《細胞》:果蠅細胞中發現五種主要染色質類型

2021-01-19 科學網

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相關焦點

  • 果蠅細胞中發現五種主要染色質類型
    果蠅細胞中發現五種主要染色質類型
  • 研究揭示核纖層蛋白對人源細胞中染色質高級結構及染色質運動狀態...
    染色質的三維結構具有有序性和動態變化性，構成細胞核中各種生物學過程的全新調控層次。通過成像和高通量測序技術，研究者發現染色質高級結構分為染色質環（Loop）、拓撲關聯域（Topologically associating domain，TAD）、A/B區室（A/B compartment）和染色體領地（Chromosome territory，CT）等多個層級。
  • Nature:測量單個細胞的染色質可接近性,從而揭示胚胎發育路徑
    2018年3月25日/生物谷BIOON/---在一項新的研究中，美國華盛頓大學和位於德國海德堡市的歐洲分子生物學實驗室的研究人員證實細胞類型和發育階段能夠從數千個單細胞的染色質可接近性（chromatin accessibility, 也譯作染色質開放性）測量中推導出來。
  • Nature:揭示真核生物細胞核中染色質分離新機制
    2019年6月17日訊/生物谷BIOON/---在細胞核中基因組的活性部分與它的非活性部分在空間上分隔開來對於基因表達控制至關重要。在一項新的研究中，來自德國慕尼黑大學、美國麻省理工學院和麻薩諸塞大學醫學院的研究人員揭示了這種分離的主要機制，並顛覆了我們對細胞核的認識。
  • Nature: 繪製出單個人類細胞類型中08個染色質相關蛋白的佔據圖譜
    （來源nature）之前幾個階段的大部分研究使用的都是模型細胞系，而第三階段包含了超過1369個生物樣本來源的503種細胞或組織類型。Gingeras et al, Perspectives on ENCODE, DOI: 10.1038/s41586-020-2449-8，Nature：《自然》，最新IF：43.072、Nature: 繪製出單個人類細胞類型中208個染色質相關蛋白的佔據圖譜2020
  • .& Cell :孫育傑/李程合作揭示核纖層蛋白對人源細胞中染色質...
    近期，已有多個課題組分別報導了在擬南芥【1】、線蟲早期胚胎【2】、果蠅細胞【3】和小鼠胚胎幹細胞【4】中核纖層蛋白對染色質高級結構的影響，其研究結果既有一致性部分也有差異性部分，但尚無人源細胞中的報導。
  • 揭示核纖層蛋白對人源細胞中染色質高級結構及其運動狀態的調控
    近期，已有多個課題組分別報導了在擬南芥1、線蟲早期胚胎2、果蠅細胞3和小鼠胚胎幹細胞4中核纖層蛋白對染色質高級結構的影響，這些研究結果既有共同特徵也有差異性，但尚無在人源細胞中的報導。為進一步在活細胞中研究lamin B1蛋白對染色質的調控，作者利用CRISPR-SunTag活細胞單基因位點標記技術6，發現敲除lamin B1蛋白後，不僅使傾向於分布在核膜附近的染色質位點分布在核質中的比例增加，還會使染色質位點的受限擴散運動加快。
  • B細胞環狀染色質結構:產生龐大的抗體庫對抗感染
    B細胞是我們適應性免疫系統的主要支柱。它們在骨髓中發育，隨後在血液中循環。B細胞負責產生針對侵入性病原體（所謂的抗原）的抗體。每個B細胞對一種抗原具有高度特異性。抗體是較大的稱為免疫球蛋白的蛋白分子，分泌到血液中。它們也以膜結合的形式產生，存在於B細胞表面上，因此被稱為B細胞受體（BCR）。
  • 體細胞核移植中染色質三維結構的重編程以及黏連蛋白的新功能
    由於細胞數量和實驗手段的限制，此過程的染色體三維結構的高解析度的動態變化之前一直研究甚少。另外，頡偉實驗室與其他實驗室研究發現，早期胚胎中染色體高級結構如拓撲結構域（Topologically associating domain, TAD）等發生異常鬆散，並且該現象在進化中高度保守（果蠅、魚、小鼠和人類），然而其功能和機制一直是未解之謎。
  • 兩篇Science論文構建出胎兒基因表達和染色質可及性的人類細胞圖譜...
