圖文撰寫 |超級super棟
本文轉載自「Paper繪圖」公眾號
生存率乃指某生物種群內的每一個體經過一定時限以後生存的機率。如以橫軸為經過的時間(日、月或年)，縱軸為生存率，則可繪出生存曲線。根據生存曲線的類型可以判斷生物種群死亡的規律[1]。
目前臨床或者生命科學領域最常用生存率曲線（也稱Kaplan-Meier曲線）來描述各組患者的生存狀況或者各組實驗動物的存活情況。
所以呢，我們今天介紹一種比較簡單地生存曲線的繪圖方法。
動物實驗的話，因為受到人為控制，所以死亡和未死亡的都可以統計到，不存在刪失的情況。所以，轉換為生存曲線作圖數據一般是從1到1，或者從1到0。沒有從1到0，再到1，再到0的情況。
這裡的話，我們設置兩個組，分別為模型組和給藥組，每組動物共10隻。表格裡面記錄的是當天存活/剩餘的鼠的數量，一共測了15天。
接下來，我們將上述數據處理為作圖使用的數據。
模型組，從第一天開始給藥物就出現死亡，死亡1隻，所以天數記為1，作圖數據記為1，中間未出現死亡的天數不計。而到了第11天，死亡三隻，所以天數記連續3個11，作圖數據記為1，也就是在哪一天，死了幾隻，就羅列幾個天數，計數為1。
給藥組因為還有存活鼠，比如，到第15天，還有三隻存活，所以15天連續記為三個0。
最後，我們整理一下數據，將天數放在同一列，將組別數據分開放。
3. 點擊Results中的Survival of Data 1，就可以出現兩組比較的結果了。查看第一個統計結果就行，這裡表明，兩組比較，有顯著性差異。4. 點擊Graph中的Data1，進行作圖，按照默認參數進行即可。8. 最後，你可以給圖形拉一個框(個人喜好)，然後你就可以將圖形導出了9. 當然，上述舉例的是兩組的比較，如果是多組的話怎麼辦，你就得兩組進行兩兩比較了，選擇analyze，選擇分析中的生存曲線，將想要分析的兩組進行選擇。10. 看一下，這裡有默認設置，死亡為「1」，存活或刪除為「0」。11. 然後在Results中，你就可以看到兩組對比的差異性了。如果假設第10天是實驗的終點，那麼數據的處理如下，到第10天，存活的全部記為0。總數加起來依然是10，這也是核對自己是否統計遺漏的辦法。
2. 我們會發現，他的數據是從1到0，再從0到1，這是因為在第46天，有病人聯繫不上，或者其他原因不參與實驗，但是又在好好生活，所以為存活，作為刪失數據，記為0。3. 作圖如上述所示，最終我們會發現，做的圖中會出現短線，這就是因為有刪失數據。[1] 辛毅，於夫主編．科技採編手冊．鄭州：河南科學技術出版社，1986.10：33本文僅限轉載，不代表本公眾號觀點
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GraphPad Prism繪製的小提琴圖