PLoS ONE:科學家開發出了一種能在液體活檢中研究腫瘤異質性的強大...

2020-12-08 生物谷

2018年4月10日 訊 /生物谷BIOON/ --近日，一項刊登在國際雜誌PLOS ONE上的研究報告中，來自德國海涅大學（Heinrich Heine University）醫院的研究人員通過研究開發出了一種研究癌症異質性的新方法；這種強大的精簡方法能夠通過單一的血液檢測來對循環腫瘤細胞（CTCs）的全基因組拷貝數進行分析，相比當前複雜昂貴的檢測手段而言，這種單管單步驟方法能夠檢測單一腫瘤細胞中的絕對拷貝數改變（CNA），相比常規的基因組分析步驟而言，這種新方法還能以較低的成本保持較高的準確度，這或為後期研究人員開發基因組驅動的靶向性療法以及在液體活檢中對患者的疾病進展進行檢測提供了新的思路和希望。

圖片來源：Terracciano M, et al. (2018)

腫瘤細胞的基因組通常會經歷多個異常事件，而這些均與腫瘤生物背後發生的機制密切相關，同時其也能反映在整個基因組的CNA剖面上，而最近研究人員對多種癌症類型進行的研究也都闡明了這一事實，即腫瘤細胞所發生的異常改變模式與癌細胞對不同類型藥物耐受性的增加直接相關，這些藥物包括經典化療、PARP抑制劑乃至免疫檢查點抑制劑等。

研究者Nicolo Manaresi表示，如今我們開發出了多種分析技術能夠對癌細胞中的拷貝數改變情況進行分析，然而其並不適用於對CTCs的臨床應用，這項最新研究中我們開發出了一種新型廉價的手段，來對單一癌細胞中全基因組中的CNA進行深入分析。文章中研究人員闡明了這種創新性工作站（Ampli1 LowPass kit）的特徵，該技術在降低檢測成本的同時，還能樣本進行高通量分析。

研究者Manaresi說道，相比此前在臨床診斷中篩選CNAs的方法aCGH而言，本文中所開發的新技術能夠降低分析的費用，同時還能提供更高的優越性和可比性；此外，該技術還能確定完全拷貝數變化，未來這種新型的分析技術獎能夠降低研究人員進行單一拷貝分析的成本，同時也為研究人員在液體活檢中開發更加簡便的血液檢測技術分析癌症異質性提供了新的思路和希望。（生物谷Bioon.com）

小編推薦會議：2019液體活檢論壇|2019（第七屆）先進體外診斷行業峰會


原始出處：

Ferrarini A, Forcato C, Buson G, et al. A streamlined workflow for single-cells genome-wide copy-number profiling by low-pass sequencing of LM-PCR whole-genome amplification products. PLoS One. 2018 Mar 1;13(3):e0193689. doi: 10.1371/journal.pone.0193689. eCollection 2018

