基因測序報告成了讀不懂的「天書」,怎麼辦?

2020-11-30 生物谷

如果你花錢請大仙算了一卦，但完事兒後，他不給你好好解卦，卻直接丟給你一本根本看不懂的「解卦大百科全書」，讓你自己去讀，想不想罵人？

現在的基因測序服務經常就是這樣。

基因測序，一個火得不行的詞，不管是癌症病人，孕產婦，還是普通老百姓，都或多或少會接觸到這個詞。國內各種基因測序公司如同雨後春筍一般，刺溜一下就冒出來了。

基因測序本身是個非常好的東西，正在迅速改變大家的生活，我舉雙手雙腳贊成靠譜測序的的應用推廣，尤其是在癌症（比如遺傳基因檢測），優生優育（比如測罕見遺傳病），和微生物學（比如感染診斷）。

癌症是目前基因測序的第一大市場。現在對很多癌症病人，尤其是乳腺癌、肺癌、直腸癌病人，基因檢測幾乎是必做的。

但無論什麼應用，基因測序有個最大的問題：普通老百姓看不懂結果，必須請專業人士諮詢指導。

但目前多數公司「管殺不管埋」，測序結果出來後直接丟一堆分析表格給顧客。很多客人看到結果後，開始惡補生物醫學知識，最後仍是一知半解。

有人向我感慨：「菠蘿，我真後悔當年高中生物課沒好好上。」

為了讓大家感覺好一點，我可以放心的說，即使你當年高中生物課好好上了，你還是看不懂。

要正確理解基因測序結果，必須要有長期的生物學，尤其是遺傳學的訓練。在諮詢了一些基因測序結果以後，我發現，這也許是解決廣大生物同學就業難題的好機會！

「21世紀是生物的世紀」，這句話把一群人忽悠進生物專業已經20年了，而這群人在寂寞中隱忍不言，就是在等大家看不懂基因測序結果的那一天。

基因測序結果長啥樣？

癌症病人基因測序結果到底有多複雜？ 下面是一份我諮詢過的肺癌基因測序報告的第1頁（一共35頁）：

能讀懂的請舉手！

有多少人拿到這個報告，放眼只看到了「肺癌」「基因」「藥物」這幾個詞？

全外顯子是啥？NCCN是啥？雜合多態性和純合多態性是啥？ADH1B基因是啥？R337C突變是啥？非移碼插入突變是啥？基因擴增1.8倍是啥？豐度是啥？

一句話，到底應該怎麼治？

別說普通大眾，很多醫生或生物專業的人都不能完全搞懂這些玩意兒。

有人也許能一眼看到「EGFR基因，DdelinsDG第20外顯子非移碼插入突變（豐度44%）」是最關鍵的，其它很多信息對確定治療方案並沒有什麼卵用。但這需要很多年的專業訓練。

對於大眾，這樣一份35頁的報告，如果沒人解讀，無異於天書。

有人可能會說，基因檢測結果的讀者其實應該是醫生，而不是病人或家屬，稍微複雜一點無所謂。但如果我花了1萬多塊錢，我還是希望能懂一些東西，不是麼？何況，很多醫生也搞不懂呢？

基因測序結果怎麼讀？

現在很多公司推廣基因測序來進行癌症風險評估，或者篩查。

最近某一位mm花了6千元買了「女性癌症風險評估套餐」。該套餐測了20來個和乳腺癌、卵巢癌相關的基因。結果還真測出了p53基因突變，具體是Pro72Arg：說明p53基因第72位的胺基酸由脯氨酸（Pro）變成了精氨酸（Arg）。

p53可是和癌症相關最重要基因之一。這下把mm嚇壞了。

這突變是啥意思？mm心想先看看結果解釋吧。不看不要緊，看完更暈，第3條說：「文獻1到3說明Pro72Arg與乳腺癌風險具有顯著相關性」，第4條說：「文獻4到7說明Pro72Arg與乳腺癌患病風險無關」。

這不是自相矛盾麼？有風險還是沒風險？

mm打電話去給客服，客服說：「抱歉，我也不懂。」

菠蘿拿到後，一時也不確定，去做了好一會兒功課。最後給mm解讀了三點（前方高能預警：此處開始有大量專業詞彙，只是為了嚴謹，讀者可以跳過，直達下一部分）：

1：Pro72Arg根本就不算是突變，而是自然發生的「基因單核苷酸多態性（SNP）」。這個多態性，簡單來說，就是指正常人群之中，有些人p53基因第72位是脯氨酸，有些人是精氨酸，但重要的是，無論哪種，都是正常蛋白，不是突變蛋白！這就像有些人是A血型，有些是B血型，雖然不同，但都是健康的。

2：報告裡面的第3條和第4條顯然是互相矛盾的，這說明研究論文裡對Pro72Arg到底是否增加癌症風險沒有定論。

基因相關研究中這類矛盾的結果非常多！那怎麼判斷哪邊觀點比較靠譜？

最安全的辦法當然是去讀那些論文。但如果讀不懂呢？那就看文章發表時間！

比如這裡，說Pro72Arg增加癌症風險的文章大多發表在2005年之前，而說它沒有增加風險的文章則是最近10年的[1]。

請注意，一般來說，如果新舊研究論文水平類似，而且結論明顯相反的話，菠蘿會選擇相信新文章！

原因有二，首先科學是不斷進步的，新的知識和技術往往讓研究更全面、完善、準確；另外新文章在發表之前，要經過專家審稿。如果新文章結論和以往的相反，作者必須提供大量證據來說服專業審稿人。新文章得以發表，說明專業人士認可新的研究結論，而舊的結論可能不準確。

3：即使相信Pro72Arg增加癌症風險，這位mm也是很安全的，因為她是雜合子，而不是純合子。生物學上，人是二倍體，每一種基因都有兩份，一份來自爸爸，一份來自媽媽。 雜合子的意思是說她只有一份基因是Pro72Arg，另一份還是普通正常版本。從研究文獻來看，這風險是非常低的，具體就不展開了。

綜合上面三點，我告訴這位mm：「別擔心。」

靠譜的基因測序諮詢師在哪裡？

既然測序結果的解讀如此重要，基因測序公司為什麼不多僱一些專業人士做諮詢師呢？

我能想到的有倆原因：第一，顧客群沒有強烈要求，沒必要去自我折騰，增加成本；第二，找不到合適的人。其中後者可能是主要原因：

1：「基因諮詢師」這個行業在中國剛剛出現，公司很難找到有資質的人。

2：國內基因測序公司還在群雄混戰階段，老總們都在專心搶市場，後臺基因諮詢師不受重視，收入也不高，有這功夫，還不如去開滴滴呢。

因此，基因測序後的諮詢，現在是市場上很大的缺口。但我認為同時也是很好的機會。有需求就有市場，最開始做好諮詢客服的測序公司很可能積攢良好口碑，佔領先機，成為測序界的「海底撈」。不做測序，而專注做專業基因諮詢，也許有機會佔領後期市場，並衍生出新產品，甚至垂直逆向整合。另外，對很多生物專業同學來說，也是一個值得關注的就業領域。

21世紀什麼最貴？人才！

所以，請珍惜你身邊每一位學生物的同學吧！（生物谷Bioon.com）

參考文獻：

1： TP53 mutations in human cancers： origins， consequences， and clinical use.Cold Spring Harb Perspect Biol. 2010 Jan；2(1)：a001008.

2：Role of a p53 polymorphism in the development of human papillomavirus-associated cancer.Nature. 1998 May 21；393(6682)：229-34.

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