    2020年11月16日訊/生物谷BIOON/---在兩項新的研究中，來自美國華盛頓大學醫學院和布羅特曼-巴蒂精準醫學研究所等研究機構的研究人員構建出兩個細胞圖譜，用於追蹤人類細胞類型和組織發育過程中的基因表達和和染色質可及性（chromatin accessibility，也譯為染色質可訪問性）。
  • 研究揭示細胞轉錄組與染色質可及性圖譜
    研究揭示細胞轉錄組與染色質可及性圖譜 作者：小柯機器人 發布時間：2019/10/15 12:31:02 美國加州大學聖地牙哥分校Kun Zhang小組利用高通量測序方法，揭示了同一細胞中轉錄組和染色質可及性圖譜
  • 科學家繪製出胎兒染色質可及性的人類細胞圖譜
    科學家繪製出胎兒染色質可及性的人類細胞圖譜 作者：小柯機器人 發布時間：2020/11/16 13:54:15 美國華盛頓大學Jay Shendure等研究人員合作繪製出胎兒染色質可及性的人類細胞圖譜。
  • 染色質基因分析可識別癌症起源 確定白血病類型
    白血病細胞 　　科技日報華盛頓7月11日電 （記者劉海英）美國傑克遜實驗室(JAX)的研究人員開發出一種新方法，通過對開放染色質進行全基因組分析，來確定導致既定類型白血病的細胞類型。知道了癌細胞的起源細胞，研究人員就可以分析出癌症的亞型，進而開發出新的診療手段，但現有方法很難從大量腫瘤細胞樣本中識別出其起源細胞。 　　染色質是細胞核內的重要成分，由DNA、組蛋白、RNA組成，在細胞進行分裂的特定階段會聚縮成染色體。每種類型的細胞都有一個獨特的染色質結構，封閉染色質會緊緊纏繞在核小體周圍，相對不活躍；開放染色質與核小體的聯繫程度則相對鬆散，也更活躍。
  • 「珍藏版」綜述|染色質複製與細胞的表觀遺傳記憶
    並且通過實驗破壞特定的染色質恢復事件，我們就可以檢測染色質狀態的長期存在與其在表觀遺傳細胞記憶中的所發揮的作用。DNA複製複合體是一個大的蛋白質-核酸複合體，除了DNA複製相關的因子之外還包括染色質複製相關的必需蛋白【9】。關於染色質複製過程中的細胞表觀遺傳記憶部分，主要包括新、舊組蛋白的核小體組裝途徑以及組蛋白的回收利用對於組蛋白翻譯後修飾的作用。
  • 細胞化學染色
    細胞化學是細胞和化學相結合的一門科學。
  • 染色質基因分析可識別癌症起源,確定白血病類型
    相關研究11日發表在《自然—通訊》雜誌上。每種癌症都始於一個單細胞的異變。知道了癌細胞的起源細胞，研究人員就可以分析出癌症的亞型，進而開發出新的診療手段，但現有方法很難從大量腫瘤細胞樣本中識別出其起源細胞。染色質是細胞核內的重要成分，由DNA、組蛋白、RNA組成，在細胞進行分裂的特定階段會聚縮成染色體。
  • 細胞蛇:細胞器家族的新成員
    核被膜上分布有緻密的、對核質運輸起關鍵作用的核孔複合體，較大的分子無法直接穿透核被膜，而小分子與離子可自由通透，大的蛋白質分子則需要載體蛋白的幫助進出核被膜。經由核孔複合體的核質運輸是胞內最重要的功能之一，細胞質和細胞核中許多活動均依賴於高效的核質運輸。19世紀後葉線粒體被發現。
  • Cell:揭示染色質調節蛋白特異性組合調控染色質活性
    科學家們已經在很多細胞類型中證實組蛋白修飾與基因、蛋白和酶調節之間存在廣泛關聯。Goren補充道，「但是我們對增加、移除和維持這些組蛋白修飾的我們稱作染色質調節物的蛋白因子和複合物的認識仍然不深。這篇研究展示了一種系統性方法來理解它們在染色質調節上的功能。」
  • Nature Plants|首次在單細胞水平揭示植物配子、合子和葉肉細胞的染色質空間結構!
    近年來發表的植物染色質三維空間結構主要是通過運用原位Hi-C技術在混合的植物組織或器官樣品中獲得，實際上是成千上萬個不同細胞的平均值結構。在本研究中，作者開發了一種植物單細胞Hi-C技術（scHi-C）。利用該技術作者分別解析了水稻精細胞、卵細胞、合子細胞和葉肉細胞等單細胞的染色質三維空間結構。發現每個細胞中染色質的空間摺疊不同，說明染色質的空間結構實際上是一個動態的結構。
  • CCS Chemistry | CRISPR螢光探針用於細胞染色質高分辨成像
    染色質結構的時空有序性對於細胞基因組功能調控至關重要。常規的染色質成像方法，如螢光原位雜交技術（fluorescence in situ hybridization, 即FISH），需要對染色質DNA進行固定與變性處理，不能實現對活細胞的實時成像。因此，發展高時空分辨的染色質可視化工具引起了研究者的關注。