相關焦點

  • 且看液體活檢如何在腫瘤異質性研究上顯伸手?
    液體活檢作為腫瘤非侵入性早期診斷方法， 具有廣闊的臨床應用前景，目前國內外均有產品獲批上市。 這種方法也為腫瘤異質性的監測提供可能。 在今年8月發表在Mol Cancer Ther.（IF 16.833）上的研究論文表明 ctDNA血檢可以動態監測腫瘤異質性， 並與胃腸間質瘤的腫瘤負荷相關。
  • Nat Med:液體和組織活檢檢測胃腸道腫瘤的獲得性耐藥和腫瘤異質性
    2019年9月28日訊 /生物谷BIOON /--在癌症治療過程中，腫瘤異質性可以驅動多個腫瘤亞克隆的進化，這些亞克隆在不同的患者中具有獨特的耐藥機制。以往的病例報告和小病例系列研究表明，液體活檢(特別是無細胞DNA，cfDNA)可以更好地揭示性耐藥的異質性。
  • 多篇文章解讀腫瘤異質性的發生及研究進展
    近年來，科學家們在腫瘤異質性研究領域取得了重要的成果，本文中，小編對相關研究進展進行整理，分享給大家！【1】PLoS ONE：科學家開發出了一種能在液體活檢中研究腫瘤異質性的強大新技術doi：10.1371
  • 多篇文章聚焦癌症異質性研究新成果!
    癌症異質性是惡性腫瘤的特徵之一，其是指腫瘤在生長過程中經過多次分裂增殖，其子細胞呈現出分子生物學或基因方面的改變，從而使腫瘤的生長速度、侵襲能力、對藥物的敏感性、預後等各方面產生差異。本文中，小編整理了多篇重要研究成果，共同解讀科學家們在癌症異質性研究上取得的新成果，分享給大家！
  • 液體活檢在淋巴瘤中的研究和應用進展
    二、液體活檢的實現基礎和應用現狀液體活檢是近年來實體腫瘤研究和臨床應用中的重要技術進展。早期研究發現，腫瘤患者中平均CTC或ctDNA 的水平高於健康對照，尤其在轉移性腫瘤患者中更高。隨著高量基因測序技術的進展和腫瘤基因組研究的深入，越來越多的腫瘤診斷和治療相關的基因變異被鑑定，並使得從外周血cfDNA中進行全基因組規模的測序分析或檢測腫瘤相關的基因突變成為可能很多研究結果表明，液體活檢在多種實體瘤的基因分型、療效評價、復發和耐藥監測中具有潛在的應用價值，如研究已明確外周血中CTC數量與轉移性乳腺癌、結直腸癌和前列腺癌患者的無進展生存和總生存相關。
  • 液體活檢急速升溫,檢測新秀不可忽視!
    液體活檢的優勢在於能解決精準醫療的痛點，通過非侵入性取樣降低活檢危害，而且有效延長患者生存期，具有高性價比。液體活檢技術主要包括CTC 和ctDNA，以及外泌體檢測。下面讓我們看一看關於液體活檢的行業動態及研究進展。
  • 洞察| 液體活檢在癌症檢測中應用
    目前，臨床研究中，液體活檢技術主要包括游離循環腫瘤細胞（CTCs）檢測、循環腫瘤DNA（ctDNA）檢測、外泌體及循環RNA（Circulating RNA）檢測等，與傳統的組織活檢相比，液體活檢具備實時動態檢測、克服腫瘤異質性、提供全面檢測信息等獨特優勢。
  • 腫瘤液體活檢技術:CTC和ctDNA孰優孰劣?
    液體活檢是什麼？腫瘤患者血液中存在少量循環腫瘤細胞以及由壞死癌細胞釋放的少量循環腫瘤 DNA。通過檢測血液中的循環腫瘤細胞（CTC，cycle tumor cell）和循環腫瘤DNA（ctDNA，cycle tumor DNA）對患者腫瘤進行診斷與監測的方法被稱為液體活檢。
  • 液體活檢技術在腫瘤早篩中的創新應用探索
    （二）液體活檢有望實現腫瘤早期檢測，市場容量巨大，但敏感性和特異性有待提高研究表明，在影像檢驗顯示出明顯的腫瘤發病跡象前，早期患者血液中可能已經出現CTC、ctDNA，也就是說通過CTC檢測和ctDNA檢測可能實現腫瘤早篩。
  • 2020 CCO | 聽院士講大數據和液體活檢，最新研究熱點全get√
    本次大會集結20餘位院士、2000餘位頂尖腫瘤學專家學者和來自全國各地的腫瘤學領域精英，秉承「腫瘤防治，贏在整合」的主題，共享學術盛宴，共沐智慧藍海，共譜抗癌華章。會議期間，醫脈通邀請南京醫科大學沈洪兵院士和山東省腫瘤醫院於金明院士分別就腫瘤大數據和液體活檢的研究進展進行深入探討。
  • 泛生子生物晶片閱讀儀獲批上市 助力腫瘤液體活檢
