樟科植物系統發育基因組學研究獲進展

2020-11-25 生物谷





樟科山胡椒屬樹種經濟用途廣泛。山胡椒屬多數種類的種子富含脂肪，可供制皂及工業油用，如油料植物山胡椒（Lindera glauca）；不少種類富含芳香油，可制香料及藥用，如中草藥三椏烏藥（Lindera obtusiloba）；一些種類的木材有香氣，可供家具及文體用品等用，如緬甸著名木材黃金樟的樹種山香果（Lindera metcalfiana）。然而，目前對於山胡椒屬的物種界定是否合適尚存爭議，尤其是山胡椒屬、木姜子屬和月桂屬等的系統關係還不明確。中國科學院西雙版納熱帶植物園博士研究生趙美麗及其合作者在副研究員宋鈺和研究員徐增富的指導下，利用32種樟科植物的葉綠體基因組探討了山胡椒屬植物與其它10屬植物的系統關係。


新測序的山胡椒屬植物葉綠體基因組大小為152211 bp至152968 bp，與潺槁木姜子（Litsea glutinosa152618 bp）及月桂（Laurus nobilis 152750 bp）的葉綠體基因組大小相近。利用葉綠體基因組全序列構建的系統進化樹表明：山胡椒屬的黑殼楠（Lindera megaphylla）和潺槁木姜子及月桂形成一組，與香葉樹（Lindera communis）、山胡椒和絨毛山胡椒（Lindera nacusua ）形成第一分支；其餘五種山胡椒屬的北美山胡椒（Lindera benzoin ）、團香果（Lindera latifolia）、山香果、三椏烏藥和海南山胡椒（Lindera robusta）形成第二分支；兩個分支構成的屬群與由樟屬、檫木屬和甘蜜樹屬組成的屬群相鄰近；增加已公布條形碼數據的山胡椒屬植物後，第二分支可進一步再分為三組。上述結果確認了山胡椒屬為復系類群，提示山胡椒屬所處的屬群需要分類修訂。


該成果以Comparative chloroplast genomics and phylogenetics of nine Lindera species (Lauraceae) 為題發表於國際期刊《科學報告》（Scientific Reports）。該研究得到了國家自然科學基金委（31600531）、中科院「西部之光」（Y7XB061B01）和中科院東南亞生物多樣性研究中心（Y4ZK111B01）等項目的資助。(

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