在中國咖啡產業迅速增長、都市消費者嘗試變換各種口味的咖啡之時，一項研究結果表明，在全球已知的124種野生咖啡樹中，大約有60%面臨滅絕風險。長期看，全球咖啡產量將受到威脅。
英國基尤（Kew）皇家植物園周三（1月16日）發表於《科學》雜誌子刊《科學進展》上的這項研究顯示，約有75種野生咖啡樹正面臨滅絕風險，35種目前沒有受到威脅，其餘14種資料不足，無法作出判斷。
研究人員表示，平均所有植物來看，大約有20%的植物面臨滅絕的風險，因此咖啡中60%的超高比例「令人擔憂」。此外，28%的野生咖啡品種並不在保護區內生長，只有大約一半的野生咖啡品種保存在種子庫中。目前對野生咖啡的保護措施「不夠充分」。
咖啡愛好者們喝到的成百上千種咖啡主要只來自於兩種咖啡豆——阿拉比亞咖啡和羅布斯塔咖啡。其餘大多數野生咖啡品種並不好喝，但它們的一些基因表現更好，比如會更耐寒。通過雜交，野生咖啡品種含有的基因有助於其他咖啡在將來遇到氣候變化和疾病襲擊時生存下來。
因此，研究人員認為，保護野生咖啡品種的基因庫就可以保護全球咖啡作物的未來，也是維持全球咖啡產業健康發展的關鍵。否則，如果咖啡產量受到威脅，消費者買到的咖啡豆可能會更貴，也更難喝。
基尤皇家植物園的咖啡研究主管戴維斯（Aaron Davis）解釋說：「如果不是因為野生物種，我們今天就不會有那麼多咖啡喝了。回顧一下咖啡種植的歷史，我們就會發現，我們常常用野生品種來維持咖啡種植的可持續性……我們將一次又一次地調用這些野生資源。」
戴維斯對CNN說，咖啡生長在比較特殊的自然棲息地，因此，氣候變化帶來的溫度上升和降雨量增加可能會使咖啡無法在這些曾經的棲息地生長。戴維斯說：「考慮到人類入侵和砍伐森林的威脅，一些（咖啡品種）可能會在10到20年內滅絕，特別是在氣候變化的額外影響下。」
另一項發表於生態學期刊《全球變化生物學》上的研究發現，如果考慮到未來的氣候變化預測，野生阿拉比卡咖啡——即人們常喝的阿拉比卡咖啡豆的野生近親——在世界自然保護聯盟瀕危物種紅色名錄標準下也可以被歸類為受威脅的咖啡品種。
阿拉比卡咖啡原產於衣索比亞，主要生長於較高地區的熱帶雨林中。咖啡研究所數據顯示，它們全年需要15至24攝氏度的生長環境，太冷會受凍；太熱的話，咖啡質量就會下降。
而這項研究指出，到2088年，氣候變化這一項因素就可能令野生阿拉比卡咖啡的數量減少50%。因為氣溫升高，適宜阿拉比卡咖啡生長的環境範圍就會縮小。
彭博新聞社報導指出，在接下來的幾十年裡，咖啡種植者可能不得不轉向適應能力更強的羅布斯塔咖啡。這種咖啡豆的咖啡因含量遠超阿拉比卡咖啡豆，味道強烈。
基尤自然保護部高級研究負責人盧格達（Eimear NIC Lughadha）說：「一些接受評估的咖啡品種已經100多年沒有在野外被發現了，有些可能已經滅絕了。我們希望這些新數據能凸顯咖啡行業可持續發展中需要優先考慮的品種，以便採取適當的行動來保護它們的未來。」
荷蘭銀行高級部門經濟學家伯格林（Casper Burgering）表示，只要農民有能力投資新技術，就有可能在某種程度上減輕風險。但風險不可能完全得到緩解，這將對未來咖啡的供應產生影響。