如果認為緣起是實有的邏輯，其實是自相矛盾的。為什麼自相矛盾呢？
《緣起贊》中云：「自性無作待，緣起有待作，何能於一事，二無違和順。」
自性是無造作，不需要觀待任何事物的。假如有觀待，就不是自性。
比如，液體的本質是天然的，與氣體、固體都不一樣，它是實實在在存在於我們的生活當中的，例如水、牛奶等。如果本來不是液體，卻人為地把它變為液體，那就不是它的本性，就是相對和觀待的。再比如，鐵、銅的本質不是液體，但在高溫下，卻可以變成液體。換言之，鐵和銅的液體，要觀待於高溫。如果沒有高溫，就只會是固體，所以說，鐵、銅的本質是固體而並非液體。凡是要觀待而成立的東西，都不是它的本質。
在世俗諦當中，所有物質都有自己的本質。當然從空性的角度來講，所有的物質都沒有本質、都是空性。如果萬事萬物真的有本質，那就不應該依賴任何東西而存在。比如說，如果稻芽有自性、有本質，那就應該先天是稻芽，永遠都是稻芽，而且永遠都不能消失。因為只有這樣，才能證明是有自性、實有的。但稻芽真的是這樣的嗎？不然！稻芽只是在各種因緣聚合的時候，才產生了。在其發展的過程當中，稻芽又會變成其它物質。這充分說明，勝義諦的稻芽，是沒有本質的。
緣起是有觀待的，任何有因有緣的東西，都必須依賴於條件。比如說，稻芽就是有作的，它必須依賴於因緣。如果稻種、土壤、溼度、溫度、空間、時間都沒有，稻芽也不會產生。稻芽，就是由溼度、空間、時間等因緣造作的，所以它是有待的。
如果一切物質或緣起是真實有自性的，那就應該是無作無待的。但緣起卻是有待有作的，這是我們大家公認的。怎麼可能有自性與緣起可以在一個事物上面無二無違呢？這個觀點絕對是錯誤的。
「故說緣起法，雖自性本離，然似彼顯現，此皆如幻事。」
雖然緣起法的自性本來就不存在，並不是以前存在，現在在某種情況下變成了不存在。但在沒有證悟空性之前，這些現象卻都是存在的。自性本離與顯現，是物質的兩個側面，二者的結合，就叫做緣起性空。但所有的這一切顯現，都是如夢如幻的幻覺、錯覺。
慧能大師講的「菩提本無樹」，就是「自性本離」的意思。大圓滿徹卻中講的「本淨」，也即本來清淨。並不是原本有一個不清淨的東西，然後通過我們的修行，把它轉化為清淨。而是因為沒有自性，所以本來清淨。
慧能大師雖然還沒有講大圓滿，但已經把空性講得很透徹了。
有些時候，我們也會從表面現象的角度，而使用「轉化為」這個詞。比如，意識轉化為智慧，阿賴耶識轉化為佛的智慧等等。但實際上並不是轉化，而是本身就如此。
如果有一天我們加行修好了，在對上師、佛法非常有信心的前提下，就有可能會證悟到自性本離。那時我們就會發現，心的本性永遠沒有離開過本性，只是我們自己沒有發現而已。
自性本離，是緣起法的第二層意思，也是比較深奧的緣起法。除了緣起以外，沒有別的事物；除了空性以外，沒有別的事物。緣起就是空性，空性就是緣起。《般若十萬頌》這麼龐大的佛經所講的，就是自性本離。如果證悟通達了，所有問題也都解決了，因為所有問題的源頭，都歸結於無明。而這四個字，正好是無明的剋星。
《緣起經》、《稻杆經》當中所講的緣起，絕大多數停留在第一個層面上。也就是說，這個世界以及萬事萬物都有自己產生的因素，當生存的因素消失的時候，世界也會隨之而消失。包括我們內在的精神，都是隨因緣而變化的。在變化的過程中，因不會去想要產生什麼樣的果，果也沒有想過要從什麼樣的因產生，這都是世界的自然規律。
從這個角度來講，如果達爾文的生物進化論真的合理，也與佛教不會有衝突，佛教可以用緣起來解釋生物進化論。雖然到現在為止，都沒有一個確切的結論，來證實生物進化論到底是否合理，但目前這種觀點畢竟已經被絕大多數的科學家接受了。
按照進化論的觀點，首先是海洋裡的一些物質慢慢變成了海洋生物，然後變成陸地生物，最後變成了人。但這只能解釋人的肉體部分的來歷，人的靈魂是怎麼出來的？到現在誰也無法解釋。其實，這都是因為緣起。
二十一世紀，是物慾橫流的時代。現代人的煩惱，是整個人類歷史上最重的。雖然我們擁有豐富的知識與物質財富，但我們的需求卻沒有減少。
比如，按理說，有了電腦，工作效率可以大大提高，人們可以閒下來了，但實際並非如此。有了這些東西以後，大家反而變得更加忙碌了。在有了飛機、汽車、高科技的通訊產品等等之後，我們不但不知足，反而需求更厲害了。我們知道的越多，擁有的越多，煩惱、痛苦、邪見也越多，所以這個時代的人更需要修前行。如果不修出離心、菩提心，而去學中觀、禪宗、大圓滿、大手印等等，都是沒有用的，只能播下解脫的種子。很多佛經都是聞解脫，但實際上很多人聽了並沒有解脫。為什麼？就是基礎沒有打好。在《普賢上師言教》以及《前行備忘錄》中，記載了很多反覆修加行的前輩大德，他們的欲望和邪見沒有我們嚴重，都需要反覆修加行，我們就更不要說了。
往期回顧
緣起，是引導進入空性的極佳門徑
佛教最核心、最珍貴的精華：緣起性空獅子吼聲
任何事物都離不開緣起與空性
凡是有因有緣而產生的東西都是假的
為什麼密宗分九乘次第呢？