氫等有毒氣體的廢液，以及易燃性大的二硫化碳、乙醚之類廢液，要把它加以適當的處理，防止洩漏，並應儘快進行處理。含有過氧化物、硝化甘油之類爆炸性物質的廢液，要謹慎地操作，並應儘快處理。 含有放射性物質的廢棄物，用另外的方法收集，並必須嚴格按照有關的規定，嚴防洩漏，謹慎地進行處理。
生物類廢物：
生物類廢物應根據其病源特性、物理特性選擇合適的容器和地點，專人分類收集進行消毒、燒毀處理，日產日清。
液體廢物一般可加漂白粉進行氯化消毒處理。固體可燃性廢物分類收集、處理、一律及時焚燒。固體非可燃性廢物分類收集，可加漂白粉進行氯化消毒處理。滿足消毒條件後作最終處置。
1.一次性使用的製品如手套、帽子、工作物、口罩等使用後放入汙物袋內集中燒毀。
2.可重複利用的玻璃器材如玻片、吸管、玻瓶等可以用1000-3000mg/L有效氯溶液浸泡2-6h.然後清洗重新使用，或者廢棄。
3.盛標本的玻璃、塑料、搪瓷容器可煮沸15min.或者用1000mg/L有效氯漂白粉澄清液浸泡2-6h，消毒後用洗滌劑及流水刷洗、瀝乾;用於微生物培養的，用壓力蒸汽滅菌後使用。
4.微生物檢驗接種培養過的瓊脂平板應壓力滅菌30min，趁熱將瓊脂倒棄處理。
5.尿、唾液、血液等生物樣品，加漂白粉攪拌後作用2-4h，倒入化糞池或廁所。或者進行焚燒處理。
放射性廢棄物：
一般實驗室的放射性廢棄物為中低水平放射性廢棄物，將實驗過程中產生的放射性廢物收集在專門的汙物桶內，桶的外部標明醒目的標誌，根據放射性同位素的半衰期長短，分別採用貯存一定時間使其衰變和化學沉澱濃縮或焚燒後掩埋處理。
1.放射性同位素的半衰期短(如：碘131、磷32等)的廢棄物，用專門的容器密閉後，放置於專門的貯存室，放置十個半衰期後排放或者焚燒處理。
2.放射性同位素的半衰期較長(如：鐵59、鑽60等)的廢棄物，液體可用蒸發、離子交換、混凝劑共沉澱等方法濃縮，裝入容器集中埋於放射性廢物坑內。