    該儀器目前已被國內多家醫院、科研機構採購，配套應用於腫瘤基因檢測試劑的開發和科學研究。泛生子正在註冊申報的人EGFR基因T790M突變檢測試劑盒，以及正在開發的同類檢測試劑盒，均可以配套使用該儀器，廣泛應用於醫療機構、臨檢中心和科研院所等，有效提高檢測範圍、質量和速度。腫瘤液體活檢新戰力眾所周知，液體活檢技術被認為是癌症診斷領域裡激動人心的突破，在2015年MIT將其評為年度十大突破技術之一。
  • 盤點| 淺談腫瘤異質性
    他們鑑別出了7269個突變，並且發現76%的突變以及21個已知癌症基因突變中的20個存在於同一腫瘤的所有區域。這就意味著在局部肺腺癌中，一些已知的促癌基因組突變似乎一致地存在於整個腫瘤之中，對腫瘤的某一區域進行單次活檢就有可能鑑別出其中的大多數突變。
  • Liquid Biopsy液體活檢點名:CTC 循環腫瘤細胞,ctDNA 循環腫瘤DNA...
    而科學家們的主要的工具就兩樣：篩子和吊鉤。隨著檢測技術的升級，CTC在癌症診療過程中的價值，也越發被人們所重視，發表文獻逐年增多(上圖左)，臨床研究的數量覆蓋的癌症種類也日趨擴大（上圖右）。ctDNA——蛛絲馬跡說道CTC，在液體活檢中還有一個ct開頭的，ctDNA（Circulating tumour DNA，循環腫瘤DNA）。
  • 真正讀懂液體活檢 你離精準醫療再近一步
    近日，復旦大學附屬中山醫院（下稱中山醫院）搭臺，邀請國內外大咖，就液體活檢最新發展現狀、不同生物標誌物在腫瘤診療中的應用、如何推動新技術在臨床中的實踐應用等話題，開展頭腦風暴。在「2018復旦中山液體活檢臨床應用高峰論壇」 上，國內外學者分別就液體活檢研究的四大方向發表了精彩學術報告，並展開討論。
  • 從三種檢測對象,看液態活檢助力反映腫瘤基因圖譜
    在精準醫學的大背景下，液體活檢作為一種便捷、微創、能夠動態反映腫瘤基因譜全貌的方法，在癌症臨床研究與實踐中發揮著越來越重要的作用。用於液體活檢相應的多種檢測技術也如雨後春筍一般蓬勃發展。目前液體活檢的檢測對象主要包括以下三種：循環腫瘤細胞（CTC）、循環腫瘤DNA（ct DNA）和外泌體。
  • 諾瀚康醫學實驗室 腫瘤早篩,液體活檢—ctDNA
    ctDNA作為液體活檢發展最為迅猛的標誌物之一，將在腫瘤的診斷、治療及預後檢測等方面發揮重要的作用
  • 腫瘤二代測序都能幹什麼?
    其次，腫瘤異質性的存在，許多腫瘤的驅動基因，是基於拷貝數的改變，或者合併基因突變和重排。拷貝數結合突變重排的變化，就不僅需要全外顯子甚至全基因組進行深度測序。但是一些明確意義的點突變和重排和拷貝數變化，目前有許多成熟技術可以輕鬆應對，用all in one的思路來看待新技術在臨床的應用，就如有了高鐵，就不需要特快列車和貨運列車，有了核武器這樣巨大的殺傷性武器，就無需常規武器一樣幼稚。
  • 獨立實驗室巨頭LabCorp將測試基於NGS的液體活檢,已在臨床研究中得到證明
    Resolution Biosciene 公司專注於開發可以推進癌症診斷和監測的非侵入式液體活檢平臺，該平臺包括靶向捕獲技術和第二代測序，並緊密結合基於雲端的生物信息學。其開發的 ctDx Lung 是一項快速、準確的液體活檢技術，該測試是在標準血液樣本上進行，可檢測與非小細胞肺癌（NSCLC）相關的基因突變，從而提供有價值的信息，幫助患者選擇最有效的靶向治療。
  • ctDNA在腫瘤診斷和治療中的應用
    液體活檢的概述關於液體活檢的概述，之前腫瘤學專家已經講了很多。大家推測血漿中游離DNA來源於腫瘤組織壞死、凋亡及分泌，ctDNA的長度是大約170個BP，它含有腫瘤特定的基因突變。一、液體活檢-克服腫瘤異質性問題 二、液體活檢-靶向治療耐藥監測 三、液體活檢-檢測腫瘤治療效果 四、液體活檢-腫瘤早期診斷 第一個應用方向：液體活檢可以克服腫瘤的異質性問題。
  • 系統性異質性:一種理解腫瘤異質性的綜合性方法
    特洛細胞在人體多種器官中廣泛存在，並在疾病狀態下表現出不同的生理功能，特洛細胞可分泌包含特殊遺傳物質、蛋白及信號分子的微囊泡，作用於周邊細胞，影響細胞功能。對特洛細胞的超微3D結構分析及功能研究發現特洛細胞存在結構和功能的異質性，並由此影響某一器官對刺激的應答及表型變化。